Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,626,362 |
A→G |
N71D (AAC→GAC) |
ydeE → |
efflux MFS transporter YdeE |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,626,362 | 0 | A | G | 99.5%
| 2085.1
/ NA
| 615 | N71D (AAC→GAC) | ydeE | efflux MFS transporter YdeE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (323/287); minor base T (2/1); total (327/288) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 622 total aligned reads displayed.
CTACGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCAACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCG > NZ_CP025268/1626225‑1626497
|
tACGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGACAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTcgaca < 2:4501495/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTATGCTGGGTTTTGGTATCCTGGCGGTTAAGTTcgacaa > 1:45054/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGCCATGTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGGTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTcgacaa > 1:2850296/1‑140 (MQ=255)
gCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGa < 1:129420/140‑1 (MQ=255)
gCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGa < 1:11003982/140‑1 (MQ=255)
gCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGa < 2:3866795/140‑1 (MQ=255)
gCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGa < 2:4277781/140‑1 (MQ=255)
tGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGGCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGaaa > 2:6015729/1‑140 (MQ=255)
tGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGaaa < 1:10838628/140‑1 (MQ=255)
tGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGaaa < 2:8033749/140‑1 (MQ=255)
tGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGAGCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGaaa < 2:2122594/140‑1 (MQ=255)
aTTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAAGCGGTTAGGCGAGGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGTTTTTGGTCTCCTGGCGGATAAGTTCGACCAGAAACGCt < 2:786028/140‑1 (MQ=255)
ttATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCtat < 2:5426106/140‑1 (MQ=255)
tATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATAGGTTATGCGATGACAAATGCGCTCACTATTGGCGTAGTTTTTAGCGTCGGGTGTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGTCAAGATAAGCtatt > 2:5017868/1‑139 (MQ=255)
gACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGt > 1:10642126/1‑140 (MQ=255)
gACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGt > 1:702224/1‑140 (MQ=255)
ccATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAATTTCGACAAGAAACGCTATATGTTa > 1:1713773/1‑140 (MQ=255)
ccATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTa < 2:411350/140‑1 (MQ=255)
ccATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTa > 1:8252695/1‑140 (MQ=255)
tttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTATCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTg > 1:5413727/1‑140 (MQ=255)
tttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTg > 1:9941352/1‑140 (MQ=255)
tttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCAGGCGGATAATTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTg > 1:2165758/1‑140 (MQ=255)
ttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTgg < 1:5198399/140‑1 (MQ=255)
tACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGc < 1:6499883/140‑1 (MQ=255)
tACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGc > 2:10509948/1‑140 (MQ=255)
ttGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAAt > 2:6986630/1‑140 (MQ=255)
gAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTa > 2:9683906/1‑140 (MQ=255)
gTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTAcc > 1:8996786/1‑140 (MQ=255)
tCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTTGCGGATAAGTTAGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCg > 2:3173185/1‑140 (MQ=255)
aGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTc > 2:8502759/1‑140 (MQ=255)
tACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg < 2:2821387/110‑1 (MQ=255)
cgCCTGCGGGTCGATCGACTCGGTTAAGCGATGACAATTGCGCTCCCTATTGGCGTCGTTTATAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAACCGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAg < 1:11051645/139‑1 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGGTTTTGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCAATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCcgcg > 1:4349177/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCACGGGTTTGGTATCCAGGCGGCTAAGTTCGAAAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATAAACGCCATCGCCAGCg > 1:4131536/1‑140 (MQ=255)
gAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATACTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAAAGCTATATGTTAATGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtt > 1:3205433/1‑140 (MQ=255)
aGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCCGCGGttt > 2:1197178/1‑140 (MQ=255)
aGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTGTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGttt > 2:3732199/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTACTCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtttt < 1:6165856/140‑1 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtttt < 2:7304175/140‑1 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTAATTGCAATTACAGCCTTCGCCAGCGGtttt > 2:2485055/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCGATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtgtt > 2:7220522/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTGTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtttt > 2:5702258/1‑140 (MQ=255)
gtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATAGCGCTCACTATTGGCGTCGATTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTAt < 2:9393553/140‑1 (MQ=255)
gtCGATCTAATCGGTTATGAGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAACAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTAt < 1:7703166/140‑1 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGc > 1:8563591/1‑140 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGc < 1:6811842/140‑1 (MQ=255)
gATCTAATAGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATCTGTTACTGGCAATGACCGCCGTCGCCAGCGGGGTTATTGc > 2:7511905/1‑140 (MQ=255)
aaTCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGCAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTa < 2:1848486/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTa < 2:362621/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTa < 1:589582/140‑1 (MQ=255)
tCGGTTATGCGATGACACTTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACt < 2:10561888/140‑1 (MQ=255)
cGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACtt < 1:925061/140‑1 (MQ=255)
gTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTATCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTAGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTa > 1:3328905/1‑140 (MQ=255)
gTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTa < 2:3303564/140‑1 (MQ=255)
tATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGt > 2:9128758/1‑140 (MQ=255)
tATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGt < 1:6283568/140‑1 (MQ=255)
tATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGGTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTAACGCCGTCGCCCGCGGGTTTATTTCCCTTACTTTAGt > 1:8814452/1‑140 (MQ=255)
tATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTGTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCAGGCGGATAAGTTCGTCAAGAAACGCGATATGTTTATGGGAATTAACGCCTTCGCCAACGGTTTTATTGCCATTACTTTTGt > 1:2421596/1‑140 (MQ=255)
aTGCGATGACAATNGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTg > 1:9824526/1‑140 (MQ=255)
tGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTAACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGa > 2:10208104/1‑140 (MQ=255)
gCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGaa < 2:10137269/140‑1 (MQ=255)
gCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGaa < 1:2731924/140‑1 (MQ=255)
gCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGaa < 1:4929719/140‑1 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAACCGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt < 1:1974463/140‑1 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt > 2:8323098/1‑140 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt < 1:10009271/140‑1 (MQ=255)
cAATTGCGCTCACTAGTGGCGACGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTg < 2:8909759/140‑1 (MQ=255)
gcTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTAACGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTgg > 1:3703776/1‑140 (MQ=255)
cTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATACTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAAAGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTTCCATTAATTTATTTAATAACGTGACGCTGGt > 1:482790/1‑140 (MQ=255)
cTCACTATTGGCGTCGTGTTTAGCATCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTAATGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTGATTGCCAGTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGt > 2:6723872/1‑140 (MQ=255)
aCTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGATATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCCGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACTTGACGCTGGTtgt > 2:7723689/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGATTAACGTGTCGCTGGTTGTGct < 1:951377/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGctct > 2:10697088/1‑140 (MQ=255)
tcgtTTTTAGCCTCGGTTTTTGTATACAGGCGGATAAGTTAGAAAAGAAAAACTATATTTTAATGGCAATTAACGCCATAGCCAGCGGTTTTATTGCCAATACTTTAGTGTATAAAGTGAAGCATGTTGTGCTCtgtttt > 1:4615133/1‑140 (MQ=255)
tcgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCtttttt > 1:10499259/1‑140 (MQ=255)
tcgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACGTGAGTGAATAACGTGAAGCTGGTTGTGctctggttt > 1:10108601/1‑135 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 1:7218817/140‑1 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 2:1504593/140‑1 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 1:5627777/140‑1 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 1:5087953/140‑1 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 1:8606687/140‑1 (MQ=255)
gtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGc > 2:1743073/1‑140 (MQ=255)
tttttAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGcc < 1:11403481/140‑1 (MQ=255)
tttttAGCCTCGATTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGcc < 1:3104211/140‑1 (MQ=255)
tAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCa < 2:6386356/140‑1 (MQ=255)
tCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAAc < 2:4854454/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACt > 2:5173760/1‑140 (MQ=255)
cGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGACCTCATTAACt > 2:11344824/1‑140 (MQ=255)
gTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTATCTgc > 2:10915748/1‑140 (MQ=255)
ttttGGTATACTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGG‑TTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGTTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTgcgc < 1:936600/140‑1 (MQ=255)
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GCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGG > SRR14920198.8263991/1‑151 (MQ=60)
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GCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGGTTTATTGC > SRR14920198.8642295/1‑151 (MQ=60)
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GTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACT > SRR14920198.4552394/1‑151 (MQ=60)
TTTTTCGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTG < SRR14920198.6226455/151‑1 (MQ=60)
TTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAACCGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTG < SRR14920198.2403573/151‑1 (MQ=60)
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TTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATAGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTG > SRR14920198.7173560/1‑151 (MQ=60)
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TCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGCTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTC < SRR14920198.10729178/151‑1 (MQ=60)
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GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGACACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT < SRR14920198.11114804/151‑1 (MQ=60)
GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT > SRR14920198.3411378/1‑151 (MQ=60)
GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT > SRR14920198.2290477/1‑151 (MQ=60)
GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTCCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT > SRR14920198.3193226/1‑151 (MQ=60)
TTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTT < SRR14920198.8193622/151‑1 (MQ=60)
TTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTT < SRR14920198.942809/151‑1 (MQ=60)
GTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCGTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGC > SRR14920198.6116910/1‑151 (MQ=60)
GTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGC > SRR14920198.2071155/1‑151 (MQ=60)
TATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGCAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCT < SRR14920198.10280744/151‑1 (MQ=60)
ATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTA > SRR14920198.10939832/1‑151 (MQ=60)
ATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTA > SRR14920198.7513144/1‑151 (MQ=60)
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TCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTATTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTAC < SRR14920198.7893670/151‑1 (MQ=60)
GCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCTCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAAGTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGC > SRR14920198.62068/1‑151 (MQ=60)
GCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGGTTTATTGCCCTTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGC > SRR14920198.10453821/1‑151 (MQ=60)
GGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTG > SRR14920198.11292858/1‑151 (MQ=60)
TAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAA < SRR14920198.10554597/151‑1 (MQ=60)
AAGTTCGACTAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTTCCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAG < SRR14920198.4175861/151‑1 (MQ=60)
AAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGtctcttatacacatctccgagcccacgagacggactcctatctcgtatgccgtcttctgct > SRR14920198.10846228/1‑90 (MQ=60)
AGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGC > SRR14920198.6512286/1‑151 (MQ=60)
GTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCTGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAAAGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCC < SRR14920198.547965/151‑1 (MQ=60)
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GTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCC < SRR14920198.10662107/151‑1 (MQ=60)
CGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCCTGG < SRR14920198.4321504/151‑1 (MQ=60)
GACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCCTGGT > SRR14920198.9666155/1‑151 (MQ=60)
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GACGCGGCGCTACGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCAACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCCTGGT > NZ_CP025268/1626216‑1626512
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
