Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,766,333 |
A→G |
C92R (TGT→CGT) |
sufD ← |
Fe‑S cluster assembly protein SufD |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,766,333 | 0 | A | G | 99.6%
| 2596.3
/ NA
| 746 | C92R (TGT→CGT) | sufD | Fe‑S cluster assembly protein SufD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (330/413); minor base T (3/0); total (333/413) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.85e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 746 total aligned reads displayed.
CACGCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACACCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCA > NZ_CP025268/1766196‑1766469
|
cGCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCa < 2:6773968/140‑1 (MQ=255)
cGCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCa > 1:2447343/1‑140 (MQ=255)
cGCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCa > 1:1611648/1‑140 (MQ=255)
gCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCAt < 1:6485638/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATc > 1:4065358/1‑140 (MQ=255)
ccAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACCCTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTNATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCANCGACAAac < 1:6064451/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTACCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCAGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCGGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGacacacac < 1:1134842/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCa > 1:10260884/1‑140 (MQ=255)
gCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCa > 1:9497502/1‑140 (MQ=255)
ttCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGcc < 1:8090654/140‑1 (MQ=255)
tCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCg > 1:7016972/1‑140 (MQ=255)
cGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCa < 1:9982766/140‑1 (MQ=255)
gTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCAc < 2:5454987/140‑1 (MQ=255)
gTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCAc < 2:7671083/140‑1 (MQ=255)
tCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACg < 1:5145442/140‑1 (MQ=255)
tCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACg < 1:9687737/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGa > 1:671764/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGa > 1:8254322/1‑140 (MQ=255)
gCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCGTATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCt < 1:7145173/140‑1 (MQ=255)
gCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCt < 2:5023798/140‑1 (MQ=255)
gCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCt < 2:4869754/140‑1 (MQ=255)
aaaCACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACg > 2:2207836/1‑140 (MQ=255)
aaaCACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACg > 2:908152/1‑140 (MQ=255)
aaCACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGt < 1:290907/140‑1 (MQ=255)
aaCACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGt < 2:4228164/140‑1 (MQ=255)
acacTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGtt < 2:6972806/140‑1 (MQ=255)
acTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTaa < 1:6232562/140‑1 (MQ=255)
ttCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAAACCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTGCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATAGCTCAGTGCGGGCACGTAACTCCCATAGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTATCGTTAACg > 2:448419/1‑140 (MQ=255)
cGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTACTGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCTCGGAGTCTAACGTTAACGCTa < 2:858992/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTa < 2:9599758/140‑1 (MQ=255)
ccTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAg > 2:3659198/1‑140 (MQ=255)
gAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCa > 2:11137204/1‑140 (MQ=255)
gAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCa < 1:1791586/140‑1 (MQ=255)
tAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCa < 2:312560/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACg < 1:1487698/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACg < 1:583091/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACg < 1:4994302/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACg < 2:3302768/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACg < 2:1784704/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACg < 1:2713903/140‑1 (MQ=255)
cGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgc > 2:4080633/1‑140 (MQ=255)
cGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCGGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAACCACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgc < 2:8926187/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgctg < 1:1063541/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGGAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgctg < 2:5883158/140‑1 (MQ=255)
cGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgctgc < 1:8824394/140‑1 (MQ=255)
gggTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgctgct < 2:9328554/140‑1 (MQ=255)
gggTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCACTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACgctgct < 2:7094812/140‑1 (MQ=255)
ggTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGctgctg < 1:11072605/140‑1 (MQ=255)
ggTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGctgctg < 1:7377039/140‑1 (MQ=255)
ggTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGctgctg > 1:3307571/1‑140 (MQ=255)
gTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCtgt < 2:10220463/140‑1 (MQ=255)
aaCCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTggg < 1:3134414/140‑1 (MQ=255)
tGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGatat < 2:10739500/140‑1 (MQ=255)
gACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATAtc > 1:120274/1‑140 (MQ=255)
gACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATAtc > 1:7535742/1‑140 (MQ=255)
gACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATAtc > 1:8972144/1‑140 (MQ=255)
aCGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATctct > 1:4849480/1‑140 (MQ=255)
tcgtcgTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTcc > 1:3594797/1‑140 (MQ=255)
cgtcgtTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTccc > 2:47479/1‑140 (MQ=255)
gtcgtTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCg > 2:9849649/1‑140 (MQ=255)
gtTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCaa < 1:4711074/140‑1 (MQ=255)
gtTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCaa < 2:10350878/140‑1 (MQ=255)
cTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGAc < 1:10120392/140‑1 (MQ=255)
tcTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTACCGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACaac < 2:11457202/139‑2 (MQ=255)
aCTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAACCACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCGCCCGCAATGCTGACaaa < 1:8510245/140‑1 (MQ=255)
aCTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACaaa < 2:733436/140‑1 (MQ=255)
cTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAAc > 1:2249283/1‑140 (MQ=255)
ttCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACt < 2:7515118/140‑1 (MQ=255)
cGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTg > 2:7879896/1‑140 (MQ=255)
cGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTg > 2:6398205/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTCAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTCTTGag > 2:8383682/1‑139 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 1:9306586/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 1:2015935/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 1:2583836/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 2:5243067/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 1:5334692/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 2:1536827/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 1:7910338/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 2:27158/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGAt > 2:2887403/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATc < 2:8064671/140‑1 (MQ=255)
cTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGc < 1:5959702/140‑1 (MQ=255)
tGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCa < 2:5708039/140‑1 (MQ=255)
gCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCGAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAg < 2:2360364/140‑1 (MQ=255)
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cATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAgc > 1:3862567/1‑140 (MQ=255)
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GTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATC < SRR14920198.4147032/151‑1 (MQ=60)
ATATTCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGC > SRR14920198.9730547/1‑151 (MQ=60)
TATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCC < SRR14920198.10440439/151‑1 (MQ=60)
ATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCC < SRR14920198.7271366/151‑1 (MQ=60)
TGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAG < SRR14920198.2471808/151‑1 (MQ=60)
TGCCTTCAGTTGCAGCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGAACGTAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAG < SRR14920198.8894326/151‑1 (MQ=60)
GCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGC > SRR14920198.3888057/1‑151 (MQ=60)
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CAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGT > SRR14920198.1484251/1‑151 (MQ=60)
CAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGT > SRR14920198.8899903/1‑151 (MQ=60)
CAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGT > SRR14920198.502901/1‑151 (MQ=60)
TTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATA > SRR14920198.1509230/1‑151 (MQ=60)
TGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATAT < SRR14920198.1633454/151‑1 (MQ=60)
TGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCGAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATAT < SRR14920198.330085/151‑1 (MQ=60)
GCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATT > SRR14920198.5225249/1‑151 (MQ=60)
CATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTCACGCTCAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTAGTGATCAGCCCTTCCCGCGGCGTATAGTT > SRR14920198.8084375/1‑151 (MQ=60)
ATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTC < SRR14920198.2637141/151‑1 (MQ=60)
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TCGCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCC < SRR14920198.4973133/151‑1 (MQ=60)
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GCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAG > SRR14920198.11553539/1‑151 (MQ=60)
GCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAG < SRR14920198.2836510/151‑1 (MQ=60)
GCTCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAG > SRR14920198.2110227/1‑151 (MQ=60)
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TCAGTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTT < SRR14920198.3507195/151‑1 (MQ=60)
GTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTC > SRR14920198.1953940/1‑151 (MQ=60)
GTGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTC > SRR14920198.2400850/1‑151 (MQ=60)
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GGGCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTCACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTCTTGATCCGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTC > SRR14920198.4365012/1‑151 (MQ=60)
GCGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCAT > SRR14920198.3792286/1‑151 (MQ=60)
CGGGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATG < SRR14920198.10862993/151‑1 (MQ=60)
GGCACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTT > SRR14920198.7869658/1‑151 (MQ=60)
CACGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTA > SRR14920198.8245480/1‑151 (MQ=60)
CGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCtgtctcttatacacatctccgagcccacg > SRR14920198.4680846/1‑122 (MQ=60)
CGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACG < SRR14920198.4866918/151‑1 (MQ=60)
CGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACG > SRR14920198.2523306/1‑151 (MQ=60)
CGTAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTAGATTTCCAGTTTTCATGTTTACG > SRR14920198.9500541/1‑151 (MQ=60)
TAACGCCCATCGACAAACACCAGCCGNACGGAGTNTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGNGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTG < SRR14920198.6014663/151‑1 (MQ=60)
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CGGCGATATGCGTCACGCTTTGTGCCAGGCTTTCCGTCAAATGCAGAAACACTTCCGCCTGAATAGCGTCGGGTAAACCCTGACGGTCGTCGTTAATGCTCACTTCATATCCGCTGCCTTCAGTTGCATCGCTCAGTGCGGGCACGTAACACCCATCGACAAACACCAGCCGCACGGAGTCTAACGTTAACGCTAAGGCATCACGCTGCTGTGGGGATATCTCTCCCGCAATGCTGACAAACTGGCTATTGATCAGCCCTTCCAGCGGCGTATATTTCCAGTTTTCATGTTTACGTG > NZ_CP025268/1766183‑1766479
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |