Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
521,513 |
C→T |
A683V (GCG→GTG) |
ybbP → |
ABC transporter permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 521,513 | 0 | C | T | 99.2%
| 920.6
/ NA
| 252 | A683V (GCG→GTG) | ybbP | ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (99/151); minor base A (0/2); total (99/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.21e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
CAGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTG > NZ_CP025268/521376‑521649
|
aGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAt < 1:2659519/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAt < 2:2128775/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCAGCTGGGAGAATCGCAACGGACTGTTGACACAACTCAACCGCAAGTTCCCGACCATGAGCCTGTTCGATATTGGCGCTATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAt < 2:4589687/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 1:3488875/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 1:2303671/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 2:1587125/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 2:4264723/140‑1 (MQ=255)
tttACGGTGGGAGAATGGAAACGGCATGTTGACACAACTCAAACGACAGTTCCCGACCATTAGCCTGTGAGGTATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGGGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGAtgg < 2:856210/140‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggt > 2:2158565/1‑140 (MQ=255)
ttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggt > 2:1529181/1‑140 (MQ=255)
tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCCTGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggtg < 2:1916033/140‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTGAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggtg > 1:4650927/1‑140 (MQ=255)
tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggtg < 1:1421374/140‑1 (MQ=255)
cTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTAc < 1:5162754/140‑1 (MQ=255)
agaATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTCGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACCGGTc < 2:4800791/140‑1 (MQ=255)
tGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttg < 1:1955919/140‑1 (MQ=255)
acacAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgct < 2:495918/140‑1 (MQ=255)
acacAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgct < 1:888647/140‑1 (MQ=255)
cacaACTCAACCGCCAGTTCCCGACCCTTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgctg > 1:2021422/1‑140 (MQ=255)
caACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgctgtt < 1:154668/140‑1 (MQ=255)
caCTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgctgttg > 2:5083649/2‑140 (MQ=255)
ataaaCCGACAGGTTCGGACCATTAGACTGTTACATAGTGGCGCGATTATAAAAGAAGTCGGTCAGGTGCTGGAGGAGGTAAGGCGGGCGCTGGAAGAGATGGTGGTACTGGTCACAGCCCGCGGTATgttgatgttgct < 2:3687665/137‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 2:3366492/140‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 2:2208720/140‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 2:560244/140‑1 (MQ=255)
ccGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGcac < 2:5184889/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGcaca < 2:1397346/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcagg > 1:1853538/1‑140 (MQ=255)
cAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCTGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggt < 1:3797822/140‑1 (MQ=255)
aGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 1:4855972/140‑1 (MQ=255)
aGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 2:2211279/140‑1 (MQ=255)
aGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 1:231417/140‑1 (MQ=255)
aGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg > 1:734319/1‑140 (MQ=255)
cgaTTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGCAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGGCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGa < 1:211049/138‑1 (MQ=255)
ccATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGa < 2:4637406/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGTTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGAGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGTAATg > 1:3074838/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATg > 1:2623326/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATg > 1:2003027/1‑140 (MQ=255)
aGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcg < 2:3565104/140‑1 (MQ=255)
gCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgt > 2:2072338/1‑140 (MQ=255)
cTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtca < 1:1528788/140‑1 (MQ=255)
gTTAGATATTGGCGCGATTTTAAGACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCCCCGCCTGCTGTATGTTGGTGTTGCTGGCACTGGTGCAGCTGGGAAGtcgtcagc < 2:2729681/140‑1 (MQ=255)
gTTAGACATTGTCCCGATTTTAAAACGGGTCAGTCAGGTGCTGGAGCAGCTAAGTCGGGCGCTGGAACAGATGGTGCTACTGGTCCCCGCCTCCGGTATGTTGCAGCTGCTGGCACAGCTGCAGGTGGGAATgcgtcagc < 2:2851213/140‑1 (MQ=255)
ttggATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg < 2:711768/137‑1 (MQ=255)
ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg > 2:4136166/1‑140 (MQ=255)
ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg > 1:3379498/1‑140 (MQ=255)
ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg > 2:341363/1‑140 (MQ=255)
ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGCTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCCCCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg < 2:5098560/140‑1 (MQ=255)
atTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCCCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTACTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGtcatca > 2:3101696/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGGGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAgg > 2:373285/1‑140 (MQ=255)
gggcgATTCTAAAACAGGTCGGTCAGGTCCTGGGGCCGGCAAGGCGGGCGCTGGCGGTGTTGGTGGGACTGGTCACCGCCTGCATGTTGTTGCTGTTGCTGCCACAGGTGGCGGGGGGAAAGGTTCAGCGTCAGCAggtg > 2:2939810/3‑138 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 2:3291473/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 1:1737855/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 1:588438/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 1:370262/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 1:3053434/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 1:1015465/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 2:2725547/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGc < 1:2556253/140‑1 (MQ=255)
gATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCtgg < 2:3987697/140‑1 (MQ=255)
ttAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTggtggt < 2:3830001/140‑1 (MQ=255)
ttAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTggtggt < 1:3593312/140‑1 (MQ=255)
ttAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTCGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTggtggt < 2:2852893/140‑1 (MQ=255)
tAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg < 1:341363/140‑1 (MQ=255)
tAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg < 1:2470212/140‑1 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 2:3591914/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:50678/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:2435529/1‑140 (MQ=255)
gtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGcac > 2:2341062/1‑140 (MQ=255)
ggttAGGTGCTGGAGCCGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCTCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGGAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACCCt < 2:4467845/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 1:2490994/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 1:3156678/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 1:3325127/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 1:2072338/140‑1 (MQ=255)
tcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCg > 1:3209573/1‑140 (MQ=255)
gCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCgg < 2:4914998/140‑1 (MQ=255)
cTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCggg < 2:1134556/140‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGa > 2:4409841/1‑140 (MQ=255)
ggAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGa > 1:4370099/1‑140 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgc > 2:1941287/1‑79 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGGACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGGGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaa > 2:1997/1‑140 (MQ=255)
aGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaaaaaa > 2:1016879/1‑140 (MQ=255)
aGGTAAGTCGGGCCCTGGAAGTGATGGTGGTATTGTTCACCGCCCGCGGTATGCGGCTGTTGCTGTAACAGGTGCAGGTGGAAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaaaaaa < 2:2548734/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 1:1031707/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 1:414814/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 1:2380170/1‑140 (MQ=255)
gTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACGCGGTGCGGGGAAAAAAct > 1:2670084/1‑140 (MQ=255)
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TAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACT < SRR14920191.342361/151‑1 (MQ=60)
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AAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT < SRR14920191.4764519/151‑1 (MQ=60)
AAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTCGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT < SRR14920191.5146897/151‑1 (MQ=60)
AGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGActgtctcttatacacatctccgagcccacgagacc > SRR14920191.4973126/1‑116 (MQ=60)
GTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCGGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTTCG > SRR14920191.2619781/1‑151 (MQ=60)
TGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTTCGC > SRR14920191.722727/1‑151 (MQ=60)
TGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTTCGC > SRR14920191.76606/1‑151 (MQ=60)
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GAGCTGGCTTACCAGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTTCGC > NZ_CP025268/521364‑521663
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
