Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,986,115 |
A→G |
*412* (TAA→TAG) |
aslB → |
anaerobic sulfatase maturase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,986,115 | 0 | A | G | 99.5%
| 1433.0
/ NA
| 431 | *412* (TAA→TAG) | aslB | anaerobic sulfatase maturase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base G (246/182); minor base T (0/2); total (247/184) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.83e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 440 total aligned reads displayed.
AATTATTTGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGG > NZ_CP025268/3985981‑3986250
|
aaTTATTTGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATc > 2:4681223/1‑140 (MQ=255)
tttGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATcggcgg > 2:1464055/1‑140 (MQ=255)
tttGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATcggcgg < 2:1568066/140‑1 (MQ=255)
tttGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATcggcgg > 1:4617533/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGgccgcc > 1:2880414/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGgccgcc > 2:5567518/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGgccgcc > 2:1826473/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGgccgcc > 2:2094281/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGgccgcc > 2:4379847/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCAACCTACAGCCGTGTCTTAAAGCAAGGGCTGATTTGCTGGAGCACGGTCGCCCGGACAGCGACATTATGCATGCGCATATGTTGGTGGGGAGAAAGAAGAAATAGGCGgccgcc > 2:5364169/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGGGTATCAGCGTTAGTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAAGGGCGGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGgccgcc > 2:4890364/1‑140 (MQ=255)
tgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCt > 1:3331049/1‑140 (MQ=255)
gggTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCgg > 2:3362655/1‑140 (MQ=255)
gggTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCgg > 1:3245801/1‑140 (MQ=255)
ggTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGt > 1:4690255/1‑140 (MQ=255)
tATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGa > 1:3412930/1‑140 (MQ=255)
aTTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGAt > 1:133564/1‑140 (MQ=255)
tttCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATg < 2:1229806/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATg > 1:683560/1‑140 (MQ=255)
tCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcg < 1:1533981/140‑1 (MQ=255)
tCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcg < 1:1361661/140‑1 (MQ=255)
cATCTACCGCCATATCTTAACGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTa < 2:2329236/140‑1 (MQ=255)
cATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTa < 1:635597/140‑1 (MQ=255)
aTCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTaa < 1:5500025/140‑1 (MQ=255)
cTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAAc > 1:1279253/1‑140 (MQ=255)
aCCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGc < 1:2825578/140‑1 (MQ=255)
cATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt > 1:1473111/1‑140 (MQ=255)
atatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 1:3514442/140‑1 (MQ=255)
atatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 2:2775123/140‑1 (MQ=255)
atatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGACGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 1:4769037/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCTCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGGAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:5174321/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:3704672/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:2096950/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:4094536/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:3808204/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:4184039/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:5417715/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:4328145/140‑1 (MQ=255)
atCTTAAAGCAATGGCTGAATTGCTGGCGCACGGTCGCACGGACAGCGACATTATGCCTGCGCATTTGCTGGCGGTGAGTAAGCAGAAATCGGCGCCCCCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:4527167/140‑1 (MQ=38)
tCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg > 1:900569/1‑140 (MQ=255)
tCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:3789003/1‑139 (MQ=255)
cTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 1:171102/140‑1 (MQ=255)
cTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 2:3697337/140‑1 (MQ=255)
aaGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTAc > 1:2758027/1‑140 (MQ=255)
aTGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGCCATTATGCAGGCGCCTTTGCTGGAGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGCTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 2:3088906/1‑140 (MQ=38)
aTGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 1:4841746/1‑140 (MQ=255)
aTGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 2:384662/1‑140 (MQ=255)
aTGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCACGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATGTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATGCGGTCTACATGAt > 2:1127035/1‑140 (MQ=39)
aTGGATGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 1:1053113/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATc > 1:4882745/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATc > 2:4179381/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATc > 2:2472055/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATc > 2:3284500/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATc > 2:4600523/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATc > 1:304750/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCaa > 1:2221700/1‑140 (MQ=255)
tttGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCaaa > 1:18685/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:890549/1‑117 (MQ=255)
gcgcACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATa < 1:4020347/140‑1 (MQ=255)
gcACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATGCAATaaa > 1:1990917/1‑140 (MQ=255)
cGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAGATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTg < 2:3906356/140‑1 (MQ=255)
gTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCa < 2:191257/140‑1 (MQ=255)
cGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGc < 2:4431461/140‑1 (MQ=255)
cGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTGGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGc < 2:2260160/140‑1 (MQ=255)
gCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCg < 1:4129748/140‑1 (MQ=255)
ccAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGt > 2:885951/1‑140 (MQ=255)
aGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAg > 1:1829452/1‑140 (MQ=255)
gCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAgg < 1:2427576/140‑1 (MQ=255)
gCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAgg < 1:5306665/140‑1 (MQ=255)
tATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATa > 2:497553/1‑140 (MQ=255)
tATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATa > 2:1784851/1‑140 (MQ=255)
tATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATa > 2:4752147/1‑140 (MQ=255)
tATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATa > 1:5081417/1‑140 (MQ=255)
gcatgcGCATTGGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGa < 2:424115/140‑1 (MQ=255)
gcgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCg > 2:2178025/1‑140 (MQ=255)
gcgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCg > 1:1173150/1‑140 (MQ=255)
gcgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCg > 1:1382195/1‑140 (MQ=255)
gcgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCg > 2:1964777/1‑140 (MQ=255)
gcgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCg > 2:2648310/1‑140 (MQ=255)
cgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGt > 2:862704/1‑140 (MQ=255)
cgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGt > 2:1329605/1‑140 (MQ=255)
cgcATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGt > 1:4220350/1‑140 (MQ=255)
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GTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGGCAGATCTCAGCG > SRR14920167.743235/1‑151 (MQ=60)
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AGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGGCAGATCTCAGCGAT < SRR14920167.3188253/151‑1 (MQ=60)
|
AACCGGGACTGAATTATTTGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGGCAGATCTCAGCGAT > NZ_CP025268/3985970‑3986264
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |