Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,922,869 |
T→C |
*80* (TAA→TAG) |
atpE ← |
F0F1 ATP synthase subunit C |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,922,869 | 0 | T | C | 99.8%
| 1667.1
/ NA
| 477 | *80* (TAA→TAG) | atpE | F0F1 ATP synthase subunit C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (238/238); minor base A (0/1); total (238/239) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 482 total aligned reads displayed.
ATACGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTATTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTGCGCCTTCCA > NZ_CP025268/3922732‑3923002
|
tACGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTtactac > 1:681380/1‑140 (MQ=255)
gTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGTCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTAcgcg < 2:4296972/140‑1 (MQ=255)
gTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTAcgcg < 1:3975517/140‑1 (MQ=255)
tACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGa < 1:2947410/140‑1 (MQ=255)
ttCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAg < 2:5914364/140‑1 (MQ=255)
aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACTATGCCTCTTTTTAGTTAACGTTCTGATTTTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 2:4953133/140‑1 (MQ=255)
aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 1:800196/140‑1 (MQ=255)
aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 2:3419430/140‑1 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 2:4149389/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 2:4388562/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 2:1829338/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 1:4535663/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 1:5456212/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 1:230217/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 2:2868336/1‑140 (MQ=255)
gCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAAc > 1:4139242/1‑140 (MQ=255)
cagaacagaaCGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACa < 1:276772/140‑1 (MQ=255)
agaacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACAt < 2:1498353/140‑1 (MQ=255)
gaacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATc < 2:4640629/140‑1 (MQ=255)
aacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCa < 1:2849671/140‑1 (MQ=255)
aacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAc > 1:2101908/1‑140 (MQ=255)
acgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAca < 2:1113134/140‑1 (MQ=255)
acgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAca < 1:6165432/140‑1 (MQ=255)
acAGGACAACCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc < 2:6347243/140‑1 (MQ=255)
acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACATTGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAccgacc > 2:3279804/1‑140 (MQ=255)
acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc > 1:4491260/1‑140 (MQ=255)
acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc < 2:1761133/140‑1 (MQ=255)
aCAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGGTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACGACGCGACAGCGAACATCCCGTAcagacccagac < 2:1967517/140‑1 (MQ=255)
aCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTAc > 1:4697264/1‑140 (MQ=255)
gcgATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTACATAAAAGCAACTCTTACTACGCGACCGCGAACATGACGTTCAGACCCAGACCTACAg < 1:2657096/140‑1 (MQ=255)
gcgATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAg < 1:3330552/140‑1 (MQ=255)
gcgATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAg < 1:1164698/140‑1 (MQ=255)
gATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCg < 1:4294677/140‑1 (MQ=255)
gATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCg < 2:5687347/140‑1 (MQ=255)
gATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCg < 2:3886801/140‑1 (MQ=255)
gcctggccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGatca > 1:535544/1‑140 (MQ=255)
cctggccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGatcat < 1:4235031/140‑1 (MQ=255)
ccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGa < 1:237825/140‑1 (MQ=255)
ccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGa < 2:708815/140‑1 (MQ=255)
ccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGa < 1:6379731/140‑1 (MQ=255)
ggATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGc > 1:1043884/1‑140 (MQ=255)
gATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCa < 2:2375950/140‑1 (MQ=255)
gATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCa < 1:5010197/140‑1 (MQ=255)
ttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATccac < 2:3756582/140‑1 (MQ=255)
ttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATccac > 2:2439194/1‑140 (MQ=255)
ttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGACTCTATTTAGTTAACTTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAAAGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCAAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATccac < 2:1584388/140‑1 (MQ=255)
tgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTTTTTAGTTAACGTTCTGATAGTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACCTCACGTACAGACCCAGACGTACAGCGATCATCGGGATAGCATccacc < 2:2601374/140‑1 (MQ=255)
ttAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACTGCGATCATCGGGATAGCATCCAGCAGAc > 1:6006914/1‑140 (MQ=255)
aggttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATCGCATCCACCAGACCCa > 2:5360424/4‑140 (MQ=255)
gATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCAt < 2:4702093/140‑1 (MQ=255)
ttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATaa < 1:191279/140‑1 (MQ=255)
ttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCACTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCCCGTACAGACCCAGCCCTCCAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCCTaa < 2:5540390/140‑1 (MQ=255)
caGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGAt > 1:3665434/1‑140 (MQ=255)
cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACTTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa < 2:4870091/140‑1 (MQ=255)
cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa > 1:5099019/1‑140 (MQ=255)
cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa > 1:1380685/1‑140 (MQ=255)
cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa < 1:3181069/140‑1 (MQ=255)
cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa > 2:2476111/1‑140 (MQ=255)
cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa > 1:244101/1‑140 (MQ=255)
cacaATGCATCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa < 1:3743093/140‑1 (MQ=255)
caATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGa > 1:3397388/1‑140 (MQ=255)
tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCa < 1:256616/112‑1 (MQ=255)
tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACt < 1:2242791/140‑1 (MQ=255)
tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACt > 1:3077565/1‑140 (MQ=255)
tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACt > 2:6285603/1‑140 (MQ=255)
ccTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCACTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGa < 1:1701680/140‑1 (MQ=255)
ctATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACTCTACAGCGAACATCACGTACAGAAACATAAATAAAGCGATCATATTGATAGCATACAAAATACACATAAATATAAAGAACTGAGTa < 2:2154016/140‑1 (MQ=255)
ctATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATCAAGAACTGAGTa > 1:4818232/1‑140 (MQ=255)
ctATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTa > 2:76940/1‑140 (MQ=255)
ctATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTa < 2:947192/140‑1 (MQ=255)
tAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACgcag > 2:5243316/1‑140 (MQ=255)
aGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACAACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACgcagc > 1:5720677/1‑140 (MQ=255)
ttAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGcagcag > 1:1473942/1‑140 (MQ=255)
tAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCaga > 1:1231294/1‑140 (MQ=255)
tAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCaga < 2:2683468/140‑1 (MQ=255)
tAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCaga < 2:3135155/140‑1 (MQ=255)
aCGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAgg > 2:445702/1‑140 (MQ=255)
aCGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAgg > 2:3661732/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGaa > 2:1327526/1‑140 (MQ=255)
gATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAatcaga < 2:5456212/140‑1 (MQ=255)
tGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAgg > 1:4009476/1‑140 (MQ=255)
gCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACTGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCAGCACGCTAACGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAggg > 2:1157523/1‑139 (MQ=255)
gCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGt > 2:1170020/1‑140 (MQ=255)
gCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGt > 1:594998/1‑140 (MQ=255)
ctctTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGATCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGtt > 1:2994737/1‑140 (MQ=255)
ctctTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGACTCAGATCAGGtt > 1:6262145/1‑140 (MQ=255)
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tctTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTg < 1:4080431/140‑1 (MQ=255)
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CGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGG > SRR14920171.2155812/1‑151 (MQ=60)
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CTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTGCGCCTTCCAGGAATTTACCCCC > SRR14920171.5869754/1‑151 (MQ=60)
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|
ATTAATGGCGGCCATACGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTATTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTGCGCCTTCCAGGAATTTACCCCCGAGG > NZ_CP025268/3922719‑3923019
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
