Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,219,803 |
T→C |
*135* (TAA→TAG) |
ycgX ← |
DUF1398 domain‑containing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,219,803 | 0 | T | C | 100.0%
| 423.1
/ NA
| 123 | *135* (TAA→TAG) | ycgX | DUF1398 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (99/24); total (99/24) |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGTTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAACAGTATT > NZ_CP025268/1219668‑1219939
|
ttAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGa > 2:2927572/1‑140 (MQ=255)
ttAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGa > 2:2927557/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTa < 1:3059377/140‑1 (MQ=255)
tCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTaa > 1:3136823/1‑140 (MQ=255)
tCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGAATTAATCATCAATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATTCCTTACTGAATTATGAAGCATATCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTaa > 2:7034662/1‑140 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATTAAAAGACAGTATTAATAATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCTAAAATGCTAATGCCTTAATGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt > 2:728453/1‑140 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt > 2:3780466/1‑140 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt > 1:6914586/1‑140 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt < 1:631825/140‑1 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt < 1:631704/140‑1 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt > 1:4808494/1‑140 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGt > 1:3852852/1‑140 (MQ=255)
gTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCAATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTCATGGt > 2:6440245/1‑140 (MQ=255)
attattTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTtta < 1:1228815/140‑1 (MQ=255)
attattTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTtta < 2:495828/140‑1 (MQ=255)
attattTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTtta < 2:6392058/140‑1 (MQ=255)
atGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTAtttt > 1:8278400/1‑140 (MQ=255)
atGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTAtttt > 1:8278729/1‑140 (MQ=255)
ggTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTAATGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGAGTAATGGTTTATTATTTTCTa > 1:7918887/1‑140 (MQ=255)
aCAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATc > 1:8174458/1‑140 (MQ=255)
aCAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATc > 2:7847462/1‑140 (MQ=255)
cAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCTATATATaa > 2:8812137/1‑140 (MQ=255)
cAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATaa > 2:3978470/1‑140 (MQ=255)
aaTCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGta < 1:3480388/140‑1 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCATTATATAAAAGCGTATTATCa > 2:3063522/1‑140 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCa > 1:2190571/1‑140 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCa > 2:4134294/1‑140 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCa > 1:8701385/1‑140 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCa > 1:1318590/1‑140 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCa > 2:3651391/1‑140 (MQ=255)
ccATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATATTCAATATATAAAAGCGTATTATCa > 2:5940248/1‑140 (MQ=255)
aTAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAAt < 2:2264681/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAAt < 2:4927048/140‑1 (MQ=255)
aTAGAGATAGTCTATGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAAt < 2:2264622/140‑1 (MQ=255)
agaGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAAATTTATCTCGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATATAAAATATATAATAGCGTATAATCAATGGAgtg > 2:7142857/3‑139 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTACGTATCCAACTTTAGCTAGAGTAATGGTTTGTTATTTTCTACTTCTTCAATCTATCAAAGCGTCTGATCACTGGCgtagt > 2:4678987/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTaa < 1:8094950/84‑1 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt > 2:3602531/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt > 2:4246359/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt < 2:751062/140‑1 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt > 2:8730799/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt > 1:1583733/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTAAATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt > 2:1925683/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACGTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCgtagt > 2:3714327/1‑140 (MQ=255)
tctcTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATTTAAAATCGTATTATCAATGGCGTAGTaa > 2:6559356/1‑140 (MQ=255)
tctGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACt > 2:3559063/1‑140 (MQ=255)
tGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCTTAGTAACTGc > 2:6360036/1‑140 (MQ=255)
tGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGc > 1:7136111/1‑140 (MQ=255)
aCTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGtt > 1:9294015/1‑140 (MQ=255)
ttttATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTg > 2:5765717/1‑140 (MQ=255)
tttATTTCCATTATGCTATTGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTATTATGTATCCTCCTTTAGCTAGATTAATGGGTTATTATTTTCTACATATTCAATATATAAAAGCGTATTTTCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGt > 2:3816021/1‑140 (MQ=255)
tttATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGt > 1:1217800/1‑140 (MQ=255)
tttATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGt > 1:7283352/1‑140 (MQ=255)
tttATTTCCATTATCCTAATGCCTTACTGAATTAAGAAGCCTTTCTTAAGTATACAACTTTACCTATATTAAAGGTTTAATATATTCTACATCTTCAATCTATAAAGGCGTATTAACACTGGCGTAGAAACTGCGTTTGt > 2:6932313/1‑140 (MQ=255)
ttATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGtt > 1:7637613/1‑140 (MQ=255)
tCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGAt > 1:4756927/1‑140 (MQ=255)
cATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTa < 2:9372027/140‑1 (MQ=255)
ttATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAAc < 1:3978470/140‑1 (MQ=255)
tATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACa > 2:9123489/1‑140 (MQ=255)
tATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACa > 1:523802/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTaa > 1:23685/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTaa > 1:5487747/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTaa > 1:6474881/1‑140 (MQ=255)
ttACTTAATTATGAAGCATTTCTAAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATAATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGAAGTAACTTCGTTATTTATGATTAACATCAGTAACCCAc > 2:680070/1‑140 (MQ=255)
ttACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTa > 1:2458656/1‑48 (MQ=255)
ttACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCAc < 1:5765717/140‑1 (MQ=255)
ttACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCAc > 1:4371009/1‑140 (MQ=255)
ttACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCAc > 1:4371166/1‑140 (MQ=255)
ttACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGGTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCAc > 2:3555014/1‑140 (MQ=255)
ttACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATACAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAATCGTATTATCAATGTCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATAAGTAACCCAc > 2:2659915/1‑140 (MQ=255)
tACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTa < 2:9339253/47‑1 (MQ=255)
tACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTa > 1:9339253/1‑47 (MQ=255)
tACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCAcc > 1:4836292/1‑140 (MQ=255)
tACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCAcc > 1:4836172/1‑140 (MQ=255)
aCTGAATTATGAATCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTaa > 2:1963318/1‑47 (MQ=255)
aCTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTaa < 1:1963318/47‑1 (MQ=255)
ttATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAAc > 1:8885250/1‑140 (MQ=255)
ttATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAAc > 2:1524350/1‑140 (MQ=255)
ttATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAAc > 2:5050356/1‑140 (MQ=255)
ttATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTATATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAAc > 2:142552/1‑140 (MQ=255)
aTGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGc < 2:8257733/140‑1 (MQ=255)
tGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTATACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGcc > 1:7693605/1‑140 (MQ=255)
aaGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACTTCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTCACCCACCGGAAAACGCCcg > 2:6262276/1‑140 (MQ=255)
aaGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCcg > 2:6261519/1‑140 (MQ=255)
aaGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCcg > 1:7443123/1‑140 (MQ=255)
aGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCcgc < 2:3852852/140‑1 (MQ=255)
cATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTAGCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCgcgc > 1:5593056/1‑140 (MQ=255)
tCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGc < 1:3391197/140‑1 (MQ=255)
ttAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCa < 2:5483130/140‑1 (MQ=255)
aTCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTg > 1:9265000/1‑140 (MQ=255)
tCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATTGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAACACGCCCGAGCCTGCCAGtgatga > 2:6527752/1‑140 (MQ=255)
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TTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGA > SRR14920173.9064527/1‑151 (MQ=60)
TCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAAC < SRR14920173.3411104/151‑1 (MQ=60)
TCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAAC < SRR14920173.1670048/151‑1 (MQ=60)
ACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAACAGTATTCCCGAAA > SRR14920173.7709288/1‑151 (MQ=60)
TAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAACAGTATTCCCGAAATGTA > SRR14920173.5905392/1‑151 (MQ=60)
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TCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGTTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAACAGTATTCCCGAAATGTA > NZ_CP025268/1219654‑1219950
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
