Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
521,513 |
C→T |
A683V (GCG→GTG) |
ybbP → |
ABC transporter permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 521,513 | 0 | C | T | 98.9%
| 993.6
/ NA
| 282 | A683V (GCG→GTG) | ybbP | ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (122/156); minor base G (1/2); total (123/159) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
AGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTG > NZ_CP025268/521377‑521649
|
aGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAt < 1:1073903/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCCGCTGGAAGAAGGGAAACGGCATGTTGACACTACTCATTCGTCAGTTCCCGACCATTAGCTTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTGGGTCAGGTGTTGGAGCAAGTAAGTCGGGCGTTGGAAGCGAt < 2:4242127/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 2:3682806/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 1:1385013/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 1:1702878/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtgg < 1:669937/140‑1 (MQ=255)
taccGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCCATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGTCGCTGGAAGTGAtggt > 1:3122619/3‑140 (MQ=255)
tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggtg > 1:87184/1‑140 (MQ=255)
tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGAtggtg > 2:4825417/1‑140 (MQ=255)
cTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTAc > 2:3728208/1‑140 (MQ=255)
cTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTAc < 2:1344460/140‑1 (MQ=255)
cTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTAc < 2:4920793/140‑1 (MQ=255)
gagaATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGt < 1:2192007/140‑1 (MQ=255)
agaATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTc < 2:2229555/140‑1 (MQ=255)
agaATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTc < 1:5226631/140‑1 (MQ=255)
agggCAACGGCATGTTGACAAAACTCAACCTCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTACATATTGGCGCGATTTTAACACCGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAACTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGCCAcc < 2:2034084/138‑1 (MQ=255)
tGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCg < 1:4636689/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTg > 2:2867702/1‑140 (MQ=255)
aaCGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTg < 1:4019746/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTg < 1:3880735/140‑1 (MQ=255)
tGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtg > 1:2497981/1‑140 (MQ=255)
acacAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgct < 1:580667/140‑1 (MQ=255)
aCTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTAtgttgctgttgc < 2:68770/140‑1 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATgttgctgttgct > 1:1755804/1‑140 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATgttgcggttgct > 1:3854208/1‑140 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGGCAGGGGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGTTACTGGTCACCGCCTGCGGGGGggtgctggtgct > 1:2060337/1‑140 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGAGATTGGCGCGATTTTAAAAGAGGTCGGTCATGTGCTGGATCAGGAAAGTCGGGTGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTGACGGCCGTCGGGGTggtgctgttgct > 2:317780/1‑140 (MQ=255)
cAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTgg < 2:4057489/140‑1 (MQ=255)
aaaCCGACAGTTCCCGAACATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTgg < 2:4276891/139‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 2:507688/140‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 1:5313524/140‑1 (MQ=255)
ccGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGcac < 2:310567/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcagg > 1:3187604/1‑140 (MQ=255)
aGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 1:5085584/140‑1 (MQ=255)
aGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 1:1055083/140‑1 (MQ=255)
gTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgc < 2:1180604/140‑1 (MQ=255)
gTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgc < 1:4746773/140‑1 (MQ=255)
ccGACCATTAGCCTGTTAGATCTAGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgcaggt > 2:3596935/1‑140 (MQ=255)
ccGACCATTAGCCTCTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgcaggt < 2:2115119/140‑1 (MQ=255)
ccATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCAGCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGa < 2:1284288/140‑1 (MQ=255)
ccATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGa < 1:4291761/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATg > 1:2828754/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATg > 2:81148/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATg > 1:3131935/1‑140 (MQ=255)
cTGTTAGATATGGGCGCCATTGTAAAAGCGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGTCGCTGTAAGTGATGCTGGTACAGGTTACTGCGTGCGGTATGGGGCTGTTGCTGGCACAGCTGCAGGTGGGACTgcgtca < 2:4868595/140‑1 (MQ=255)
gTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagc < 2:3516045/140‑1 (MQ=255)
ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg < 1:2241005/140‑1 (MQ=255)
ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcg > 2:611269/1‑140 (MQ=255)
atTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGtcatca < 1:2471587/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAgg > 1:7755/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAgg > 1:2780667/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCCGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTTGGAATGCGTCAGCGTCATCAgg > 2:4384480/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 2:3305138/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 1:1498033/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGGGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAg > 2:4463184/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGc < 1:3319793/140‑1 (MQ=255)
cgATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCtg > 1:2557240/1‑140 (MQ=255)
tAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg < 2:1616969/140‑1 (MQ=255)
tAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg < 1:5004686/140‑1 (MQ=255)
cAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGgcg < 2:5399915/140‑1 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTATGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 2:5011390/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATgttgctgttgct > 2:3405312/1‑84 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:1248725/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:538710/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 2:2790394/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:4189898/1‑140 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:907480/1‑140 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 2:579289/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 2:907480/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 2:1755804/140‑1 (MQ=255)
ggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGATGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACt < 2:249777/140‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCGGAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGGGATGGTGGTACTGGTCACCGGCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAAGGCGGCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGc < 2:2000083/140‑1 (MQ=255)
gTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGc < 2:5587519/140‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCg > 2:5544268/1‑140 (MQ=255)
cTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCggg < 2:1930036/140‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGa > 1:3953666/1‑140 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaa > 2:3058563/1‑140 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaa > 1:660176/1‑140 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCGGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaa > 1:1605934/1‑140 (MQ=255)
aggggaGTCGGACCCTGGAGGTCATCTTGGTACTGGTCGCCCTTCGCGGTTTTTTCCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACTCTCGGTGCGGGGaaaaaa < 2:434882/135‑1 (MQ=255)
aGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaaaaaa < 2:5335867/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCGTCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCGCACTCGGTGCGGGGATAAAAc > 2:4914877/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 2:126903/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 1:1816857/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 1:2291815/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 2:1003221/1‑140 (MQ=255)
tAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAActg < 1:4398515/140‑1 (MQ=255)
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CGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTG > SRR14920167.2426994/1‑151 (MQ=60)
GAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGGTGTGGTGTGAGT > SRR14920167.4796126/1‑151 (MQ=60)
AAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT < SRR14920167.2068823/151‑1 (MQ=60)
AAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT < SRR14920167.1885240/151‑1 (MQ=60)
AAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT > SRR14920167.1821785/1‑151 (MQ=60)
AAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT < SRR14920167.3702733/151‑1 (MQ=60)
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GAGCTGGCTTACCAGTTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGTTGTGGTGTGAGTT > NZ_CP025268/521364‑521660
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
