Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,631,644 |
T→C |
I186V (ATT→GTT) |
dcp ← |
peptidyl‑dipeptidase Dcp |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,631,644 | 0 | T | C | 99.5%
| 727.1
/ NA
| 218 | I186V (ATT→GTT) | dcp | peptidyl‑dipeptidase Dcp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (110/106); minor base A (0/1); total (110/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
GCAAGCGCCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAATCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > NZ_CP025268/1631508‑1631776
|
ggtggtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTtg < 2:297833/140‑1 (MQ=255)
ggtggtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTtg < 2:3596668/140‑1 (MQ=255)
gtggtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTtgc < 2:4350826/140‑1 (MQ=255)
ggtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTtgctg > 2:3140437/1‑140 (MQ=255)
gtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGAATTATTtgctgc > 2:1759553/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAg > 2:4705247/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGt < 1:4019085/140‑1 (MQ=255)
gcagcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAAt > 1:2549976/1‑140 (MQ=255)
cagcGGAATCAGGCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATc > 2:5130553/1‑140 (MQ=255)
cagcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATc < 2:286444/140‑1 (MQ=255)
cagcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATc > 2:3354495/1‑140 (MQ=255)
cagcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATc > 2:1457066/1‑140 (MQ=255)
cagcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAAGCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATc > 2:2078724/1‑140 (MQ=255)
agcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCg < 2:3254654/140‑1 (MQ=255)
agcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCg < 1:337187/140‑1 (MQ=255)
gcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGc > 2:63151/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGTATTTATTTGCTGCCACTAATCGCt > 1:2812681/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 1:1230383/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 2:2299725/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 1:2826500/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 1:2421352/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 2:4865054/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGAGCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGACGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATCCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAAGCGCTGGTTAAActgg < 1:1899403/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCTCTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActgg < 2:1325618/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActgg < 1:1820018/140‑1 (MQ=255)
ctCCACACCTTCCTCGCGTGCCGCCTCCCGCGCCAGCGCTATCGCTCGCCCACTCCCTCCTGCCGGCTGGGCGTTACCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTCTTTGCTGCCAGTACTCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCa < 2:3643352/139‑1 (MQ=255)
aGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGt < 1:1647779/140‑1 (MQ=255)
aGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGt < 1:4643650/140‑1 (MQ=255)
aCCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATCTCGTTCACAACGAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCGGGTCAGGGGCg > 2:1813225/1‑140 (MQ=255)
aCCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCg > 1:917737/1‑140 (MQ=255)
ccgttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCGGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 1:1585530/137‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 2:3766691/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 1:2070856/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 2:2715273/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 2:1159999/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 1:2856693/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 2:4220067/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 2:4406167/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCGGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAGCCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTTGCAg < 2:4783883/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGGGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTTTTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 2:4588989/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 2:2603444/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 2:62828/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:1435104/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:4790758/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:4058138/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 2:451081/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:2012945/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATGTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 2:69444/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCCGCCGCCAGCGCAAGCTCTTGCTCCCTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:615682/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCCAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCCCTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:4470861/140‑1 (MQ=255)
ttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGc > 1:785166/1‑140 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGTTGGTCAGGGTCGCAGCt > 2:1476131/1‑140 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCt > 2:3400553/1‑140 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCt > 2:2370416/1‑140 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCt > 1:1194761/1‑140 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCt > 2:3995992/1‑140 (MQ=255)
cgcgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCt < 2:2829024/140‑1 (MQ=255)
cgcgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATAGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCt < 2:472482/140‑1 (MQ=255)
cgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGt > 1:3584674/1‑140 (MQ=255)
gAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTa < 2:1843327/140‑1 (MQ=255)
aGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTAt > 1:3222228/1‑140 (MQ=255)
cgccTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCa < 2:3962901/140‑1 (MQ=255)
cgccTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCa < 1:4908671/140‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAt < 2:2224959/140‑1 (MQ=255)
aGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAttt < 1:2162453/140‑1 (MQ=255)
aGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAttt > 1:5043640/1‑140 (MQ=255)
cgcAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAt > 2:3817170/1‑136 (MQ=255)
cgcAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAt < 1:3817170/136‑1 (MQ=255)
cgcAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTg < 2:1947200/140‑1 (MQ=255)
cgcAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTg > 1:1896793/1‑140 (MQ=255)
tGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGc > 1:1872185/1‑140 (MQ=255)
actcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTgcg > 1:2340277/1‑140 (MQ=255)
actcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTgcg > 2:330302/1‑140 (MQ=255)
actcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTgcg > 1:988766/1‑140 (MQ=255)
actcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTgcg > 1:474344/1‑140 (MQ=255)
ctcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTgcgc < 1:3153258/140‑1 (MQ=255)
tcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCa > 1:2901872/1‑140 (MQ=255)
tcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCa > 2:770250/1‑140 (MQ=255)
tcctccCAGCTGCGCGATATCCTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTCATCGCTGGTTAAACTGGCTGCTCAGTGTCGCAGCTTCCGTATTCAGTACTTCTAATTTTGCTTTCTCCGCTTGCGCAAGtt < 2:1521866/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCATTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGc > 1:5212866/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc > 1:4207609/1‑86 (MQ=255)
ccAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGttggtct > 2:1102981/1‑135 (MQ=255)
ccAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCt < 1:2613826/140‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCt < 2:1715093/140‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCGGGTCAGGGTCGCAGCTTCGGTAGTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCt < 1:63151/140‑1 (MQ=255)
gCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCg > 1:1099200/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGATATCGTTCACAACCAGCCCGCCGGTTTTATTTGCTGCCAGTTATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCCCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGc < 2:3367702/140‑1 (MQ=255)
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TTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.2465753/151‑1 (MQ=60)
TTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.2336662/151‑1 (MQ=60)
TTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.1438962/151‑1 (MQ=60)
TTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.2018432/151‑1 (MQ=60)
TTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.2112073/151‑1 (MQ=60)
TTTCTCGCGAGCCGCCTCCGCCGCCAGCGCAAGCTCTTGCTCCCTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.617444/151‑1 (MQ=60)
TTTCTCGCCAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCCCTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.4483852/151‑1 (MQ=60)
TTCCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCACTCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTC < SRR14920191.1953960/151‑1 (MQ=60)
CGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAT < SRR14920191.4922970/151‑1 (MQ=60)
CCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTT > SRR14920191.5058197/1‑151 (MQ=60)
TCTGCCGCCCGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTG > SRR14920191.1901919/1‑151 (MQ=60)
TCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTG > SRR14920191.1901903/1‑151 (MQ=60)
CCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATC < SRR14920191.94825/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATC < SRR14920191.3828234/151‑1 (MQ=60)
AGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAG < SRR14920191.2168135/151‑1 (MQ=60)
AGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAG < SRR14920191.2168321/151‑1 (MQ=60)
GCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGC > SRR14920191.1877253/1‑151 (MQ=60)
GCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGC > SRR14920191.1474376/1‑151 (MQ=60)
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ATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCG > SRR14920191.991440/1‑151 (MQ=60)
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CTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCA > SRR14920191.2910116/1‑151 (MQ=60)
CTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAG > SRR14920191.1200316/1‑151 (MQ=60)
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CACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGC > SRR14920191.1727059/1‑151 (MQ=60)
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CTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTC < SRR14920191.3162318/151‑1 (MQ=60)
CTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTC > SRR14920191.3852261/1‑151 (MQ=60)
CATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCG > SRR14920191.1102136/1‑151 (MQ=60)
CCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAA > SRR14920191.2361766/1‑151 (MQ=60)
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CCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTGAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGAC < SRR14920191.63244/151‑1 (MQ=60)
CCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGAC < SRR14920191.2620784/151‑1 (MQ=60)
CCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCGGGTCAGGGTCGCAGCTTCGGTAGTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGAC < SRR14920191.63376/151‑1 (MQ=60)
TGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAAC < SRR14920191.3891291/151‑1 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCTGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAGCG > SRR14920191.4333868/1‑151 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG < SRR14920191.789239/151‑1 (MQ=60)
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GAGATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGA < SRR14920191.4719178/151‑1 (MQ=60)
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CCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACACAACGTTGATGAATCACCTCCAC < SRR14920191.4322530/151‑1 (MQ=60)
CCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACGGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTGAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCACCTCCAC < SRR14920191.4396434/151‑1 (MQ=60)
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GATCGCGCATTTCGGCAAGCGCCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAATCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCACCTCCAC > NZ_CP025268/1631494‑1631794
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |