Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,684,318 |
T→C |
*663* (TAA→TAG) |
hmsP ← |
biofilm formation regulator HmsP |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,684,318 | 0 | T | C | 99.7%
| 1054.4
/ NA
| 304 | *663* (TAA→TAG) | hmsP | biofilm formation regulator HmsP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (175/128); minor base A (1/0); total (176/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGTTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAAT > NZ_CP025268/3684181‑3684452
|
aCCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTGTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTa > 1:1266461/1‑140 (MQ=255)
aCCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCGGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTTAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTa > 2:5950699/1‑140 (MQ=255)
cccgCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:5615910/4‑140 (MQ=255)
ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATCATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTGAAAGGTGTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:6333053/1‑140 (MQ=255)
ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:3988659/1‑140 (MQ=255)
ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 1:5810530/1‑140 (MQ=255)
ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTGTGGGGTAGCTAc > 1:1094947/1‑140 (MQ=255)
ccTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTGTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAc > 2:16938/1‑140 (MQ=255)
gCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACttt > 1:1406317/1‑140 (MQ=255)
gCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTCTAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttct > 2:5856093/1‑140 (MQ=255)
gCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttct > 1:4676902/1‑140 (MQ=255)
ccTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTATTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTttctt < 2:4199696/140‑1 (MQ=255)
aaCACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAc < 1:1627839/140‑1 (MQ=255)
acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 1:3041133/1‑140 (MQ=255)
acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 2:3880237/1‑140 (MQ=255)
acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 2:1794509/1‑140 (MQ=255)
acacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAct > 1:605159/1‑140 (MQ=255)
cacCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAActc > 1:942301/1‑140 (MQ=255)
acCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTATGGGTAGCTACTTTTATTCCAGGTAActct > 2:1026773/1‑140 (MQ=255)
aGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAATGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTGCCAGGTAACTCTCTTc > 2:2392815/1‑140 (MQ=255)
aGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTc > 2:4418857/1‑140 (MQ=255)
aGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTc > 2:4305614/1‑140 (MQ=255)
gACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGATAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCg < 2:2008273/140‑1 (MQ=255)
acaacaTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGa > 2:3847163/1‑140 (MQ=255)
acaTCACATAAATGTAACTGGATCATAATTGAAACAAAAATGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCATCACATTTTAAAGTTTTGTAATCATTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGa < 2:3260242/140‑1 (MQ=255)
acaTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGa < 2:4868440/140‑1 (MQ=255)
caTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAt > 1:84404/1‑140 (MQ=255)
caTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAt > 2:271851/1‑140 (MQ=255)
caTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGATGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAt > 2:468505/1‑140 (MQ=255)
tCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAttt > 1:5912395/1‑140 (MQ=255)
tCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGAttt > 1:1871629/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAg > 1:102046/1‑140 (MQ=255)
aTGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAATGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCAATTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTGTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAGTCTCTTCGAAGATTTCAATAggg > 2:150053/1‑140 (MQ=255)
aTGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAggg < 1:4126541/140‑1 (MQ=255)
aTGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAggg > 2:1329215/1‑140 (MQ=255)
aTGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAggg > 2:821433/1‑140 (MQ=255)
tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAATGGTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGa > 1:372114/1‑140 (MQ=255)
tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGa > 2:2190448/1‑140 (MQ=255)
tGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGa > 1:2522205/1‑140 (MQ=255)
tACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGt > 2:3466216/1‑140 (MQ=255)
tACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGt > 2:662076/1‑140 (MQ=255)
tGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGc < 2:3091631/140‑1 (MQ=255)
ggATCATAATTGAAACAAAATGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAATTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCg > 2:3332362/1‑140 (MQ=255)
ggATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCg < 2:1048537/140‑1 (MQ=255)
ggATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCg < 1:5536638/140‑1 (MQ=255)
ggATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTGTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCg > 2:2859377/1‑140 (MQ=255)
aTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTCCTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAg > 1:206140/1‑140 (MQ=255)
aTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAg > 1:2499147/1‑140 (MQ=255)
tCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTCGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGc > 2:449751/1‑140 (MQ=255)
tCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGc > 1:4266037/1‑140 (MQ=255)
cATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGATTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCa < 2:2643506/140‑1 (MQ=255)
aTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTCATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaa > 2:2275364/1‑140 (MQ=255)
aTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaa > 1:640616/1‑140 (MQ=255)
aTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaa < 1:2406359/140‑1 (MQ=255)
aTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaa > 1:569888/1‑140 (MQ=255)
aaTTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaaaa > 2:4985968/1‑140 (MQ=255)
aaTTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGGTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCaaaa > 2:4987494/1‑140 (MQ=255)
tGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTTTTGAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 2:3367425/140‑1 (MQ=255)
tGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 1:2101726/140‑1 (MQ=255)
tGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 1:321426/140‑1 (MQ=255)
tGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 1:6148686/140‑1 (MQ=255)
tGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAgg < 1:3458086/140‑1 (MQ=255)
gAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAGAGTTTTGTAATCAGTGTGGGGTAGCTACTAGTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGa > 1:4744376/1‑140 (MQ=255)
gAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAATGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGa > 1:4422281/1‑140 (MQ=255)
aaaCAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGaa > 1:6190722/1‑140 (MQ=255)
cAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGcc < 2:5578545/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGccc < 2:3731926/140‑1 (MQ=255)
aaaaGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAGCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGACGCCCt > 2:5085105/1‑140 (MQ=255)
gTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCa < 1:3847163/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATAcc < 1:3157210/140‑1 (MQ=255)
cTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCCGTTTGGCGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGTAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCACCGCCCGCTTTTg < 2:5304625/140‑1 (MQ=255)
cTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTGCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTg > 2:70960/1‑140 (MQ=255)
cTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTGTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTg > 1:417523/1‑140 (MQ=255)
cacaAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCaa > 1:2019459/1‑82 (MQ=255)
cacaAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTgccag > 2:4039616/1‑140 (MQ=255)
acaAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTgccagc < 2:3533583/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGccagccag < 2:6117950/140‑1 (MQ=255)
gCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcgcg < 2:894486/140‑1 (MQ=255)
gCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcgcg < 2:5420566/140‑1 (MQ=255)
gCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcgcg < 1:5053488/140‑1 (MQ=255)
gCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTcgcg < 1:3300771/140‑1 (MQ=255)
aCTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGtt < 1:4305614/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTtg < 1:5433033/140‑1 (MQ=255)
tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTTGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 1:3564940/1‑140 (MQ=255)
tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCaa > 2:2317901/1‑67 (MQ=255)
tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCaa < 1:2317901/67‑1 (MQ=255)
tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 1:1979629/1‑140 (MQ=255)
tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 1:4837563/1‑140 (MQ=255)
tttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCACTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGc > 1:524256/1‑140 (MQ=255)
ttAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCt < 1:3001387/140‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCtt < 2:3666905/140‑1 (MQ=255)
aaGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGATTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCa < 2:1406317/140‑1 (MQ=255)
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GTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAA > SRR14920171.881402/1‑151 (MQ=60)
GTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTGTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAA > SRR14920171.643495/1‑151 (MQ=60)
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ACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTG < SRR14920171.3433804/151‑1 (MQ=60)
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TGGGGTAGCTACTGTTCTTCCAGGGAACTCTCTTCGAAGATTTCAATCGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCACCGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTA < SRR14920171.1496568/151‑1 (MQ=60)
GGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGT < SRR14920171.3575881/151‑1 (MQ=60)
GTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTT > SRR14920171.6204281/1‑151 (MQ=60)
AGCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCA > SRR14920171.6022799/1‑151 (MQ=60)
GCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCAG > SRR14920171.2917543/1‑151 (MQ=60)
GCTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCAG > SRR14920171.3136174/1‑151 (MQ=60)
CTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTNGAAGATTNCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTNCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCAGG < SRR14920171.5665276/151‑1 (MQ=60)
CTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCAGG > SRR14920171.2286796/1‑151 (MQ=60)
CTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACAAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCAGG > SRR14920171.2286772/1‑151 (MQ=60)
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AGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGTTACTTTTCTTCCAGGTAACTCTCTTCGAAGATTTCAATAGGGAGTGGGCGAGCAAAAAGGAAGCCCTGGGCAATACCAACGCCCGCTTTTGCCAGCCAGTCGCGTTGTGCTTCAGTCTCCACGCCTTCGGCAATCATTTGTAAGTTCAGG > NZ_CP025268/3684169‑3684468
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
