Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,665,674 |
T→C |
*275* (TAA→TAG) |
gadX ← |
acid resistance transcriptional activator GadX |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,665,674 | 0 | T | C | 99.8%
| 1416.3
/ NA
| 408 | *275* (TAA→TAG) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (292/115); minor base A (0/1); total (292/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 408 total aligned reads displayed.
AGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATAATAA > NZ_CP025268/3665537‑3665809
|
aGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta < 1:1107440/140‑1 (MQ=255)
aGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGATTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta < 1:3744560/140‑1 (MQ=255)
aGTTATATTGAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta < 1:11211388/140‑1 (MQ=255)
gTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCtat < 2:3219752/140‑1 (MQ=255)
atatTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAAt < 1:404129/140‑1 (MQ=255)
atatTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAAt > 2:337406/1‑140 (MQ=255)
aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAATACTCTATAATCTTAttccttc > 2:8446584/1‑140 (MQ=255)
aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAAt > 1:1177698/1‑129 (MQ=255)
aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttc > 1:9019827/1‑140 (MQ=255)
aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttc > 2:2379155/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa < 1:9342039/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 1:3606183/1‑140 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt < 1:2457065/140‑1 (MQ=255)
gtgtCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAg < 1:9934726/137‑1 (MQ=255)
gTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAg > 1:2633429/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTg > 1:1045449/1‑140 (MQ=255)
cccGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGcc < 2:223599/140‑1 (MQ=255)
cccGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCGTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGcc > 2:8049777/1‑140 (MQ=255)
gCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTaaa > 1:9254608/1‑140 (MQ=255)
cAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTaaaaa < 2:5830824/140‑1 (MQ=255)
gAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATACCAtt > 2:5201336/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 2:9362737/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 1:6647439/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 2:367649/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg < 2:4199852/140‑1 (MQ=255)
tgtTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTTAGTAAAACTCGATAATCTTATTCATTCCGCAGAACGGACAGTGCCGTAAAAATTCCCTTgcg > 1:3186789/1‑140 (MQ=255)
gtTATAACGGTTTATGAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTgcgc < 2:9711276/140‑1 (MQ=255)
ttATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGca > 2:2001476/1‑140 (MQ=255)
ataACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaac > 2:4694394/1‑140 (MQ=255)
ataACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaac > 2:5649380/1‑140 (MQ=255)
ataACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaac > 2:11105512/1‑140 (MQ=255)
gtggattaGTGGGGAGACGGCAGACTCTCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTGTTATGTCTGAGTAAATCTCTATAAGCGTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAGAAATTCCCTTGCGCAACATTACt > 2:3836958/5‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:1788644/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTGATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 2:2813564/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCATCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATATTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAAATCCCTTGCGCAACAATACt > 2:10460933/1‑140 (MQ=255)
ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATGTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATCCTTg > 2:7105871/1‑140 (MQ=255)
ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTg > 1:10722499/1‑140 (MQ=255)
tattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCa > 2:87722/1‑96 (MQ=255)
tattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCa < 1:87722/96‑1 (MQ=255)
tattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTGTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTgc > 1:1563346/1‑140 (MQ=255)
tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 2:7858824/1‑140 (MQ=255)
tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 1:4739087/1‑140 (MQ=255)
gagaCGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCa < 1:3306218/140‑1 (MQ=255)
gagaCGGCAGACTATCCTCTACCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCa < 1:10574524/140‑1 (MQ=255)
gaCGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGGCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACg < 1:6887114/140‑1 (MQ=255)
ggCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGtt > 2:1225363/1‑140 (MQ=255)
ggCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGtt > 1:3551536/1‑140 (MQ=255)
ggCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACACTCTAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGACAGTGCCGTAAAAATTCCATTTCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGtt > 2:8179300/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGACGCCGAGTCACGGTTc > 2:3507433/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCACTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAACAATTCCCTTGCGACACACTCCTTGCCGCCGAGTCACGGTTc > 2:11227685/1‑140 (MQ=255)
cAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCg > 1:6096319/1‑140 (MQ=255)
gACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGAc < 2:7611648/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAATCTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAAtctc > 1:910024/1‑140 (MQ=255)
tctTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTg > 1:4457455/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcg > 2:2545324/1‑140 (MQ=255)
tCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAACCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcgc > 2:4559218/1‑140 (MQ=255)
cccGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACGCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAAGGTCAGTGCCGTACAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGcc > 2:1539968/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCg > 2:5505172/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCg > 2:955597/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTACCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCg > 2:10178992/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAATATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 2:10883043/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 2:793646/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 1:7360892/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 1:4146247/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 1:5259450/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt < 2:6077703/140‑1 (MQ=255)
gTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATc < 1:2882377/140‑1 (MQ=255)
gTCCCCGATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTACAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAACAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATc < 1:6337448/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACACTACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:8396130/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:3833564/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:2112821/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 2:8842354/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 2:9008560/140‑1 (MQ=255)
cccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCt > 2:4372109/1‑140 (MQ=255)
ccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTc > 2:6364082/1‑140 (MQ=255)
ccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTc > 1:1293973/1‑140 (MQ=255)
ccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTc > 2:9216760/1‑140 (MQ=255)
tATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCt > 1:10125549/1‑140 (MQ=255)
tATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCt > 1:773482/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTCTAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTg > 1:5838083/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCATTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTg > 2:364642/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGa < 1:1067608/140‑1 (MQ=255)
gCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGAt < 1:9432893/140‑1 (MQ=255)
ccGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATa < 2:416415/140‑1 (MQ=255)
ccGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATa < 2:6688313/140‑1 (MQ=255)
cGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATAc > 2:4905216/1‑140 (MQ=255)
ggTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATActc > 1:5124320/1‑140 (MQ=255)
ggTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATActc > 1:7405976/1‑140 (MQ=255)
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TTCCAGTAAAAGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATAATAATTTCGAAAGACGTAA > NZ_CP025268/3665527‑3665824
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |