Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,798,989 |
T→C |
*327* (TAA→TAG) |
btuC ← |
vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,798,989 | 0 | T | C | 99.7%
| 2277.5
/ NA
| 656 | *327* (TAA→TAG) | btuC | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (361/293); minor base A (2/0); total (363/293) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 656 total aligned reads displayed.
ACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTG > NZ_CP025268/1798852‑1799125
|
gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGt > 1:1839589/1‑140 (MQ=255)
gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGt > 2:2698299/1‑140 (MQ=255)
cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTc < 1:6443551/140‑1 (MQ=255)
cGAACGTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTc < 2:11137967/140‑1 (MQ=255)
aaCTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCt > 1:11010734/1‑140 (MQ=255)
ctcCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCttt > 1:4788264/1‑140 (MQ=255)
ctcCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCttt < 2:857530/140‑1 (MQ=255)
cGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGACTCTTGCATCGTTACTCCAGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTGTAACaa > 2:3320915/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACaa > 2:10950895/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACaa > 2:1724825/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTCACTTAACCGTCGATATCTTTCACAACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCAGCGATTCTCCGGGGTGTGGTCAGTAAAACTCGTAGCTGGTAATCATAGACCGTCATTTTGCGGCTAAAGTCATGCTTGTAACaa > 2:10187043/1‑140 (MQ=255)
tGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTGTAACAATa > 1:9974229/1‑140 (MQ=255)
gTCACTTCTCCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc < 1:1532296/140‑1 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc > 1:7100705/1‑140 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc > 1:2190470/1‑140 (MQ=255)
aCTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAg < 1:632295/140‑1 (MQ=255)
aCTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAg < 1:4207728/140‑1 (MQ=255)
aCCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATaaa < 2:6411550/140‑1 (MQ=255)
cGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTTACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAaca > 1:8464437/1‑140 (MQ=255)
tCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAAAAcc > 1:1145256/1‑140 (MQ=255)
gATATCTTTCACTACGGTCTTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTATAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCgg < 2:6017658/140‑1 (MQ=255)
gATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCgg < 1:11108285/140‑1 (MQ=255)
ctatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc < 2:2147082/139‑1 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCATAGCGATTAATCATAGACCGTCATTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc < 2:3741341/140‑1 (MQ=255)
atatCATTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc < 1:10232154/140‑1 (MQ=255)
atCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTTCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCATTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgcgc < 2:7297181/140‑1 (MQ=255)
atCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgcgc < 1:812439/140‑1 (MQ=255)
tttCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACTCAGGCGCAcc > 1:8938844/1‑140 (MQ=255)
tttCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCAcc > 2:7504224/1‑140 (MQ=255)
tttCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCAcc > 2:8943301/1‑140 (MQ=255)
tCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTa > 2:685958/1‑140 (MQ=255)
tCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTa > 1:5505285/1‑140 (MQ=255)
aCTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAAc < 2:9233628/140‑1 (MQ=255)
aCTACGGTCGTCAGAATGGAATCGTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAAc < 1:9498008/140‑1 (MQ=255)
tACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGt > 1:5167147/1‑140 (MQ=255)
tACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGt > 2:7019755/1‑140 (MQ=255)
cGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTAAATCATAGACAGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTg > 1:3802757/1‑140 (MQ=255)
ggTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGc < 2:9813168/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGc > 1:5792123/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg > 1:371026/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCAACTTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAATTCTTAGCTTTTAATCAAAGACCGTCTATTTGCGGATAAAGTCATGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGATGCg > 2:9565753/1‑140 (MQ=255)
cgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGt > 2:156448/1‑140 (MQ=255)
cgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGt < 2:6781397/140‑1 (MQ=255)
gtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTg > 1:2057919/1‑140 (MQ=255)
cAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGAc < 2:4249792/140‑1 (MQ=255)
cAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGAc < 2:7414487/140‑1 (MQ=255)
aGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGGGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAAGAACCAGATACACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGAcc > 2:2953819/1‑140 (MQ=255)
gAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCa < 1:1080652/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTGTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTGAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCCCCGAACGTTGCGGTGACCAc > 1:7343996/1‑140 (MQ=255)
tgtattCTTGCATCGTTTCTACTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGc < 2:8055137/135‑1 (MQ=255)
ggAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGcc > 2:1843462/1‑140 (MQ=255)
ggAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAAAAACCAGATAAACACCGGCGCTCCTAACGTTGCGGTGACCACGcc > 2:3673287/1‑140 (MQ=255)
tCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATa > 1:4646858/1‑140 (MQ=255)
tGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGc > 2:4652619/1‑140 (MQ=255)
tGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGc > 2:4466509/1‑140 (MQ=255)
tttCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAcc > 2:4078785/1‑86 (MQ=255)
tctcCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCg < 1:3281958/140‑1 (MQ=255)
tcCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGc < 1:4988583/140‑1 (MQ=255)
gggTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAAAAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTTCGGCAGCt > 2:6504926/1‑140 (MQ=255)
ggTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAACCACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTa < 2:9424415/140‑1 (MQ=255)
ggTGTGGTAAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTATTGCGTCTAACGTCCTGCTTTAAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTCCGCTGACCACGCAAAAAGGCAGCTCTTCGGCacaaa > 2:8372231/1‑136 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc > 1:1117382/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc < 2:9104542/140‑1 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc > 1:9872477/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAAGAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc > 2:6208460/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCa > 1:5920817/1‑140 (MQ=255)
tCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAg > 2:1401660/1‑140 (MQ=255)
cAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAgg < 2:4788263/140‑1 (MQ=255)
cAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAgg < 1:3644110/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCATATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg > 2:10637805/1‑140 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 1:10003374/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 1:6863436/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 1:9400180/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 2:1151335/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 2:2554613/140‑1 (MQ=255)
tAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTCATGCCAGgcgc > 1:3242559/1‑140 (MQ=255)
aaTCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTa > 2:5668785/1‑140 (MQ=255)
aaTCTGAGCTCGTAAACAGAGACCGTCTTTTTGCGGCAAACGTCCCGCTTTGAACAATAACCCGATAAACACCGGCGCACCGACCGTTGCGGTGCCCACGCCAATCGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTa < 2:2395856/140‑1 (MQ=255)
tCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACa > 1:7948482/1‑140 (MQ=255)
ttAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACaa < 1:8716210/53‑1 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 1:4371903/1‑140 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 1:966378/1‑140 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 1:2818517/1‑140 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 1:4502701/1‑140 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGAGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 1:6925499/1‑140 (MQ=255)
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CAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAAT < SRR14920198.3668266/151‑1 (MQ=60)
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GCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAAGAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATCTCGGCCAGCAGCA > SRR14920198.2521208/1‑151 (MQ=60)
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TTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATG < SRR14920198.2139128/151‑1 (MQ=60)
TTTAATCAGAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTACCAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATG < SRR14920198.9195957/151‑1 (MQ=60)
TAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCG > SRR14920198.3700749/1‑151 (MQ=60)
ATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAtacagaa > SRR14920198.4883335/1‑144 (MQ=60)
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TCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTC > SRR14920198.5392725/1‑151 (MQ=60)
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CGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTGCCAGCGCGCAG > SRR14920198.7481332/1‑151 (MQ=60)
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GCACATTACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTGCCAGCGCGCAGCC > NZ_CP025268/1798845‑1799138
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
