Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,038,677 |
T→C |
*578* (TAA→TAG) |
recJ ← |
single‑stranded‑DNA‑specific exonuclease RecJ |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,038,677 | 0 | T | C | 99.8%
| 1909.2
/ NA
| 546 | *578* (TAA→TAG) | recJ | single‑stranded‑DNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (318/227); minor base A (1/0); total (319/227) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
TCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGTTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAGCAA > NZ_CP025268/3038540‑3038813
|
tCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTa > 1:4419464/1‑140 (MQ=255)
cGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTaaa < 2:2325003/140‑1 (MQ=255)
gTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAAt < 2:3105307/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTCCTGAATGCGATTATTTCCCGGATTAATTTCAAACCTGGTCTGATTTGTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAAtt > 2:3688496/1‑140 (MQ=255)
aGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTgg < 1:1904974/140‑1 (MQ=255)
aGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTgg < 1:8025391/140‑1 (MQ=255)
aGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTgg < 1:4264475/140‑1 (MQ=255)
aGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTgg < 1:3702565/140‑1 (MQ=255)
ggaccTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGc < 2:8473006/137‑1 (MQ=255)
ggTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGc < 2:2567418/140‑1 (MQ=255)
ggTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGc < 1:8640626/140‑1 (MQ=255)
gTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGcc < 1:1120436/140‑1 (MQ=255)
ccTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAg > 1:997428/1‑140 (MQ=255)
cTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATTACGCTAAATTGGCCAGa > 2:3030832/1‑140 (MQ=255)
cTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGa > 1:5465825/1‑140 (MQ=255)
tGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGat > 1:7164846/1‑140 (MQ=255)
tGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGat > 1:9318362/1‑140 (MQ=255)
tGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTGATATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGat > 2:1568239/1‑140 (MQ=255)
aaTGCGATTATTTACGGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGACAGatat > 2:1320943/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCg > 1:3328065/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCg > 2:604976/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCg > 1:8895917/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCg > 2:6487715/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCg > 2:678307/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTACCCGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTTTCg > 2:8712359/1‑140 (MQ=255)
attattTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCga > 2:6990143/1‑140 (MQ=255)
attTACCGGATGAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCgatga < 2:6380763/140‑1 (MQ=255)
tttACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCgatgat > 1:7351810/1‑140 (MQ=255)
ggATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTg < 1:5836123/140‑1 (MQ=255)
aTTAATTTCACACATGGTCTGATTTCTTTTATAGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCTGTATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCa < 2:8367311/140‑1 (MQ=255)
tAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAgg > 1:538328/1‑140 (MQ=255)
tgtCAAACATGGTATGATTTCTTTTCTTGAGCTAGTCAAAATTCTCTGATAAGAGCGGGATTGTACCCACTCCACGCTCTTTTTTATCGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTAGATGATAAATTGCGGGCTg > 2:6320063/3‑140 (MQ=255)
aCATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTg > 1:6184235/1‑140 (MQ=255)
tGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCATGCTGCGGTTGCcg > 2:2429272/1‑140 (MQ=255)
ggTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCcgc > 2:4202143/1‑140 (MQ=255)
tGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGGTTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGaaa < 2:3325278/140‑1 (MQ=255)
tGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGaaa < 2:4023748/140‑1 (MQ=255)
tGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGaaa < 1:7618174/140‑1 (MQ=255)
tGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGaaa < 2:7106833/140‑1 (MQ=255)
ttCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCg < 2:6122101/140‑1 (MQ=255)
tCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGt < 1:19585/140‑1 (MQ=255)
tCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGt < 1:3785841/140‑1 (MQ=255)
tttATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGTCCAGATATTGTCGATGAGAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGa > 2:7341257/1‑140 (MQ=255)
tttATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGa > 1:2239686/1‑140 (MQ=255)
ttGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATc < 2:5301064/140‑1 (MQ=255)
gcgCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGa < 1:2602225/138‑1 (MQ=255)
gAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGa < 2:1687619/140‑1 (MQ=255)
gAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGa < 2:7765739/140‑1 (MQ=255)
cTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGTGAAGTTGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGAAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGcg > 2:9155223/1‑139 (MQ=255)
cTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGTTAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCt > 1:1460350/1‑140 (MQ=255)
cTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCt > 1:9171688/1‑140 (MQ=255)
gTCAAAATNCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGANGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTtat > 1:6294686/1‑140 (MQ=255)
gTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTtat > 1:4836512/1‑140 (MQ=255)
cAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATaa < 2:9332346/140‑1 (MQ=255)
cAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATaa < 1:3953497/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCACTCCACGCTCTTTTTTATCGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGc < 2:8025706/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGCTGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGc < 2:66600/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGc < 2:8911979/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGc < 1:3487049/140‑1 (MQ=255)
ggTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTg > 1:7784373/1‑140 (MQ=255)
gTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGc > 2:3566194/1‑140 (MQ=255)
tAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACtt < 2:4355725/140‑1 (MQ=255)
aaGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTc < 2:7516098/140‑1 (MQ=255)
gggATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCAc > 2:5596309/1‑140 (MQ=255)
gATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTTCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGc > 1:2514050/1‑140 (MQ=255)
gATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGACACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGc > 2:4151820/1‑140 (MQ=255)
gATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGc > 2:1875323/1‑140 (MQ=255)
gATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGc > 2:5955975/1‑140 (MQ=255)
ttGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCg > 1:1261221/1‑140 (MQ=255)
tACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTa < 2:2987610/140‑1 (MQ=255)
tACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTa > 1:2807730/1‑140 (MQ=255)
tACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGAGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTa > 2:3841887/1‑140 (MQ=255)
aCCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGGTAt > 1:6464746/1‑140 (MQ=255)
aaTCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCgg > 1:8346123/1‑140 (MQ=255)
aaTCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCgg > 1:5707123/1‑140 (MQ=255)
tCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTCAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGcc > 1:6830482/1‑140 (MQ=255)
tCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGcc > 2:4807259/1‑140 (MQ=255)
cACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCag < 1:8767213/140‑1 (MQ=255)
aCGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCaga > 1:6567318/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCaga > 2:5009826/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCaga < 1:5003188/140‑1 (MQ=255)
aCGCTCTTTTTGATAGAGAAGATGAGGCTAAATGGGCCAGATATTGTCGATGATAATGTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTGGATATCGAGCTGTTAAGCCAGTTGCACGTCGCGCACGCCGTGCTCCGGCCagc > 2:4764745/1‑139 (MQ=255)
ctctTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAggg < 1:5100694/140‑1 (MQ=255)
ctctTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAggg < 1:8240411/140‑1 (MQ=255)
ttttATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTa > 1:9440255/1‑140 (MQ=255)
tataGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCg < 2:5465825/140‑1 (MQ=255)
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agaagaTGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACAtt < 1:1655847/140‑1 (MQ=255)
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CTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCT > SRR14920173.9225580/1‑151 (MQ=60)
CTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCT < SRR14920173.5072677/151‑1 (MQ=60)
TTATTGAGCTAGTCAAAATNCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGANGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTAT > SRR14920173.6331537/1‑151 (MQ=60)
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GAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCC > SRR14920173.1922421/1‑151 (MQ=60)
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AGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTG > SRR14920173.7830607/1‑151 (MQ=60)
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AGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTG > SRR14920173.1980114/1‑151 (MQ=60)
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GTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGC > SRR14920173.2125621/1‑151 (MQ=60)
GTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGC > SRR14920173.8156057/1‑151 (MQ=60)
GTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGC > SRR14920173.6504191/1‑151 (MQ=60)
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CAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCAC < SRR14920173.3976522/151‑1 (MQ=60)
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GGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCA < SRR14920173.3373387/151‑1 (MQ=60)
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GATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGC > SRR14920173.8819842/1‑151 (MQ=60)
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TAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCG > SRR14920173.1268563/1‑151 (MQ=60)
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AGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGAT‑ATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATC < SRR14920173.3051336/151‑1 (MQ=60)
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ACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGG > SRR14920173.8346201/1‑151 (MQ=60)
CCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGCAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGG < SRR14920173.2292649/151‑1 (MQ=60)
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ATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGT > SRR14920173.4545075/1‑151 (MQ=60)
ATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGT > SRR14920173.2140245/1‑151 (MQ=60)
ATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGT > SRR14920173.3747242/1‑151 (MQ=60)
ATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGT > SRR14920173.4001387/1‑151 (MQ=60)
CCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTAT < SRR14920173.9062147/151‑1 (MQ=60)
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CACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATC < SRR14920173.8819417/151‑1 (MQ=60)
CACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATC < SRR14920173.6228867/151‑1 (MQ=60)
ACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCG < SRR14920173.5032204/151‑1 (MQ=60)
GCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGAC < SRR14920173.4129305/151‑1 (MQ=60)
CTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACA < SRR14920173.8289442/151‑1 (MQ=60)
CTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACA < SRR14920173.5130262/151‑1 (MQ=60)
CTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATT > SRR14920173.4200746/1‑151 (MQ=60)
CTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATT > SRR14920173.2572441/1‑151 (MQ=60)
CTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATT > SRR14920173.2915378/1‑151 (MQ=60)
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TTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAG > SRR14920173.7677184/1‑151 (MQ=60)
TATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAGC < SRR14920173.6053449/151‑1 (MQ=60)
TATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAGC < SRR14920173.6431755/151‑1 (MQ=60)
AGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAGCAAT > SRR14920173.7077585/1‑151 (MQ=60)
GAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAGCAATA > SRR14920173.5490109/1‑151 (MQ=60)
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AACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGTTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGGCGGTATCGACATTAAAAGCAATACCATCCAGCAG > NZ_CP025268/3038527‑3038826
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |