Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,661,562 |
A→G |
*187* (TAA→TAG) |
speG → |
spermidine N1‑acetyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,661,562 | 0 | A | G | 99.9%
| 2695.3
/ NA
| 778 | *187* (TAA→TAG) | speG | spermidine N1‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (389/387); minor base T (0/1); total (389/389) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 778 total aligned reads displayed.
GTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTA > NZ_CP025268/1661425‑1661697
|
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 2:3738074/140‑1 (MQ=255)
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 1:7106106/140‑1 (MQ=255)
tGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCAtt < 1:8096669/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACCCCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:7988321/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 1:10032067/1‑140 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:3011242/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:5139891/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:7651441/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:3144627/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:9268939/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:10731427/140‑1 (MQ=255)
cTTGATGAATGGTCAAGATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGGATTTTTGa < 2:8808721/140‑1 (MQ=255)
ttaATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGgtg < 2:7348001/140‑1 (MQ=255)
aTGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTaa > 1:1505605/1‑140 (MQ=255)
aTGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTaa > 1:3526914/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATTTGTATATTCCTGCATCAGTATCTGTCAGAGCACAATAGACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACGGCACCATAGCATTGATAAGAATGGTTCGTATTTTTGATGGTGTaatcg > 2:8098706/1‑137 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 1:7364666/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 1:884460/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 2:6619441/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 1:8723698/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 1:24462/1‑140 (MQ=255)
tatCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTc > 2:10402548/1‑140 (MQ=255)
gTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcg < 2:3298983/140‑1 (MQ=255)
tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGNGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcgg > 1:6119290/1‑140 (MQ=255)
tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcgg > 1:5435031/1‑140 (MQ=255)
aaTGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggc > 2:8943204/1‑140 (MQ=255)
tGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcgg > 2:966292/1‑140 (MQ=255)
tGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcgg > 1:5531190/1‑140 (MQ=255)
ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGtttt > 1:7851194/1‑140 (MQ=255)
tCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTa > 2:682224/1‑140 (MQ=255)
gCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCGCCTGAAGCCGACCGCCCAATACCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTACGACGGCGGGTTTTACt < 2:9385118/140‑1 (MQ=255)
gCATGTGTATAGTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACCCCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATCGCATTAATAATAATCGATCGGATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt < 2:1109785/140‑1 (MQ=255)
aTGTGTCTAAGCCCGCATCAGTCTCTGGCAGCGCCCAAAACTCCGGGTCAGACGCTCCGGAAGCCGCCCGCACACTAGCATGACTACTAATCGATCGAATTTGTGATGGTGTACACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTcc < 2:7072583/140‑1 (MQ=255)
aTGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTcc < 1:5250289/140‑1 (MQ=255)
tgtgTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGGTCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCt < 1:9739006/140‑1 (MQ=255)
tataTTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtcat > 2:1264797/1‑140 (MQ=255)
tataTTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtcat > 1:313473/1‑140 (MQ=255)
tataTTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtcat > 1:1245744/1‑140 (MQ=255)
tCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATcaaca > 1:4710231/1‑140 (MQ=255)
tCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATcaaca > 2:4770654/1‑140 (MQ=255)
tCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATcaaca < 1:10428599/140‑1 (MQ=255)
cAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAACACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt < 2:8588933/140‑1 (MQ=255)
cAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt > 1:11245586/1‑140 (MQ=255)
cAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt < 1:4020077/140‑1 (MQ=255)
cAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt < 1:8972884/140‑1 (MQ=255)
aGCATCAGTATCAGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCATGAAGCCGACCGCACAAAAGCATAAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACACGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATg > 2:6263958/1‑140 (MQ=255)
gCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGa < 2:10078722/140‑1 (MQ=255)
gCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGa > 1:10236346/1‑140 (MQ=255)
cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGAt > 2:6476122/1‑140 (MQ=255)
cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGAt > 1:7705477/1‑140 (MQ=255)
cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGAt > 1:9542790/1‑140 (MQ=255)
cAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAg > 1:9902965/1‑140 (MQ=255)
gTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt < 2:8468513/118‑1 (MQ=255)
gTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCt > 2:5854003/1‑140 (MQ=255)
tGGCAGAGCACAAAACTCCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAg < 2:4475599/140‑1 (MQ=255)
gCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTc < 1:6266100/140‑1 (MQ=255)
agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa < 1:7483192/140‑1 (MQ=255)
agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa < 1:5797009/140‑1 (MQ=255)
agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGAGCGGATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa < 2:10857095/140‑1 (MQ=255)
gagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAc < 1:1365919/140‑1 (MQ=255)
agCACAAACCACCGGGTCAGACTCTCCTGTAGCCGACCGCACACTAGCATTAAGAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCcccc > 2:3605936/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 1:11122822/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 1:1808305/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 2:1461844/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 1:4140977/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 2:6000014/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACAACGGGTCAGAATCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCAAcc > 2:3992361/1‑140 (MQ=255)
cacaAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCgg < 1:2690395/140‑1 (MQ=255)
acCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGt > 1:1888166/1‑140 (MQ=255)
acCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGt > 2:9882916/1‑140 (MQ=255)
ccGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACAGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTg > 2:5534116/1‑140 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 1:2180340/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 1:205213/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 1:8292142/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa > 2:2922658/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACt < 2:501392/140‑1 (MQ=255)
cAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTc > 2:2721066/1‑140 (MQ=255)
gACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCat < 2:2104931/140‑1 (MQ=255)
aCTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCata < 2:11275261/140‑1 (MQ=255)
aCTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCata > 1:2836300/1‑140 (MQ=255)
tcCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTca < 1:10960196/140‑1 (MQ=255)
tGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAg < 1:503921/140‑1 (MQ=255)
tGAAGCCGACCGCACAATAGCAATAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAg < 1:1658393/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGACCGCACAATCGCATTAATAATAAACGATCGTCATTTTGATGGTTGAACCCCGTTCGACGGCGGGTTGTACTCCGTCATCAACAATGCTTATCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATCTTCACCGct < 2:228804/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGct < 2:1752369/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGct < 1:3925476/140‑1 (MQ=255)
ccGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTg < 2:4199264/140‑1 (MQ=255)
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CAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTG < SRR14920170.769661/151‑1 (MQ=60)
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CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.7525453/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.9991362/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.2113937/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.1705522/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.11216020/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.4983678/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920170.11508027/1‑151 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920170.4038159/151‑1 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT > SRR14920170.4655261/1‑151 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT > SRR14920170.1506506/1‑151 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920170.5307209/151‑1 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920170.5535462/151‑1 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920170.11056260/151‑1 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT > SRR14920170.7396569/1‑151 (MQ=60)
TGAAGCCGACCGCACAATAGCAATAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTAC < SRR14920170.1672604/151‑1 (MQ=60)
GAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCctgtctcttatacaca > SRR14920170.822113/1‑135 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATCATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920170.10290442/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920170.9410846/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920170.10530265/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920170.3879961/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920170.3959037/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920170.7001576/151‑1 (MQ=60)
CCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTAC < SRR14920170.2752278/151‑1 (MQ=60)
CGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACC < SRR14920170.4086775/151‑1 (MQ=60)
ACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAA < SRR14920170.3736966/151‑1 (MQ=60)
CCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACctgtctctt > SRR14920170.5820035/1‑142 (MQ=60)
CCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAAC > SRR14920170.9650082/1‑151 (MQ=60)
CCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAAC > SRR14920170.4678201/1‑151 (MQ=60)
CGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACC < SRR14920170.8165158/151‑1 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920170.903896/1‑151 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920170.5201720/1‑151 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920170.1289223/1‑151 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920170.4372890/1‑151 (MQ=60)
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GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920170.217700/1‑151 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAAGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920170.5778860/1‑151 (MQ=60)
CACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCG > SRR14920170.10705091/1‑151 (MQ=60)
CAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTT > SRR14920170.2093763/1‑151 (MQ=60)
CAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTT > SRR14920170.9904046/1‑151 (MQ=60)
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TAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGAT < SRR14920170.9859214/151‑1 (MQ=60)
TAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGAT < SRR14920170.8496261/151‑1 (MQ=60)
TAGCATGAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGAT < SRR14920170.11455694/151‑1 (MQ=60)
TACCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGAT < SRR14920170.6827879/151‑1 (MQ=60)
AGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCtgtctcttatac > SRR14920170.1077067/1‑139 (MQ=60)
AGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATT > SRR14920170.4128338/1‑151 (MQ=60)
GCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTA > SRR14920170.226925/1‑151 (MQ=60)
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GCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTA > NZ_CP025268/1661412‑1661712
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |