Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
344,042 |
A→G |
*272* (TAA→TAG) |
CXP41_RS01800 → |
protein YahL |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 344,042 | 0 | A | G | 99.6%
| 905.3
/ NA
| 270 | *272* (TAA→TAG) | CXP41_RS01800 | protein YahL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (188/81); total (189/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ATTGCTCTCTGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAATTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGC > NZ_CP025268/343907‑344177
|
tGCTCTCTGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGa > 2:4006497/1‑140 (MQ=255)
gCTCTCTGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGaa < 1:417478/140‑1 (MQ=255)
gCTCTCTGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGaa < 1:660130/140‑1 (MQ=255)
ctctGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAgg > 1:4513874/1‑140 (MQ=255)
tctGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAggg > 1:5156643/1‑140 (MQ=255)
ctGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCACGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGt < 2:1038555/140‑1 (MQ=255)
tGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATGCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAggggt > 2:1602444/1‑138 (MQ=255)
tGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGtt > 2:834519/1‑140 (MQ=255)
ttCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTcc > 2:1889383/1‑140 (MQ=255)
tCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATACGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTCGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACCTTAACATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTccc < 2:4546263/140‑2 (MQ=255)
cGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCa < 1:2180182/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCaa > 2:2492955/1‑140 (MQ=255)
aaaaaCATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAgt > 1:1455101/1‑140 (MQ=255)
aaaaaCATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAgt > 1:17770/1‑140 (MQ=255)
aaaaaCATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAgt > 1:61424/1‑140 (MQ=255)
aaCATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAgttgt < 1:1826806/140‑1 (MQ=255)
taaagagATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTAtt < 2:1301767/137‑1 (MQ=255)
tACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTAtt < 1:3196121/140‑1 (MQ=255)
aCAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTc > 1:3960760/1‑140 (MQ=255)
aCAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTc > 2:1591959/1‑140 (MQ=255)
agaTGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCAcc > 1:3801569/1‑140 (MQ=255)
tgatgCGGGATTAAGTGAATGGTTTTCTAATAGAGTGAAGGAATTAGGTGATAGATACTATCGTGTAAATGAGCACTTTAAATTCCGGTACACTCTTTAGTTCATAAAGGAGTCCACCTGCAAGTTGTTATTACATCtca > 2:2316855/1‑138 (MQ=255)
cgcgATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTg > 1:1229936/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTg < 1:4666719/140‑1 (MQ=255)
cgcgATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTg < 1:2945063/140‑1 (MQ=255)
cgATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGaa > 1:4333530/1‑140 (MQ=255)
gATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAAt < 1:1230451/140‑1 (MQ=255)
ttAAATGACTGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCg < 1:3438944/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCa < 2:3505997/140‑1 (MQ=255)
aatgaatgGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCaa < 1:2911394/140‑1 (MQ=255)
ggATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGt > 1:4596144/1‑140 (MQ=255)
cTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCAt < 2:218094/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTCATCATTTc < 2:3675577/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTc < 1:1068034/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTc < 1:4073360/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTc < 1:334596/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTc < 1:4073197/140‑1 (MQ=255)
tAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCa > 1:5080106/1‑140 (MQ=255)
agagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCat < 1:4007466/140‑1 (MQ=255)
agagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCat < 2:4959203/140‑1 (MQ=255)
agagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCat < 1:3251116/140‑1 (MQ=255)
agagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCat < 2:2011275/140‑1 (MQ=255)
agagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCat < 2:3872165/140‑1 (MQ=255)
gagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatc > 1:4839804/1‑140 (MQ=255)
gagTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatc > 1:829863/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAACTCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAGTGCAGGTAATCATTTCatctgt > 2:4086364/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGaa > 2:3999355/1‑72 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCAt > 1:2854094/1‑131 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCAt < 2:2854094/131‑1 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCAt > 1:1203942/1‑131 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTc > 2:1408794/1‑134 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 2:1807025/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 2:2421205/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:1558068/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 2:4194520/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 2:1723986/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:1892003/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 2:1354002/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:1925270/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:3658101/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:716148/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:2493253/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgt > 1:3204298/1‑140 (MQ=255)
gCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgta < 2:293908/140‑1 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAACATACGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCCCCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat < 1:3068732/140‑1 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGGAAGGTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat > 1:3702793/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat > 2:4808603/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat > 2:1440230/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat > 2:5114547/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat > 1:1404169/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtat > 1:2787949/1‑140 (MQ=255)
gAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtatatc < 2:468218/140‑1 (MQ=255)
gAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtatatc < 2:3262049/140‑1 (MQ=255)
aTTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtatatctg > 1:4354852/1‑140 (MQ=255)
aGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTAtt > 1:1655664/1‑87 (MQ=255)
aGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtatatctgtat > 1:2672867/1‑140 (MQ=255)
aGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCatctgtatatctgtat > 2:4140429/1‑140 (MQ=255)
aGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTACat > 1:118629/1‑126 (MQ=255)
aGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTACat < 2:118629/126‑1 (MQ=255)
aCAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCaa > 1:3016426/1‑140 (MQ=255)
cAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCa < 2:4895952/71‑1 (MQ=255)
cAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCa > 1:4895952/1‑71 (MQ=255)
cAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAAc > 2:1222652/1‑140 (MQ=255)
tCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTcc > 1:2420161/1‑140 (MQ=255)
tCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTAGGCCAACTGGCATTcc > 1:179978/1‑140 (MQ=255)
gTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCAtct > 1:1253960/1‑140 (MQ=255)
tAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCTACCTGAGACTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCAtctc > 2:4595998/1‑140 (MQ=255)
tAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCAt < 2:747863/101‑1 (MQ=255)
tAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCAt > 1:747863/1‑101 (MQ=255)
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GTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCGGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTGGCC > SRR14920191.2761619/1‑151 (MQ=60)
CGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTT > SRR14920191.5063327/1‑151 (MQ=60)
CGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTT > SRR14920191.3594662/1‑151 (MQ=60)
CGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTT > SRR14920191.1238982/1‑151 (MQ=60)
CGTTAAAATCCGCTACACTCTTCAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTT > SRR14920191.1197573/1‑151 (MQ=60)
GTTAAAATCCGCTGCACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTG < SRR14920191.4592436/151‑1 (MQ=60)
GTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTTTTG > SRR14920191.4256868/1‑151 (MQ=60)
GTTAAAATCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTG > SRR14920191.2220430/1‑151 (MQ=60)
ATTCCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATAGCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATC < SRR14920191.129316/151‑1 (MQ=60)
CCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGC > SRR14920191.3242918/1‑151 (MQ=60)
CCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGC > SRR14920191.605747/1‑151 (MQ=60)
CCGCTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGC > SRR14920191.3242917/1‑151 (MQ=60)
CTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgatcag > SRR14920191.3507553/1‑110 (MQ=60)
CTACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGAC > SRR14920191.3919547/1‑151 (MQ=60)
ACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACAC > SRR14920191.1413180/1‑151 (MQ=60)
ACACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACAC > SRR14920191.4829051/1‑151 (MQ=60)
CACTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACT > SRR14920191.346517/1‑151 (MQ=60)
CTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTC > SRR14920191.2412270/1‑151 (MQ=60)
CTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTC > SRR14920191.2614621/1‑151 (MQ=60)
CTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTC > SRR14920191.2807281/1‑151 (MQ=60)
CTCTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTC > SRR14920191.2847379/1‑151 (MQ=60)
CTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgatcagtatctcgtatgccgtcttctgcttgaa > SRR14920191.732737/1‑83 (MQ=60)
CTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTCGC > SRR14920191.626281/1‑151 (MQ=60)
CTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTCGC > SRR14920191.83317/1‑151 (MQ=60)
CTTTAGTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTGTGTTGTGATCGGCGACACTTCGC > SRR14920191.83360/1‑151 (MQ=60)
GTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGCCACTTCGCTTAAA > SRR14920191.4076273/1‑151 (MQ=60)
GTTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTCGCTTAAA > SRR14920191.4759889/1‑151 (MQ=60)
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ACTGGTGATGTTATTGCTCTCTGTTCTGGACGTAAAAACATACAGAGATGATGCGCGATTAAATGAATGGATATCTAATAGAGTGCAGGAATTAGGTGACAGATATTATCCTGTAAATAAGCACGTTAAAATCCGCTACACTCTTTAATTCAGAAAGGGTTCCACCTGCAAGTTGTTATTCCACCTGAGAGTGAATCGCAATGCAGGTAATCATTTCATCTGTATATCTGTATGCCAACTGGCATTCCATCTCTTTTTTCGCCGATATTTTGTTGTGATCGGCGACACTTCGCTTAAA > NZ_CP025268/343895‑344192
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |