Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,397,708 |
A→G |
*300* (TAA→TAG) |
pgrR → |
DNA‑binding transcriptional regulator PgrR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,397,708 | 0 | A | G | 100.0%
| 2387.9
/ NA
| 680 | *300* (TAA→TAG) | pgrR | DNA‑binding transcriptional regulator PgrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (232/448); total (232/448) |
Only 100 of 709 total aligned reads displayed.
GAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAACACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCG > NZ_CP025268/1397571‑1397844
|
gAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgca < 2:8788982/140‑1 (MQ=255)
gAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgca < 1:2073811/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgcac > 2:973282/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgcac > 1:7003668/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgcac > 1:7947881/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCacta < 1:2781707/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCactac < 2:3097319/140‑1 (MQ=255)
aaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCactact > 2:229371/1‑140 (MQ=255)
gATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa < 2:2898816/140‑1 (MQ=255)
gATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa < 1:9223071/140‑1 (MQ=255)
gATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa < 2:7499932/140‑1 (MQ=255)
gtgtTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAt < 2:10832661/140‑1 (MQ=255)
ttttGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaa < 1:6844115/140‑1 (MQ=255)
ttttGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaa < 1:10512181/140‑1 (MQ=255)
ttttGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaa < 1:735038/140‑1 (MQ=255)
tAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATtaatttaatt < 2:813048/140‑1 (MQ=255)
tAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATtaatttaatt < 1:3068509/140‑1 (MQ=255)
aaaTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttc < 2:641504/140‑1 (MQ=255)
aaaTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttc < 2:5342432/140‑1 (MQ=255)
aaaTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACATGTACTATACACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttc < 2:7874194/140‑1 (MQ=255)
aTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttctt < 1:9361351/140‑1 (MQ=255)
cacaCCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTtctc < 1:3792673/140‑1 (MQ=255)
cacaCCAGATTTACCCGGTTACCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGTTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTtctc < 2:10584756/140‑1 (MQ=255)
cAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAAc < 2:6657214/140‑1 (MQ=255)
gATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGt < 2:2441755/140‑1 (MQ=255)
gATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGt < 1:3218244/140‑1 (MQ=255)
gATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGt < 1:5517513/140‑1 (MQ=255)
gATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGt < 1:1818617/140‑1 (MQ=255)
aTTTACCCGTTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCGGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTa < 2:8274126/140‑1 (MQ=255)
aTTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCCTgtctcttatac < 1:3586899/140‑8 (MQ=255)
tACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAAAGTATtc > 1:10247573/1‑140 (MQ=255)
ccGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTATTCTCTTAACGTATTCTCa < 1:10677210/140‑1 (MQ=255)
cGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAg < 2:1367469/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGt < 2:4207399/140‑1 (MQ=255)
gTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGtt < 1:9991236/140‑1 (MQ=255)
gTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGtt > 1:5030586/1‑140 (MQ=255)
gTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCAGTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGtt < 2:6206814/140‑1 (MQ=255)
tACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGt > 2:6897926/1‑140 (MQ=255)
cTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGttt > 1:2429557/1‑140 (MQ=255)
tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 2:8448415/1‑140 (MQ=255)
tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 1:806379/1‑140 (MQ=255)
tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 1:8570079/1‑140 (MQ=255)
cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCCTTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGGATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 2:6757969/140‑1 (MQ=255)
cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 1:6385411/140‑1 (MQ=255)
cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 2:1666242/140‑1 (MQ=255)
cacCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAt < 1:124584/140‑1 (MQ=255)
acCGTCGACATGCTGGCTCGNCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtt > 1:6048140/1‑140 (MQ=255)
acCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTGTGGTCAtt > 1:5362960/1‑140 (MQ=255)
tCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtttttt > 1:8301463/1‑140 (MQ=255)
tCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtttttt < 2:8022416/140‑1 (MQ=255)
tCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATGTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtttttt < 2:206478/140‑1 (MQ=255)
cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAg < 1:6508275/112‑1 (MQ=255)
cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTa > 2:10209291/1‑140 (MQ=255)
cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTa > 1:8136358/1‑140 (MQ=255)
gACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAt < 1:973282/140‑1 (MQ=255)
aCATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAtt < 2:10272863/140‑1 (MQ=255)
aCATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAtt < 1:8752047/140‑1 (MQ=255)
ctGCTGGCTCGGCATTCGCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCCTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAgtct < 2:9566989/139‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGTCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACTTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAttct < 2:315185/140‑1 (MQ=255)
ggCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTa < 1:9460932/140‑1 (MQ=255)
cTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACa < 2:700571/140‑1 (MQ=255)
cTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACa < 1:10096740/140‑1 (MQ=255)
ggCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATg < 1:2866183/140‑1 (MQ=255)
cATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 1:11131586/116‑1 (MQ=255)
cATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc > 2:11131585/1‑116 (MQ=255)
cATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGc < 1:2674909/140‑1 (MQ=255)
cATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGc < 1:7488403/140‑1 (MQ=255)
ttCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGa < 1:9552166/140‑1 (MQ=255)
tctcATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGAc < 1:4015930/140‑1 (MQ=255)
ctcATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACa < 2:272954/140‑1 (MQ=255)
ttatttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTtctc < 1:9285932/73‑1 (MQ=255)
ttatttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 2:893050/140‑1 (MQ=255)
ttatttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 1:7839276/140‑1 (MQ=255)
ttatttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 1:8994914/140‑1 (MQ=255)
atttatAGCTAGGCTGAAGTATAAAGGAGCAGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTCACGTATTCTCAGTTCCTTTAAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGTCAGATGCt < 2:11439632/140‑1 (MQ=255)
atttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCt < 1:476916/140‑1 (MQ=255)
agatagGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTAt < 2:3707437/140‑1 (MQ=255)
gatagGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATg < 1:5852785/140‑1 (MQ=255)
ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTATCGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 1:11395756/127‑1 (MQ=255)
ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 2:3840741/1‑140 (MQ=255)
ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 2:5086479/1‑140 (MQ=255)
ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 1:10827182/1‑140 (MQ=255)
ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 1:4218831/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtttttt > 2:478666/1‑101 (MQ=255)
gCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAcc > 1:7223959/1‑140 (MQ=255)
aaGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGaaa < 2:4600088/140‑1 (MQ=255)
aGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc > 1:1574342/1‑89 (MQ=255)
aGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGaaaa < 2:1870171/140‑1 (MQ=255)
gTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAAc < 2:5562392/58‑1 (MQ=255)
taAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCt > 2:9146704/1‑119 (MQ=255)
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tgggctcggagatgtgtataagagacagTTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTAC < SRR14920170.482996/123‑1 (MQ=60)
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gctccggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGG < SRR14920170.989321/111‑1 (MQ=60)
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TTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACActgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccggagcctatcgcgta > SRR14920170.6068926/1‑101 (MQ=60)
TAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGT < SRR14920170.243566/151‑1 (MQ=60)
TAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGT < SRR14920170.1196158/151‑1 (MQ=60)
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GCGGGCTATTAAAGAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAACACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAG > NZ_CP025268/1397558‑1397858
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
