Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,631,644 |
T→C |
I186V (ATT→GTT) |
dcp ← |
peptidyl‑dipeptidase Dcp |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,631,644 | 0 | T | C | 100.0%
| 970.9
/ NA
| 289 | I186V (ATT→GTT) | dcp | peptidyl‑dipeptidase Dcp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (166/123); total (166/123) |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GGCAAGCGCCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAATCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGA > NZ_CP025268/1631507‑1631780
|
ggCAAGCGCGGGTTGTGGGGTGTTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGCGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCa < 2:1622610/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGAccg < 1:1538191/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGAccg < 2:3638322/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGAccg > 1:577638/1‑140 (MQ=255)
ggTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGa < 1:3160808/140‑1 (MQ=255)
gttgttGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGat > 2:1366813/1‑140 (MQ=255)
ggtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTtgctg > 2:2090944/1‑140 (MQ=255)
ggtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTACCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACTAGAACGCCGGATTTATTtgctg > 2:3981503/1‑140 (MQ=255)
gtATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTtgctgc > 2:5175519/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAg > 1:4177973/1‑140 (MQ=255)
cagcGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTGTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGAAATCTCTTGCTCACTCATGCCTGCTAGCTGAGCGATCTGGTTGACAACCAGACCGCCGGGTTTATTTGCTAGCAGTAATc > 2:1027843/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 2:2257794/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 2:2375621/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 1:5178858/1‑140 (MQ=255)
cGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCt > 2:1855841/1‑140 (MQ=255)
gAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTgg > 1:2816541/1‑140 (MQ=255)
gAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTgg > 1:2955633/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATGCCTGCCAGCTGCTCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTa > 1:189426/1‑140 (MQ=255)
aGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGATTaaa > 2:4915598/1‑140 (MQ=255)
aGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTGCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTaaa > 1:2907111/1‑140 (MQ=255)
ccATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAAct > 1:3018144/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActgg < 2:3447631/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActgg < 1:3634063/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActgg < 2:1539334/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATGGATTGGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActgg < 2:5456709/140‑1 (MQ=255)
ttGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAActggct > 2:4188694/1‑140 (MQ=255)
ttATCCAGACCTTTCTCGCGAGCGGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGt < 2:3144991/140‑1 (MQ=255)
ttATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGt < 2:3210301/140‑1 (MQ=255)
ttATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGt < 1:4734708/140‑1 (MQ=255)
aTCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCa > 2:2131509/1‑140 (MQ=255)
aTCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCa < 1:2370278/140‑1 (MQ=255)
tCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATTGTGCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGTTTAAACTGGCTGGTCAg > 1:880602/1‑140 (MQ=255)
aGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCTCGATATCGTTCACATCCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGt < 2:3231411/140‑1 (MQ=255)
cccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGCTTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCg < 1:2508712/139‑1 (MQ=255)
aCCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCg > 1:5578032/1‑140 (MQ=255)
aCCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCg < 1:3878420/140‑1 (MQ=255)
aCCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCg > 1:1828215/1‑140 (MQ=255)
aCCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCg > 1:1768387/1‑140 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 1:5247204/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 1:5332023/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGc < 2:4464806/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:468185/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:4711316/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:3821778/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 2:512212/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTACTCACTCATCCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:1988401/140‑1 (MQ=255)
tttCTCGCGAGACGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAg < 1:43916/140‑1 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAgat > 1:2751696/1‑138 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCt > 2:4534390/1‑140 (MQ=255)
tctcGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCt > 2:61557/1‑140 (MQ=255)
cgcgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCt < 1:1138350/140‑1 (MQ=255)
cgcgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCt < 2:3715401/140‑1 (MQ=255)
cgcgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCt < 1:2742874/140‑1 (MQ=255)
cgcgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCt < 1:3957884/140‑1 (MQ=255)
cgAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGt > 1:4109556/1‑140 (MQ=255)
gccgccTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTAtt < 2:5342974/140‑1 (MQ=255)
ccgccTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTc > 1:2092148/1‑140 (MQ=255)
ctGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACt < 1:742941/140‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAt < 1:666136/140‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTGATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTCAt < 2:581222/140‑1 (MQ=255)
caaGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAt < 1:494948/138‑1 (MQ=255)
aGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAttt > 2:4072203/1‑140 (MQ=255)
aGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAttt > 2:2807420/1‑140 (MQ=255)
aGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCGGGTCAGGGTTGGAGCTTCTGGGTTAAGTACTTGTAAttt > 2:2764333/1‑140 (MQ=255)
gcgcAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAtttt < 1:1018611/140‑1 (MQ=255)
cgcAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTg > 2:3429123/1‑140 (MQ=255)
tcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCa > 2:1305801/1‑140 (MQ=255)
tcaTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCa > 1:339856/1‑140 (MQ=255)
aTTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAAt < 2:5544364/117‑1 (MQ=255)
tCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGtt < 2:4694368/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGTTATCGTTCACAACGAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGGAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTTCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGc > 2:283949/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGt < 2:1802175/83‑1 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGc > 1:3996075/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGc > 1:59674/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGc > 1:4627614/1‑140 (MQ=255)
ccAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCt < 2:26154/140‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCt < 2:4220414/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTc > 2:5392958/1‑140 (MQ=255)
gCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCg > 1:2306753/1‑140 (MQ=255)
gCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCg > 2:4559670/1‑140 (MQ=255)
cTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCgg < 1:1410757/140‑1 (MQ=255)
cTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCgg > 1:5395472/1‑140 (MQ=255)
tGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGc > 1:443677/1‑140 (MQ=255)
tGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGc > 1:4517/1‑140 (MQ=255)
cgcgATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCaa > 2:3527540/1‑140 (MQ=255)
gATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGa < 2:3068562/140‑1 (MQ=255)
tatCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACa < 2:1961517/140‑1 (MQ=255)
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TTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAG < SRR14920167.4745435/151‑1 (MQ=60)
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ATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCT < SRR14920167.2375217/151‑1 (MQ=60)
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GACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGT > SRR14920167.3602975/1‑151 (MQ=60)
GACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGT > SRR14920167.4118749/1‑151 (MQ=60)
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TTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACCGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGC < SRR14920167.4433155/151‑1 (MQ=60)
TTCCTGCCAGCTGCGCGATATAGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACAGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGC < SRR14920167.4433826/151‑1 (MQ=60)
AGCTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAA < SRR14920167.3485323/151‑1 (MQ=60)
CTGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAA < SRR14920167.1413584/151‑1 (MQ=60)
TGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAAC < SRR14920167.684942/151‑1 (MQ=60)
TGCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAAC < SRR14920167.580505/151‑1 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > SRR14920167.1298145/1‑151 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > SRR14920167.2583444/1‑151 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > SRR14920167.2032247/1‑151 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > SRR14920167.5595756/1‑151 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > SRR14920167.548117/1‑151 (MQ=60)
GCGCGATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACG > SRR14920167.1298130/1‑151 (MQ=60)
ATATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCGGGTCAGGGTGGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGAT > SRR14920167.1259157/1‑151 (MQ=60)
TATCGTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATG < SRR14920167.2119366/151‑1 (MQ=60)
GTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAACCTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGCTGAATC > SRR14920167.4842214/1‑151 (MQ=60)
GTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATC > SRR14920167.1747822/1‑151 (MQ=60)
GTTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCGGGTTAAAGTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCGCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATC > SRR14920167.156260/1‑151 (MQ=60)
TTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCA < SRR14920167.2756676/151‑1 (MQ=60)
TTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCA > SRR14920167.2339203/1‑151 (MQ=60)
TTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCA > SRR14920167.5195999/1‑151 (MQ=60)
TTCACAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCA > SRR14920167.8995/1‑151 (MQ=60)
CAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCACCTC > SRR14920167.684638/1‑151 (MQ=60)
CAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCACCTC > SRR14920167.3957789/1‑151 (MQ=60)
CAACCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCACCTC < SRR14920167.4240396/151‑1 (MQ=60)
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GATCGCGCATTTCGGCAAGCGCCGGTTGTTGGGTGGTATTCAGCAGCGGAATCAGCCATTTGTTATCCAGACCTTTCTCGCGAGCCGCCTCTGCCGCCAGCGCAATCTCTTGCTCACTCATTCCTGCCAGCTGCGCGATATCGTTCACAATCAGACCGCCGGATTTATTTGCTGCCAGTAATCGCTGGTTAAACTGGCTGGTCAGGGTCGCAGCTTCTGTATTCAGTACTTTTAATTTTGCTTTATCAGCTTGCGCAAGTTTGGCTCCGGCAAGGACAAAACGTTGATGAATCACCTC > NZ_CP025268/1631494‑1631791
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |