Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
879,908 |
A→G |
*304* (TAA→TAG) |
gsiD → |
glutathione ABC transporter permease GsiD |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 879,908 | 0 | A | G | 100.0%
| 563.9
/ NA
| 171 | *304* (TAA→TAG) | gsiD | glutathione ABC transporter permease GsiD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (38/133); total (38/133) |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
AATGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAATTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAG > NZ_CP025268/879771‑880044
|
aaTGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGtt > 1:4346903/1‑140 (MQ=255)
tttggacTCGATCGTATATGGTCTTCGACTCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCACTGGCTATTTTTCTGTCCTTTCTAGCTTTCAATTTTTTGGGCGATGGTTTACGCTATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGttt < 2:3098983/134‑2 (MQ=255)
gtGAGGCTCGGGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 1:2385403/139‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGCTATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 2:3928697/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATCTGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGCCCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 2:797831/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 1:2835970/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 1:1273963/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 1:391795/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 2:3631864/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 2:210060/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCTCGAGCGGATATGGTAATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGAGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTa < 2:4402021/140‑1 (MQ=255)
ggCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGtt < 2:2683789/140‑1 (MQ=255)
ggCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGtt < 1:1857391/140‑1 (MQ=255)
ggCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGtt > 2:5338317/1‑140 (MQ=255)
ggCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGAGGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGtt > 2:2350198/1‑140 (MQ=255)
gCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCACTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGttt > 2:2631732/1‑140 (MQ=255)
cTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATGAAAGGATAGTTACGTTTg > 2:3986401/1‑140 (MQ=255)
gAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAat > 2:349016/1‑140 (MQ=255)
aGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAata < 1:2094341/140‑1 (MQ=255)
aGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAata < 1:747648/140‑1 (MQ=255)
aGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGATGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAata < 1:4583069/140‑1 (MQ=255)
cGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATAtt < 1:1036268/140‑1 (MQ=255)
atatGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGGGAGGGTTTGCGCGATGCGCTGGATCCGAAAAGTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCt > 2:3316780/1‑140 (MQ=255)
atatGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCt > 1:2824578/1‑140 (MQ=255)
atatGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCt > 1:2824724/1‑140 (MQ=255)
tatGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCtt > 1:1938561/1‑140 (MQ=255)
atGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTg < 2:1401912/140‑1 (MQ=255)
atGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTg < 1:5426414/140‑1 (MQ=255)
tGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGa < 1:1654347/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGaa < 1:1951055/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGaa < 1:2250805/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGaa < 1:2437076/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGaa < 1:3783587/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGaa < 1:5016980/140‑1 (MQ=255)
tATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAgg < 1:5576823/140‑1 (MQ=255)
tCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGt < 2:5542321/140‑1 (MQ=255)
cgcgCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAgg > 2:1584755/1‑137 (MQ=255)
cgcgCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTa > 2:1466005/1‑140 (MQ=255)
cgcgCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTa > 2:4491908/1‑140 (MQ=255)
cgcgCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTa > 1:3819848/1‑140 (MQ=255)
cgcgCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTa > 1:309797/1‑140 (MQ=255)
gcgcCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGCTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTaa < 1:882658/140‑1 (MQ=255)
cgccgcATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAAt < 1:4186573/140‑1 (MQ=255)
ccgcATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCa < 1:880/140‑1 (MQ=255)
aTGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTc < 2:793906/140‑1 (MQ=255)
tGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTca < 2:3606611/140‑1 (MQ=255)
tGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGATTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTca < 2:4353278/140‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTcaca < 1:4800376/140‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGGTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTcaca < 2:1227453/140‑1 (MQ=255)
gcGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTcaca < 2:1227217/139‑1 (MQ=255)
cTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGa < 2:3668893/140‑1 (MQ=255)
cTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGa < 2:2660622/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTCTCCGGCCCTGGCTCGTTTTCTCACCGTACTGGCGTTCACTTTGTTGGGCGGTGGTTTTCGCGATGCGCTGGCTCCGAAAATTAAAGGATCGTTACGTTTGAATATTGCTTGCAAGGGTAATCACCTCACAGGa < 2:3004552/140‑1 (MQ=255)
tttCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAatta < 1:3465905/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGCCCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAattat < 2:1661225/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAattat < 2:2186327/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAattat < 1:349016/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGGTACGTTTTAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAattat < 2:3391168/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCCCTGGCTATTGTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCTCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAattat < 2:3713798/140‑1 (MQ=255)
ccGGCCCTGGCTATTTTTCTGCCCGTACTGGCGTTCACTTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCCCCTCACAGGAAATTATTg < 2:2459945/140‑1 (MQ=255)
ggCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGcc < 1:1031574/140‑1 (MQ=255)
ggCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGcc < 2:132867/140‑1 (MQ=255)
ggCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGcc < 1:3282757/140‑1 (MQ=255)
ggCCCTGGCTATTTTTCTCACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTCCGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAACGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGcc < 2:4338943/140‑1 (MQ=255)
ccTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTa < 2:1516659/140‑1 (MQ=255)
ggCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGc < 2:5196571/140‑1 (MQ=255)
ggCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGc < 1:326002/140‑1 (MQ=255)
gCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCa < 1:3712371/140‑1 (MQ=255)
gCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCa < 2:5407149/140‑1 (MQ=255)
cTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGCTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCaa < 2:4563501/140‑1 (MQ=255)
ttCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGtgttg < 1:1751365/140‑1 (MQ=255)
gcccGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAAc < 1:2831273/138‑1 (MQ=255)
aCCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCGCTAAGCAAGTGTTGTAACt > 2:4890697/1‑140 (MQ=255)
aCCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACt > 2:2260138/1‑140 (MQ=255)
tACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTct < 2:821681/140‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTctg > 1:4760184/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGTTCCATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCCATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGACAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTctgc < 2:1693925/140‑1 (MQ=255)
gCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGa < 2:3212380/140‑1 (MQ=255)
ttgttgGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGa < 1:5263738/140‑1 (MQ=255)
gATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTACAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTACCTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTaa < 2:218869/140‑1 (MQ=255)
aTGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCCTTAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTACAATCGGGTAAt < 1:4640989/140‑1 (MQ=255)
ggTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAAttt < 2:1664299/140‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGc > 1:2639688/1‑140 (MQ=255)
tGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGc < 1:5316838/140‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGc > 1:1462782/1‑140 (MQ=255)
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TTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGC < SRR14920167.1754958/151‑1 (MQ=60)
GCCCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGAT < SRR14920167.2837116/151‑1 (MQ=60)
GACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGAT < SRR14920167.2837515/151‑1 (MQ=60)
CAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGT < SRR14920167.1499590/151‑1 (MQ=60)
TTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATT < SRR14920167.2397457/151‑1 (MQ=60)
TTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATT < SRR14920167.5275681/151‑1 (MQ=60)
TGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGTATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTT < SRR14920167.3130819/151‑1 (MQ=60)
ATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCCTTAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTACAATCGGGTAATTTGGTTAAAAA < SRR14920167.4651428/151‑1 (MQ=60)
GGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGC > SRR14920167.1465755/1‑151 (MQ=60)
GGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGC > SRR14920167.3870879/1‑151 (MQ=60)
GGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGC < SRR14920167.1763904/151‑1 (MQ=60)
GGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGC > SRR14920167.2010673/1‑151 (MQ=60)
GGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGC > SRR14920167.2645122/1‑151 (MQ=60)
GGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGC > SRR14920167.2645121/1‑151 (MQ=60)
GTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCC > SRR14920167.307507/1‑151 (MQ=60)
CGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCCCCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGC < SRR14920167.4694761/151‑1 (MQ=60)
TGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGG < SRR14920167.5328842/151‑1 (MQ=60)
CGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGAC < SRR14920167.4690219/151‑1 (MQ=60)
CGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGAC < SRR14920167.3538340/151‑1 (MQ=60)
CGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGAC < SRR14920167.1266042/151‑1 (MQ=60)
GGATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATT < SRR14920167.1217000/151‑1 (MQ=60)
GATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTT < SRR14920167.296277/151‑1 (MQ=60)
GATCCGAAAATTAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTT < SRR14920167.296081/151‑1 (MQ=60)
AAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCAC < SRR14920167.936157/151‑1 (MQ=60)
AAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCAC < SRR14920167.1661887/151‑1 (MQ=60)
AGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAG < SRR14920167.1578799/151‑1 (MQ=60)
GGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGC > SRR14920167.520022/1‑151 (MQ=60)
GATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCG < SRR14920167.5326347/151‑1 (MQ=60)
GATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCG < SRR14920167.4181840/151‑1 (MQ=60)
GATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCG < SRR14920167.2803758/151‑1 (MQ=60)
ATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTACTCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGT < SRR14920167.2631583/151‑1 (MQ=60)
ATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGT > SRR14920167.594721/1‑151 (MQ=60)
ATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGT < SRR14920167.895964/151‑1 (MQ=60)
AGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTC < SRR14920167.1278486/151‑1 (MQ=60)
AGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTC < SRR14920167.3994968/151‑1 (MQ=60)
GTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCA > SRR14920167.742942/1‑151 (MQ=60)
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GAGCAATGCTCAATGAGGCTCGAGCGGATATGGTTATCGCGCCGCATGTCGCTGTTTTTCCGGCCCTGGCTATTTTTCTGACCGTACTGGCGTTCAATTTGTTGGGCGATGGTTTACGCGATGCGCTGGATCCGAAAATTAAAGGATAATTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCA > NZ_CP025268/879760‑880058
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |