Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,665,674 |
T→C |
*275* (TAA→TAG) |
gadX ← |
acid resistance transcriptional activator GadX |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,665,674 | 0 | T | C | 100.0%
| 1306.2
/ NA
| 376 | *275* (TAA→TAG) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (290/86); total (290/86) |
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
AGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATAATAA > NZ_CP025268/3665537‑3665809
|
aGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta < 2:6862764/140‑1 (MQ=255)
gTTATATTTCACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTAGAACGGGTTATGAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGGCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTTATGTCTGCGTAAAACTCta < 2:5214904/140‑1 (MQ=255)
aaCTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAATACTCTATAATCTTAtt > 1:3190908/1‑140 (MQ=255)
aaCTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAtt > 2:1886229/1‑140 (MQ=255)
aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttc > 1:9353120/1‑140 (MQ=255)
tGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCg < 2:6211134/140‑1 (MQ=255)
gagaGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACTGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGACGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttcctc > 2:7987773/1‑138 (MQ=255)
agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 1:8905103/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 1:5608713/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 1:4601793/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 1:3618451/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTGATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTTTGCCGGG‑TTTTGTTTATGTCTGAGTACAACGCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 2:7056764/1‑140 (MQ=255)
cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 1:6653266/1‑140 (MQ=255)
cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 1:1288201/1‑140 (MQ=255)
cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 1:5356648/1‑140 (MQ=255)
cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 2:75549/1‑140 (MQ=255)
cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATAAGTCTGGAGACTGCAGACTAACCTATTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGATTAAAACTCTATAATATTATTCATTCCGCAGAAc > 2:3405967/1‑140 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt < 1:5538376/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 2:8815666/1‑140 (MQ=255)
aGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCa > 2:6794359/1‑140 (MQ=255)
gCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTaaa > 2:1638358/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATGACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCATCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 1:6309882/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 2:5363994/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 2:4426751/1‑140 (MQ=255)
gtTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTgcgc > 1:168754/1‑140 (MQ=255)
ttATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGca > 2:5549222/1‑140 (MQ=255)
ttATAACGGGTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCACAACCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAAACCTTCAGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGca > 1:4042438/1‑140 (MQ=255)
ataACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaac > 1:4954908/1‑140 (MQ=255)
taACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaaca > 2:1322264/1‑140 (MQ=255)
aaCGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTCTAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTACCTTGCTcaacaa > 2:3890607/1‑140 (MQ=255)
aaCGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaacaa > 2:2609700/1‑140 (MQ=255)
cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcaacaaaa > 1:9170825/1‑138 (MQ=255)
cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATa > 1:5005306/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTCTCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑‑TTTTTTGAGGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTCATAATTCCCTTGCGCTACAAGACtt > 1:4382351/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGTTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAATAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 2:6919464/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 2:7790260/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 2:718095/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:8671040/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:2904098/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 2:9051874/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:420434/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:7569702/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:4226103/1‑140 (MQ=255)
tttATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACtt > 1:7757925/1‑140 (MQ=255)
attaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTgcc > 2:9124582/1‑140 (MQ=255)
tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 2:6661739/1‑140 (MQ=255)
tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 1:1427466/1‑140 (MQ=255)
tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 1:3341018/1‑140 (MQ=255)
gagaCGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCa > 1:4344153/1‑140 (MQ=255)
gaCGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAAGTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACg < 2:6034903/140‑1 (MQ=255)
ggCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGtt > 1:5152542/1‑140 (MQ=255)
ggCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGtt > 1:4052707/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTc > 1:1516568/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTc > 1:6896853/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTc > 2:4037233/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTATCCTCNTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTc > 1:6232559/1‑140 (MQ=255)
cAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCg > 2:1136043/1‑140 (MQ=255)
gACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGAc < 2:5005306/140‑1 (MQ=255)
gACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGAc < 2:4290551/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAAtctc > 2:534018/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGTTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCGATAATATTATTCCATCCGCAGAACGGGCAGTGCAGTAAAAAATCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcg > 1:7690010/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcg < 2:4598135/140‑1 (MQ=255)
ttCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcg > 2:4060228/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcg > 2:1057668/1‑140 (MQ=255)
tCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTgcgc > 2:1810521/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 2:3157206/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 2:2369724/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 1:7293049/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt < 1:8155729/140‑1 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 2:8499165/1‑140 (MQ=255)
ggTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 2:5682206/1‑140 (MQ=255)
tCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCg > 2:8338965/1‑140 (MQ=255)
ccccTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:347253/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:6945258/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 2:3530039/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:7100235/140‑1 (MQ=255)
ccccTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:2116041/140‑1 (MQ=255)
ccTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTc > 1:1048119/1‑140 (MQ=255)
tATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCt > 2:7371100/1‑140 (MQ=255)
tATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCt < 2:7668128/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCGATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGa > 2:2841923/1‑140 (MQ=255)
gCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGAt < 1:8475276/140‑1 (MQ=255)
cGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGCCAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATAc > 2:4695513/1‑140 (MQ=255)
cGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATAc > 2:4753236/1‑140 (MQ=255)
cGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATAc > 2:2073565/1‑140 (MQ=255)
cGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATAc > 2:2423753/1‑140 (MQ=255)
gg‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATActc > 2:6311265/1‑140 (MQ=255)
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gg‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATActc > 2:5727809/1‑140 (MQ=255)
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TGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGG < SRR14920173.2319948/151‑1 (MQ=60)
GCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTCTTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGC < SRR14920173.1432963/151‑1 (MQ=60)
GCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGC < SRR14920173.8525793/151‑1 (MQ=60)
CCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCG < SRR14920173.4201762/151‑1 (MQ=60)
CCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCG < SRR14920173.6611133/151‑1 (MQ=60)
CGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGT < SRR14920173.8769474/151‑1 (MQ=60)
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CAGTAAAAGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGG‑TTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATAATAATTTCGAAAGACGTAA > NZ_CP025268/3665530‑3665824
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |