Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
183,450 |
A→G |
K386R (AAG→AGG) |
cdaR → |
DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 183,450 | 0 | A | G | 99.8%
| 2070.1
/ NA
| 591 | K386R (AAG→AGG) | cdaR | DNA‑binding transcriptional regulator CdaR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (310/280); minor base C (0/1); total (310/281) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 591 total aligned reads displayed.
TCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTT > NZ_CP025268/183314‑183586
|
tCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGt > 1:2632283/1‑140 (MQ=255)
cAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGtt < 1:4820286/140‑1 (MQ=255)
aGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATg < 2:1533364/140‑1 (MQ=255)
cGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGt < 2:5313605/140‑1 (MQ=255)
gttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGtt < 1:1520948/140‑1 (MQ=255)
ttgttTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTa > 1:5194299/1‑140 (MQ=255)
ttgttTATTCATCGTAATACACTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTa > 2:3155087/1‑140 (MQ=255)
gtATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGt < 2:2613107/139‑1 (MQ=255)
tATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCGTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGtt < 2:11074103/140‑1 (MQ=255)
tCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAg > 2:4691527/1‑140 (MQ=255)
cATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 1:10917516/140‑1 (MQ=255)
aTCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAgg < 2:11335658/139‑1 (MQ=255)
cGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcgg < 1:9017882/140‑1 (MQ=255)
gTAATACCCTTGAGTCTCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcggc > 1:1308769/1‑140 (MQ=255)
gTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGGCCGGGCGTGTTTGGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCGGTAGGTGGGGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGGTAAGGGTGAggcggc > 2:9409112/1‑140 (MQ=255)
gTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAggcggc > 1:4035724/1‑140 (MQ=255)
tAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGGATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGgcggcg < 2:9072368/140‑1 (MQ=255)
aaTACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGgcgc < 1:7884652/140‑1 (MQ=255)
aaTACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGgcgc < 2:6590055/140‑1 (MQ=255)
tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 1:6342451/1‑140 (MQ=255)
tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 2:5094016/1‑140 (MQ=255)
tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCa > 1:2808225/1‑140 (MQ=255)
gAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCagt > 2:8081696/1‑138 (MQ=255)
aTCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTcccc > 1:5628142/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTTGA‑TGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt < 2:2494842/140‑1 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTANGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:6023452/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:732181/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 1:6867712/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:5813880/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt > 2:5504283/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt < 2:2214561/140‑1 (MQ=255)
tCGGCGTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGGTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCt < 2:9788351/140‑1 (MQ=255)
cGGCTTAATCGTTTATCTGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTc < 2:5891831/140‑1 (MQ=255)
gCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAg > 2:2965218/1‑140 (MQ=255)
tAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGccc < 2:9542048/140‑1 (MQ=255)
aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg > 1:2102850/1‑140 (MQ=255)
aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 2:8504467/140‑1 (MQ=255)
aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 2:7618381/140‑1 (MQ=255)
aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCg < 1:3158681/140‑1 (MQ=255)
aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGAGTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTAGGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGGGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAGGCCCCTCAGCCCg > 2:10868951/1‑140 (MQ=255)
aTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGa < 1:2189777/140‑1 (MQ=255)
tCGTATATCGGACCTGACCGGGCTAGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTAGGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:11117363/140‑1 (MQ=255)
tCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:3683656/140‑1 (MQ=255)
tCGTAGATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTGGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑CGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGaa < 1:763535/140‑1 (MQ=255)
atatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGGTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGt > 2:10665711/1‑140 (MQ=255)
tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTa > 1:6235638/1‑140 (MQ=255)
tatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTAGGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTTGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCAGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTa > 2:8258852/1‑140 (MQ=255)
atCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTag < 1:6641894/140‑1 (MQ=255)
gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAggg > 1:173999/1‑140 (MQ=255)
gAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAggg > 1:5296538/1‑140 (MQ=255)
aCTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGa < 1:3657954/140‑1 (MQ=255)
cTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGaa < 1:9774265/140‑1 (MQ=255)
gACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATg > 1:9167829/1‑140 (MQ=255)
ccGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGcc < 2:4056544/140‑1 (MQ=255)
cGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTCGAGGGGAATGccc > 2:3957008/1‑140 (MQ=255)
gggCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCg < 1:1902093/140‑1 (MQ=255)
gCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGACTGCCCGaa > 1:10134876/1‑140 (MQ=255)
ttGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAAtt > 2:6285330/1‑140 (MQ=255)
ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGAAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 1:8177970/1‑140 (MQ=255)
ggCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGAGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCa > 2:2014485/1‑140 (MQ=255)
gaCAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGattat < 2:7847554/140‑1 (MQ=255)
aCAGGGTGCGGCTGTCTGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGCAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGattatt < 1:8010482/140‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGACTGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATGATTTAcg > 2:10161784/1‑140 (MQ=255)
gTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcg < 1:4075928/140‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcg < 1:4574146/140‑1 (MQ=255)
gctgctGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGt > 1:2456221/1‑140 (MQ=255)
gctgctGTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGGTCGGGATTATTTACGCGt > 1:10032348/1‑140 (MQ=255)
gctgTATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAg < 1:1067652/140‑1 (MQ=255)
tATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGtttt > 2:1861278/1‑140 (MQ=255)
tATGTGGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGGTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGAGTATTTACGCGTTAGtttt > 1:10352590/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTAcgcg > 2:6704392/1‑130 (MQ=255)
ggCGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAg > 2:6925836/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:8448537/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt < 1:937913/140‑1 (MQ=255)
cGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAAGTAACCGTCAGTTCGGGCGTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 1:118771/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTAAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 2:10434151/1‑140 (MQ=255)
tACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAATGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:30021/1‑140 (MQ=255)
tACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTCGTTGTTCCAGATCgg > 1:8289381/1‑140 (MQ=255)
tACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:3540275/1‑140 (MQ=255)
tACAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGAGTAGTGACGCGTTAGTTTTTCCAGATCgg > 1:8791282/1‑140 (MQ=255)
aCAAC‑TGGATGAAGAGCGGTACGTTATGCGTTAAGGTAGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTTGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGc < 1:11300931/140‑1 (MQ=255)
cAAC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCt > 1:7196747/1‑140 (MQ=255)
aaC‑TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCtt < 2:3477365/140‑1 (MQ=255)
actggatGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTc > 2:717367/7‑140 (MQ=255)
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TAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAG < SRR14920198.44861/151‑1 (MQ=60)
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GGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGGTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGAGTATTTACGCGTTAGTTTT > SRR14920198.10420905/1‑151 (MQ=60)
GTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTT < SRR14920198.4102942/151‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTT < SRR14920198.860364/151‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTT < SRR14920198.4604436/151‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTT < SRR14920198.2292387/151‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGAGTATTTACGCGTTAGTTTTT > SRR14920198.1574426/1‑151 (MQ=60)
TTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggactcctatctcgtatgcc > SRR14920198.1840587/1‑97 (MQ=60)
TGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCC < SRR14920198.6749109/151‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCC < SRR14920198.10750389/151‑1 (MQ=60)
CTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAG > SRR14920198.602018/1‑151 (MQ=60)
CTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAG > SRR14920198.3091812/1‑151 (MQ=60)
GCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAT > SRR14920198.11007516/1‑151 (MQ=60)
GCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAT < SRR14920198.1074738/151‑1 (MQ=60)
GCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAAGTAACCGTCAGTTCGGGCGTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAT > SRR14920198.119629/1‑151 (MQ=60)
GCTGGATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAT > SRR14920198.4492341/1‑151 (MQ=60)
CTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATC < SRR14920198.10730402/151‑1 (MQ=60)
CTGTATGGGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATC < SRR14920198.8552832/151‑1 (MQ=60)
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GTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTCGTTGTTCCAGATCGG > SRR14920198.8344352/1‑151 (MQ=60)
GTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGG > SRR14920198.5293510/1‑151 (MQ=60)
GTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGG > SRR14920198.3563788/1‑151 (MQ=60)
GGATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGAGTAGTGACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGG > SRR14920198.8849593/1‑151 (MQ=60)
ATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCT > SRR14920198.7244689/1‑151 (MQ=60)
GGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAA < SRR14920198.6587271/151‑1 (MQ=60)
GCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAT > SRR14920198.5400548/1‑151 (MQ=60)
GCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAT > SRR14920198.7200293/1‑151 (MQ=60)
CGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATC < SRR14920198.944052/151‑1 (MQ=60)
GTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggactcctatctcgtatgccgtcttctgcttg > SRR14920198.8040652/1‑85 (MQ=60)
ACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGC < SRR14920198.8135314/151‑1 (MQ=60)
ACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGC > SRR14920198.9265687/1‑151 (MQ=60)
CTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGAT > SRR14920198.5602413/1‑151 (MQ=60)
TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATC < SRR14920198.7887140/151‑1 (MQ=60)
TGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATC < SRR14920198.1250130/151‑1 (MQ=60)
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AAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTG > SRR14920198.7350185/1‑151 (MQ=60)
AAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCAGTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTG < SRR14920198.10321854/151‑1 (MQ=60)
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ACCGCTGGCAACGTCAAAGGCGTTGTTTATTCATCGTAATACCCTGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGG‑TGAAGAGCGGTAAGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTG > NZ_CP025268/183301‑183600
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |