Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R3
|
779 |
308.9 |
10220750 |
96.7% |
9883465 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,249,624 |
C→T |
intergenic (+117/‑30) |
mzrA → / → yqjC |
EnvZ/OmpR regulon moderator MzrA/DUF1090 family protein YqjC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,249,624 | 0 | C | T | 99.1%
| 1269.6
/ NA
| 344 | intergenic (+117/‑30) | mzrA/yqjC | EnvZ/OmpR regulon moderator MzrA/DUF1090 family protein YqjC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (170/171); minor base G (3/0); total (173/171) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
AACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAG > NZ_CP025268/3249487‑3249760
|
aCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAgg > 1:4622111/1‑140 (MQ=255)
tcATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCg < 2:3779561/140‑1 (MQ=255)
tcATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCg > 1:1777374/1‑140 (MQ=255)
cATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGa < 1:1285624/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAAGAGGTCCGaa > 2:3515300/1‑140 (MQ=255)
cGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATc < 1:4587767/140‑1 (MQ=255)
aTAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:2700491/140‑1 (MQ=255)
aTAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCGATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTGCCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:2592542/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGtt > 1:3044995/1‑140 (MQ=255)
ccTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCa > 1:4337401/1‑140 (MQ=255)
ccTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCa > 2:2974644/1‑140 (MQ=255)
cTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa < 1:4952061/140‑1 (MQ=255)
cTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACCACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa < 1:3725273/140‑1 (MQ=255)
tGTTATCCGCAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATCGGTCCCAACCACAATGGACGGTTCAAg > 1:3462808/1‑140 (MQ=255)
aTCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATg < 1:1693947/140‑1 (MQ=255)
tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGa > 2:1537171/1‑126 (MQ=255)
tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGAGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGa > 2:4327099/1‑140 (MQ=255)
ccGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAAGGaa > 1:2359180/1‑140 (MQ=255)
tatCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCa < 1:2197014/140‑1 (MQ=255)
tatCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCa < 2:3955042/140‑1 (MQ=255)
atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCAt < 1:184568/140‑1 (MQ=255)
atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCAt > 1:4429713/1‑140 (MQ=255)
atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTAGTTAACATAACCGCTTCGTTGTATGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGGTCAAGAATGAAATACAGCAt > 2:1008983/1‑140 (MQ=255)
actcactTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGc > 1:4474426/1‑140 (MQ=255)
ctcactTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCt > 1:263237/1‑140 (MQ=255)
ctTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg < 1:4170667/140‑1 (MQ=255)
ctTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAAGAGCGCATCGCTTTAg > 2:4758064/1‑140 (MQ=255)
ttGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCt < 1:1963377/140‑1 (MQ=255)
gATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtc < 2:611283/140‑1 (MQ=255)
tttCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctc > 1:3011873/1‑140 (MQ=255)
tCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGTTGGTTAACACTACCGCTGCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctctc > 1:873468/1‑140 (MQ=255)
tCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctctc > 2:401685/1‑140 (MQ=255)
tCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctctc > 1:3261154/1‑140 (MQ=255)
ccGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCttt < 1:1047327/140‑1 (MQ=255)
cGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTg < 2:2182415/140‑1 (MQ=255)
gTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGc > 1:5002516/1‑140 (MQ=255)
aaCTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGCCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGctc < 1:2675400/140‑1 (MQ=255)
aaCTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGctc > 1:3205030/1‑140 (MQ=255)
cTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCtt < 1:4290491/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCtt > 1:3129489/1‑140 (MQ=255)
tCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGt > 2:3677935/1‑140 (MQ=255)
tCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGt > 2:4549962/1‑140 (MQ=255)
tCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGt > 1:1412596/1‑140 (MQ=255)
aTGATTATTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTCATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGcc < 2:1471039/140‑1 (MQ=255)
tGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCg < 1:1159905/140‑1 (MQ=255)
tGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCg < 1:2458122/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGCGGTGGTTAACCCTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGt < 1:2138315/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGt < 1:2810658/140‑1 (MQ=255)
gtGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCAGCGCTTTAGCTGATTGTCTATATGCTCATAGAGCAGGTAgct > 2:3564771/2‑138 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCTAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 1:4241385/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCt > 2:1890978/1‑103 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCtt > 1:2039959/1‑127 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 2:2291546/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 2:89315/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCGTTGTAAGAGGGCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 1:1476680/1‑140 (MQ=255)
tGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa < 2:1321981/140‑1 (MQ=255)
gAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGGCCGAATCACAATGGAAGGGTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTATTTAt > 2:1564388/1‑140 (MQ=255)
ggCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtc > 1:3770918/1‑110 (MQ=255)
gCGGTCGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGCATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGcc < 2:2855395/140‑1 (MQ=255)
tggtggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 1:4507264/139‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 2:1850276/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 1:822441/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 2:393948/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 1:948901/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 2:3394689/140‑1 (MQ=255)
ggtggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCAc < 1:4815190/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:3268337/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:3342613/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:3582468/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:363252/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 2:2435888/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGCCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGCATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 2:783147/140‑1 (MQ=255)
acacTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCtgt > 1:1085715/1‑140 (MQ=255)
tACCGCATCGTTGTCGGGACAAGCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATAACAAGGGAAGGTTCAAGAAAGAAATATCGCATCGCTGTAGCAGAATCTCTCGTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCa > 2:557080/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTGCCCTGTGTCAgg > 2:3612387/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg < 2:856923/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 1:626620/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCGGGAAAAg > 2:1093576/1‑140 (MQ=255)
ttGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAg > 1:5074091/1‑140 (MQ=255)
ttGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAg > 2:823341/1‑140 (MQ=255)
ttGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAg < 1:559602/140‑1 (MQ=255)
ttGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAg > 2:4703180/1‑140 (MQ=255)
tGGACACTCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:323409/140‑1 (MQ=255)
tGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:1636078/140‑1 (MQ=255)
tGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:4984685/140‑1 (MQ=255)
tGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa > 2:424634/1‑140 (MQ=255)
tGGACAATCGTTCATTTGTAATAGGTCAGAATCACCATGGATGGTTCAAGAATGCACTACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGGTCTTAGGGCCGGTACTTATGCCACTACCCTGGGGCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:3455392/140‑1 (MQ=255)
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GTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGA < SRR14920166.1451529/151‑1 (MQ=60)
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GTTAACACTACCGCTTCCTTGTCTGGATCATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGCATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCCGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGA < SRR14920166.595585/151‑1 (MQ=60)
GTTAAAAATACCGTTTCGTTGTCTGGAAAATAGTTCCTTTGTCATAGGTCCGAATCAAAATAGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGA < SRR14920166.680700/151‑1 (MQ=60)
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TAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAAACACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTGAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAA > SRR14920166.2841462/1‑151 (MQ=60)
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CACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGG < SRR14920166.3272551/151‑1 (MQ=60)
CTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAG > SRR14920166.5084896/1‑151 (MQ=60)
CCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAA > SRR14920166.3283344/1‑151 (MQ=60)
CTTAGTTGTCTGCACAATCGTTCCTTTGTCATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGAATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAAT < SRR14920166.3880702/151‑1 (MQ=60)
TTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCT < SRR14920166.560882/151‑1 (MQ=60)
GTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAATGAGCAAAATATCCTTA > SRR14920166.4084929/1‑151 (MQ=60)
GTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTA > SRR14920166.1553812/1‑151 (MQ=60)
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GTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTA > SRR14920166.2018074/1‑151 (MQ=60)
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TGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGG < SRR14920166.5054638/151‑1 (MQ=60)
GGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGA > SRR14920166.550564/1‑151 (MQ=60)
ACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGA < SRR14920166.3379595/151‑1 (MQ=60)
ATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCA > SRR14920166.1921551/1‑151 (MQ=60)
TCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAG < SRR14920166.4379241/151‑1 (MQ=60)
CGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGC < SRR14920166.3846161/151‑1 (MQ=60)
CGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAACGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGC < SRR14920166.3161944/151‑1 (MQ=60)
GTTCCTTTGTAATACGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCAGTTTCTCTCGTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTAGGCCACTACCCTGTGTGAGGAGAAGAAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCT > SRR14920166.4009570/1‑151 (MQ=60)
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CCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATG > SRR14920166.1029186/1‑151 (MQ=60)
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CTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATGC > SRR14920166.477237/1‑151 (MQ=60)
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TTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAAGATCCTTAAGGAGATCAGCTATGCCG > SRR14920166.5004081/1‑151 (MQ=60)
TGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATGCCGA > SRR14920166.1042046/1‑151 (MQ=60)
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TAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacatgcgcagatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaacaaaaatatatatcaaacaaaagccgagcccggaga > SRR14920166.4754477/1‑43 (MQ=60)
TAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATGCCGAAA > SRR14920166.3278129/1‑151 (MQ=60)
TAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATGCCGAAAAAC < SRR14920166.3567954/151‑1 (MQ=60)
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CCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAGCTATGCCGAAAAAC > NZ_CP025268/3249474‑3249774
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
