Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,828,512 |
T→C |
N362S (AAC→AGC) |
mltB ← |
lytic murein transglycosylase B |
| |
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position |
ref |
new |
freq |
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reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,828,512 | 0 | T | C | 99.8%
| 1782.9
/ NA
| 513 | N362S (AAC→AGC) | mltB | lytic murein transglycosylase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (137/375); minor base A (0/1); total (137/376) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 540 total aligned reads displayed.
TCTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCC > NZ_CP025268/2828375‑2828646
|
ctGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGCTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac > 1:4136228/1‑140 (MQ=255)
ctGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac > 2:4190985/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t < 2:1651398/140‑1 (MQ=255)
gtcagtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tg > 2:8313493/1‑139 (MQ=255)
tcagtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgt > 1:1121040/1‑138 (MQ=255)
tcagtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgt > 1:7779074/1‑138 (MQ=255)
agtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgtac > 2:1175788/1‑136 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGTACAACAAAGCACTTTCGTCAGGAAGATTGTGTTGGCGGTGCAATTTTACGAGTAGGATTCAGAAAAATGCTGATTAGCAAGAGGGAAGATCACTCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgaactc > 1:9558402/1‑134 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGAATATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCACTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTc > 2:4109686/1‑140 (MQ=255)
caAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTcg > 2:5119653/1‑140 (MQ=255)
aaaTTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgc < 1:8393879/140‑1 (MQ=255)
aTTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgcca < 1:2445638/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCGGACAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcgcc < 2:4692728/140‑1 (MQ=255)
ccacacGAGAGCACTTTCGTCATGAAGAGGGTGAAGGCGTTGCAATATTACGAGGAGTATTCAGAAAAAAGCTGATGAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACgg < 2:8419540/138‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:1547041/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 2:2778572/140‑1 (MQ=255)
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tAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCt < 1:4498698/140‑1 (MQ=255)
cACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCGAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAAc > 1:5979364/1‑140 (MQ=255)
tttCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGc < 2:7566168/140‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 2:2702836/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 2:9081031/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 2:4343523/1‑140 (MQ=255)
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tCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGAc < 1:6135762/140‑1 (MQ=255)
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ggAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGc < 1:9217284/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 1:7450575/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 1:81857/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTGACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 2:7240123/140‑1 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 2:5350509/140‑1 (MQ=255)
gATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGCTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGGAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAtt > 2:7984851/1‑140 (MQ=255)
tGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGc > 1:2036979/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCg > 1:3602779/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGt < 2:6411579/140‑1 (MQ=255)
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ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt < 1:9010116/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt < 1:9331179/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt < 1:720391/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt < 2:7713120/140‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATgg > 2:574153/1‑140 (MQ=255)
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tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt < 1:6446990/140‑1 (MQ=255)
gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg < 2:4866998/140‑1 (MQ=255)
gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACG‑CCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtgt < 2:8698220/140‑1 (MQ=255)
acgacgAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTa < 1:1270766/140‑1 (MQ=255)
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ggaggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACgg > 1:1671230/1‑140 (MQ=255)
cggaGTCAGAAACCACCGGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCACTTGTAAAGAGCTACGG‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTGGGCCTCCCTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGGGCTTTGGTTGTAACGGGt < 2:9417546/139‑1 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGATGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAGTGCGTAATGGGTGCTGTGGTGGTAACGGGt < 2:2436282/140‑1 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt > 1:5805758/1‑140 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt < 1:6819221/140‑1 (MQ=255)
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gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:5006409/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:2095147/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACAGGTGa < 1:8311021/140‑1 (MQ=255)
tCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATgg > 1:8555614/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATCGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAg < 1:4744552/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAg < 1:5655846/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAg < 2:4576019/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAg > 1:3349685/1‑140 (MQ=255)
aaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGaa < 1:3041926/140‑1 (MQ=255)
aTTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGc > 2:2264463/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 1:340665/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 2:6650487/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:5382276/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:3075057/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:2788405/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc > 2:2068412/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:4843914/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:1891648/140‑1 (MQ=255)
cAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCg < 2:3893998/140‑1 (MQ=255)
agGGAAGCACACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGATTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTTTTGTTGTAACGGGTGATGTTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 2:8229581/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc < 1:6669472/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTACGGCAGACCGTAcc > 2:3596278/1‑140 (MQ=255)
ggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCa < 1:2853409/140‑1 (MQ=255)
ggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCa < 1:8758625/140‑1 (MQ=255)
gAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAg < 2:5944809/140‑1 (MQ=255)
gAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGGACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAg < 2:9651039/140‑1 (MQ=255)
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gCTCACGCCCCCCACTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGGTGTCACGGGTGATGGTGAAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAc > 1:6264431/1‑140 (MQ=255)
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GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920172.8262125/151‑1 (MQ=60)
GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920172.5392914/151‑1 (MQ=60)
AGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTGACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGG < SRR14920172.5539391/151‑1 (MQ=60)
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AGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGG < SRR14920172.7011327/151‑1 (MQ=60)
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AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920172.8671266/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920172.745053/151‑1 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920172.7744726/151‑1 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920172.6722317/151‑1 (MQ=60)
GGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGC < SRR14920172.8828588/151‑1 (MQ=60)
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GAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC < SRR14920172.6271215/151‑1 (MQ=60)
GAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC < SRR14920172.1990763/151‑1 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCAGGT > SRR14920172.260115/1‑151 (MQ=60)
TCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGC < SRR14920172.5724193/151‑1 (MQ=60)
ACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCA < SRR14920172.2689937/151‑1 (MQ=60)
CGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacgcgtagtaatctcgtatgccgtcttcggcttgaaaagggggggggggggggg > SRR14920172.2923314/1‑66 (MQ=60)
CGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTActgtctcttat > SRR14920172.8896429/1‑140 (MQ=60)
GCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAAC < SRR14920172.2305762/151‑1 (MQ=60)
CCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACA > SRR14920172.4328633/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACA > SRR14920172.1955035/1‑151 (MQ=60)
CCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACAT < SRR14920172.5159604/151‑1 (MQ=60)
CCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTATTGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC < SRR14920172.7987744/151‑1 (MQ=60)
CCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC > SRR14920172.8128782/1‑151 (MQ=60)
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TTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACG > SRR14920172.865454/1‑151 (MQ=60)
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GTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCA > SRR14920172.2250791/1‑151 (MQ=60)
AAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGC < SRR14920172.7517691/151‑1 (MQ=60)
TAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGG > SRR14920172.9393507/1‑151 (MQ=60)
TAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGG < SRR14920172.894490/151‑1 (MQ=60)
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GTCATCACAACCTCTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGG > NZ_CP025268/2828363‑2828658
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |