Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,161,210 |
A→G |
*270* (TAA→TAG) |
pabC → |
aminodeoxychorismate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,161,210 | 0 | A | G | 100.0%
| 839.8
/ NA
| 251 | *270* (TAA→TAG) | pabC | aminodeoxychorismate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (135/116); total (135/116) |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
AGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161074‑1161344
|
gTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTATGCTTTTCGTCAGGAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGACTTAGTCAt > 2:2256926/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 2:907169/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:2985579/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:3895370/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:4021327/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:2076948/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 2:4239209/1‑140 (MQ=255)
tGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaa < 2:2991589/140‑1 (MQ=255)
caggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaaaa < 1:3857372/140‑1 (MQ=255)
caggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTAGGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaaaa < 1:2123032/140‑1 (MQ=255)
gcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAgtg < 1:3793097/140‑1 (MQ=255)
gcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAgtg < 1:3435638/140‑1 (MQ=255)
gcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTGATAGGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTAATGAACAAAgtg > 2:5898/1‑140 (MQ=255)
agatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGa < 2:1933986/140‑1 (MQ=255)
agatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGa < 1:267211/140‑1 (MQ=255)
agatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGa < 1:2754599/140‑1 (MQ=255)
gatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGAt < 2:235145/140‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAAt < 2:3503951/140‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAAt > 2:1363585/1‑140 (MQ=255)
ttATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCt < 2:5205330/140‑1 (MQ=255)
tATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCtt > 2:1850297/1‑140 (MQ=255)
tATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCtt > 1:1934109/1‑140 (MQ=255)
tttGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGt < 1:1830052/140‑1 (MQ=255)
tGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTa < 2:4909627/140‑1 (MQ=255)
tGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTa < 2:1414914/140‑1 (MQ=255)
tAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 2:4364546/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGGGCCTGTGGCGATGTCTCCTTGTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTAGTGATAATCTTGTTATTGc < 1:1205218/140‑1 (MQ=255)
tGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCGGCTACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAATAAGTTGTTATTGATATTCTTGTTATTTCt > 2:664274/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCt > 2:1262209/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCt > 1:2397115/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGGTGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:5048395/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAATAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 2:2756160/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt > 1:2572833/1‑135 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 2:2572833/135‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:1056305/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 2:3037584/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 2:3691712/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:3261804/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg > 2:823680/1‑140 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg < 1:1443277/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg > 1:2314460/1‑140 (MQ=255)
tAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTTATAATCTTGTTATTGCtggtgg > 2:1055355/1‑140 (MQ=255)
aTGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTa > 1:3757661/1‑140 (MQ=255)
aTGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTa < 2:3150717/140‑1 (MQ=255)
gCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCATCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACt < 1:7610/140‑1 (MQ=255)
aGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTggg > 2:2244832/1‑140 (MQ=255)
gTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGt > 2:5141341/1‑140 (MQ=255)
tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCGCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTa > 1:4140395/1‑140 (MQ=255)
gATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTAt < 2:2917036/140‑1 (MQ=255)
cccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCGTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgcc > 2:4961457/1‑140 (MQ=255)
ccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgccg < 1:1107420/140‑1 (MQ=255)
aTGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTgg > 2:4638212/1‑140 (MQ=255)
gCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg < 1:4485952/140‑1 (MQ=255)
gCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg < 2:537678/140‑1 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 1:3243040/1‑140 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 1:1258025/1‑140 (MQ=255)
cTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg < 2:282639/140‑1 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCGCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTGGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 2:4839998/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 1:2513791/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 2:2542724/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa < 2:3006919/140‑1 (MQ=255)
aTGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa < 1:2614600/140‑1 (MQ=255)
aTGTCTCCGTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTTGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTTTTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa < 2:2173057/140‑1 (MQ=255)
gTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAg > 1:4774943/1‑140 (MQ=255)
gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGcc > 2:2052402/1‑140 (MQ=255)
atcGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTTTTGATTATCTTGTTAGTGCTGGTCGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGa < 2:4780456/138‑1 (MQ=255)
aaCGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGa < 2:750221/140‑1 (MQ=255)
tataTGAATATTTAGCCCCACGTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCa < 2:3842628/140‑1 (MQ=255)
tatGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGGGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACGGCaaa > 1:2995165/1‑140 (MQ=255)
tGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAAtt > 1:3207035/1‑140 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCt < 2:5026625/140‑1 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCt > 2:4617974/1‑140 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGTTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCtt > 2:2938240/1‑140 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATGGCtt > 1:793117/1‑140 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGGGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCtt > 1:3285822/1‑140 (MQ=255)
tAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAATAGGGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCACAGCTGGTCTGGGCGTCTGGTAGGTTCGCCATCTTGCTGACATCAAATTGCTTATCa > 2:2155586/1‑140 (MQ=255)
tAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCa < 1:1575623/140‑1 (MQ=255)
tAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCa > 1:392406/1‑140 (MQ=255)
gCCCCACTTTGTGAGCGCTCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCaaa < 2:3702614/140‑1 (MQ=255)
cccACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAaaga < 2:3487475/140‑1 (MQ=255)
ccACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAaagaa < 2:3895370/140‑1 (MQ=255)
aCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAagaaga > 2:2363727/1‑140 (MQ=255)
aCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAagaaga > 2:5087227/1‑140 (MQ=255)
aCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAagaaga > 1:3356674/1‑140 (MQ=255)
aCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGAAAATCCTGCTATTGCTGGTGGAACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGCAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATCGCTTATCAAagaaga > 2:1223441/1‑140 (MQ=255)
cTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAagag > 1:4988140/1‑140 (MQ=255)
tttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAgaga < 2:1570408/140‑1 (MQ=255)
ttGTGATCGCCCGAATTAGTCATTAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 2:675680/140‑1 (MQ=255)
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GCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAA < SRR14920191.4498983/151‑1 (MQ=60)
CCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAG > SRR14920191.4788991/1‑151 (MQ=60)
TGTGGCGATGTCTCCTTTTCCTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGT < SRR14920191.2979314/151‑1 (MQ=60)
TGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTC < SRR14920191.1594328/151‑1 (MQ=60)
GATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCA > SRR14920191.4421034/1‑151 (MQ=60)
ATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCAT < SRR14920191.2620931/151‑1 (MQ=60)
ATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCAT < SRR14920191.2621561/151‑1 (MQ=60)
TGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATC < SRR14920191.2435937/151‑1 (MQ=60)
CTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTG > SRR14920191.2578715/1‑151 (MQ=60)
CTTTTCGTCCGCAACGTTATATGAATATTTATCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGTTAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTCGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCG < SRR14920191.4045850/151‑1 (MQ=60)
CAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGGGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACGGCAAA > SRR14920191.3003634/1‑151 (MQ=60)
GCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATT > SRR14920191.3216221/1‑151 (MQ=60)
CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTT > SRR14920191.2596206/1‑151 (MQ=60)
CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATGGCTT > SRR14920191.795364/1‑151 (MQ=60)
CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGGGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTT > SRR14920191.3295151/1‑151 (MQ=60)
CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGGGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTT > SRR14920191.4466870/1‑151 (MQ=60)
ATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCA > SRR14920191.393495/1‑151 (MQ=60)
ATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCA > SRR14920191.393530/1‑151 (MQ=60)
gatgtgtataagagacagCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAA < SRR14920191.290548/133‑1 (MQ=60)
TATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAA > SRR14920191.5083297/1‑151 (MQ=60)
AATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCAATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAA < SRR14920191.2995879/151‑1 (MQ=60)
ATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAG < SRR14920191.4807245/151‑1 (MQ=60)
ATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAG > SRR14920191.467460/1‑151 (MQ=60)
TATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGA > SRR14920191.3366155/1‑151 (MQ=60)
ATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAG > SRR14920191.3903111/1‑151 (MQ=60)
ATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAG > SRR14920191.685197/1‑151 (MQ=60)
ATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAG > SRR14920191.5002593/1‑151 (MQ=60)
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TAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACG < SRR14920191.1579877/151‑1 (MQ=60)
TAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACG > SRR14920191.2352310/1‑151 (MQ=60)
TAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTATGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCATATTGCATATCAAAGAAGAGACG > SRR14920191.2879184/1‑151 (MQ=60)
CCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAT < SRR14920191.2476623/151‑1 (MQ=60)
CTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAC > SRR14920191.4434059/1‑151 (MQ=60)
CTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAC > SRR14920191.2165513/1‑151 (MQ=60)
CTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAC > SRR14920191.621253/1‑151 (MQ=60)
TTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACC < SRR14920191.3369466/151‑1 (MQ=60)
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GCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGC > SRR14920191.3389546/1‑151 (MQ=60)
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CCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGGACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAGTTACCCTGAAGCCAG > SRR14920191.1859259/1‑151 (MQ=60)
AATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGAC < SRR14920191.576079/151‑1 (MQ=60)
AATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGAC < SRR14920191.2291749/151‑1 (MQ=60)
AGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGACCGGA < SRR14920191.4478458/151‑1 (MQ=60)
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AGCCTCTCTGGAAGAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGACCGGA > NZ_CP025268/1161060‑1161359
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
