Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,764,495 |
(C)6→5 |
pseudogene (844/1222 nt) |
sufS ← |
cysteine desulfurase SufS |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,764,490 | 0 | C | . | 99.4%
| 1666.1
/ 0.5
| 351 | pseudogene (849/1222 nt) | sufS | cysteine desulfurase SufS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); major base . (162/185); minor base T (1/1); total (164/187) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 401 total aligned reads displayed.
TTGTGGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTT > NZ_CP025268/1764351‑1764624
|
ttGTGGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGc < 1:2300471/140‑1 (MQ=255)
gtgGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGccc < 2:2281899/140‑1 (MQ=255)
gtgGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATAAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGccc < 1:4667678/140‑1 (MQ=255)
ttggCCATAGCGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGcccc < 1:2479431/138‑1 (MQ=255)
tgGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGcccc < 1:3968498/140‑1 (MQ=255)
caggCCATACAGATTGACAGCCGGTACAGATTCCAGCTGGGATAGCGCATAATGCATCAGGTTCTGTTCATTCTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAACCAGAAGCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGcccc < 2:701040/138‑1 (MQ=255)
gggCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGccccc > 2:5433002/1‑140 (MQ=255)
cATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGcccccggta < 2:3696432/140‑5 (MQ=255)
agTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATGAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCGCGGTATTGGgtg > 1:4779213/1‑140 (MQ=255)
agTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGgtg > 2:4656988/1‑140 (MQ=255)
gTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGGATTGGgtga > 1:2995935/1‑139 (MQ=255)
tGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTa > 1:2206314/1‑140 (MQ=255)
tGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTa > 1:3860794/1‑140 (MQ=255)
gagaTCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTAc > 2:5205015/1‑140 (MQ=255)
tCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCCGCCCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGCATTGGGTGTACCCGc > 2:3228494/1‑140 (MQ=255)
ccGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCt < 2:3934474/140‑1 (MQ=255)
ggTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTc > 1:3493823/1‑140 (MQ=255)
ggTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTc > 1:978328/1‑140 (MQ=255)
ggTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTAGGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTc > 2:4251537/1‑140 (MQ=255)
aGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAAcc > 1:5371385/1‑140 (MQ=255)
gATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACACGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCCACGCCGCGCCAAGACCAACGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCg < 2:4835360/140‑1 (MQ=255)
ccgCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATg < 1:471499/138‑1 (MQ=255)
cAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATg < 1:4322777/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:3939570/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:662683/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 2:4524063/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:291807/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 2:1304026/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 2:4163723/140‑1 (MQ=255)
gtgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTCCAAACCGCCATGGTGCt < 2:104838/140‑1 (MQ=255)
tgATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCtt < 1:2010500/140‑1 (MQ=255)
gATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATTATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATTGTGCttt < 2:4436229/140‑1 (MQ=255)
aTAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCGTACGCGGGTATGTTATTAATCCTCAGTGCTGAAACGGGCTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATG‑CGTCCCCCGGTAGTGGGTGTACGGGCTTGTGACCGCGATGGTGCGTTg > 2:3591887/1‑140 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 1:77528/1‑133 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTcc > 2:5090905/1‑140 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTcc > 2:4353916/1‑140 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTcc > 1:585918/1‑140 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTcc > 1:3555541/1‑140 (MQ=255)
cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCCGCTATGTTATTAAGCCCCAGAGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTcc < 1:3707389/140‑1 (MQ=255)
tAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGt < 1:2224145/140‑1 (MQ=255)
tAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGt < 2:2846090/140‑1 (MQ=255)
aaTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTa < 1:4429778/140‑1 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:1163208/140‑1 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:1357837/140‑1 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:1810273/140‑1 (MQ=255)
aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:4104035/140‑1 (MQ=255)
cATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGc < 1:2828054/140‑1 (MQ=255)
aTCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGcc > 2:1473309/1‑140 (MQ=255)
gATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa < 2:2319122/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCCGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGCTCCAGGTAGCGCCTTCAc > 2:1860351/1‑140 (MQ=255)
tCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTc > 2:336878/1‑140 (MQ=255)
tCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCt > 1:163187/1‑140 (MQ=255)
tCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCt < 2:2051808/140‑1 (MQ=255)
tACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTATCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGAc > 1:3288168/1‑140 (MQ=255)
aCTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACg > 2:5307842/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGt < 1:3368986/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:2379965/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 1:4601058/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:3530474/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 1:1863775/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:3829629/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:1659015/140‑1 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc > 1:5116864/1‑140 (MQ=255)
gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc > 1:3196800/1‑140 (MQ=255)
gCTAAGTTCTCACGCCCCAGCCCCGAAACATACTCCAACGCCGCGCCACGCCCAAAGATG‑CCCCCGCTATCGTGTGTACCGTCTTCAGACCGCCATGGTCCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGCCTTACAGTGGc < 2:4002336/140‑1 (MQ=255)
tGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGCCTTCGAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCATTCACTCAGGGTGACGGTGGGGATc > 1:2695491/1‑140 (MQ=255)
tattcAGACCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATa < 2:2998969/140‑1 (MQ=255)
ttaAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGGACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTGGTGCCTACACTCAGGCTGACGGGTGCGATCATAGa > 2:195681/1‑140 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGCTG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAc < 2:2188005/140‑1 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAc > 2:558172/1‑140 (MQ=255)
aaGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCACCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCGTCACTCAGGCTGACCGTGGCGATCATAGAAc > 1:3118107/1‑140 (MQ=255)
ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTGCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGc > 1:171875/1‑140 (MQ=255)
ccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGccc > 2:1916481/1‑140 (MQ=255)
cAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc > 1:1668440/1‑123 (MQ=255)
cAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGcccc > 1:5289406/1‑140 (MQ=255)
gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCt > 1:3737979/1‑140 (MQ=255)
cGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTccc > 1:12301/1‑140 (MQ=255)
gAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCa < 2:4729616/140‑1 (MQ=255)
aTACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCAcggcg < 1:1263588/140‑1 (MQ=255)
aTACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCAcggcg > 2:1153081/1‑140 (MQ=255)
aCTTCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCAAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACggcggc < 1:1392532/140‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACggcggc < 1:4251537/140‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACggcggc < 1:2566957/140‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACggcggc < 2:2671737/140‑1 (MQ=255)
cTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCa < 2:2560334/140‑1 (MQ=255)
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ATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATC > SRR14920167.1632163/1‑151 (MQ=60)
ATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGCCTTCGAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCATTCACTCAGGGTGACGGTGGGGATC > SRR14920167.2701058/1‑151 (MQ=60)
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TCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAG < SRR14920167.211515/151‑1 (MQ=60)
CGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGA > SRR14920167.4403616/1‑151 (MQ=60)
GCTATGTTATTAAGCCGCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAC < SRR14920167.3124800/151‑1 (MQ=60)
GCTATGTTATTAAGCCGCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGAT‑TCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAC < SRR14920167.3124846/151‑1 (MQ=60)
GCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAC > SRR14920167.4155700/1‑151 (MQ=60)
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GCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAC < SRR14920167.1677684/151‑1 (MQ=60)
GCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAC < SRR14920167.1782227/151‑1 (MQ=60)
GCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAC < SRR14920167.2076533/151‑1 (MQ=60)
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ATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGC > SRR14920167.1729011/1‑151 (MQ=60)
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TATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCC < SRR14920167.250426/151‑1 (MQ=60)
ATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTCTTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCT > SRR14920167.3746084/1‑151 (MQ=60)
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GCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCA < SRR14920167.3449994/151‑1 (MQ=60)
CCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCAT < SRR14920167.4933521/151‑1 (MQ=60)
CCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCAT > SRR14920167.1244124/1‑151 (MQ=60)
ACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCtgtctcttatacacatctccgagccc > SRR14920167.651079/1‑125 (MQ=60)
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ATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGC < SRR14920167.1266160/151‑1 (MQ=60)
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CTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAAC > SRR14920167.1337332/1‑151 (MQ=60)
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GCCAAGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTC < SRR14920167.2182671/151‑1 (MQ=60)
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AGACCAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACAT < SRR14920167.3460596/151‑1 (MQ=60)
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CAATGATG‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACATAAAG < SRR14920167.2214373/151‑1 (MQ=60)
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GTTTTGTGGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCAACAAGGCTTCTTTCACATAAAGAATGCCAATTC > NZ_CP025268/1764348‑1764644
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |