Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,026,925 |
A→G |
*90* (TAA→TAG) |
fliQ → |
flagellar biosynthesis protein FliQ |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,026,925 | 0 | A | G | 99.5%
| 2245.9
/ NA
| 647 | *90* (TAA→TAG) | fliQ | flagellar biosynthesis protein FliQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (337/307); minor base T (2/1); total (339/308) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 647 total aligned reads displayed.
AACGAAATGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAACCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAA > NZ_CP025268/2026788‑2027061
|
aaCGAAATGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATAGCATCGGGTAGcc > 1:8667084/1‑140 (MQ=255)
aCGAAATGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCg < 1:9122507/140‑1 (MQ=255)
aCGAAATGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCg < 1:11471640/140‑1 (MQ=255)
aCGAAATGACGCTGTCGTGTATTCCGAAAAGCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCg < 2:9465863/140‑1 (MQ=255)
gAAATGCCGCGGGCGTTCATTCCGAAACTCATCGCCGTAATTATCGCCCTGATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTa < 2:6257844/140‑1 (MQ=255)
aaTGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACt < 1:2660293/140‑1 (MQ=255)
tGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTAt > 1:2512721/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATAGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTTCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGGATATCATCGGGTAGCCGTACTAt > 1:2211239/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGt < 1:1621928/140‑1 (MQ=255)
cGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGtt > 1:8206040/1‑140 (MQ=255)
gCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTg < 2:10731027/140‑1 (MQ=255)
gCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTg < 1:1004240/140‑1 (MQ=255)
gCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCAGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTg < 2:4113517/140‑1 (MQ=255)
tCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATGTATCGCCATTATTTTTGCCGGACCGTGGATGCTCACTCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAgg > 2:9009009/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTg > 1:5461359/1‑140 (MQ=255)
tATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACa > 2:554255/1‑140 (MQ=255)
ttCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAg < 2:3808242/140‑1 (MQ=255)
ttCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAg < 1:7313041/140‑1 (MQ=255)
ccGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCg < 1:280610/140‑1 (MQ=255)
cGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGAc > 1:4875640/1‑134 (MQ=255)
cGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGa > 2:1180049/1‑140 (MQ=255)
aaaaTCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAAc < 2:1427909/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAAc > 1:7082836/1‑140 (MQ=255)
aaaaTCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAAc < 2:2888089/140‑1 (MQ=255)
aaTCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACaa < 1:5365065/140‑1 (MQ=255)
catcGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATgg < 2:7795985/140‑1 (MQ=255)
catcGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATgg < 2:4412152/140‑1 (MQ=255)
catcGCCGTATTTATCGCCATTATGATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGGTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATgg < 2:10859980/140‑1 (MQ=255)
gCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTAt < 1:8833914/140‑1 (MQ=255)
ccGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATc < 2:2398734/140‑1 (MQ=255)
tttATCTCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCTATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTTCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGt < 2:11378236/140‑1 (MQ=255)
cGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAAc < 1:1717978/140‑1 (MQ=255)
cATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTg > 1:8286275/1‑140 (MQ=255)
cATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTg > 1:6339591/1‑140 (MQ=255)
ttattattGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTa > 1:2942203/1‑140 (MQ=255)
ttattattGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTa > 1:7783928/1‑140 (MQ=255)
ttattGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACtt < 1:1886029/140‑1 (MQ=255)
attGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGTCAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCt < 1:4974995/140‑1 (MQ=255)
attGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCt < 1:10223696/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTgg < 1:4121958/140‑1 (MQ=255)
gCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGc > 1:1321996/1‑140 (MQ=255)
gCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGc > 2:209550/1‑140 (MQ=255)
cGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCg < 2:9770238/140‑1 (MQ=255)
gACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGtt > 2:5252273/1‑140 (MQ=255)
tGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTgc > 1:11228182/1‑140 (MQ=255)
gCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTg > 1:5929922/1‑140 (MQ=255)
gCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTg > 1:983744/1‑140 (MQ=255)
cTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGc > 1:8576471/1‑140 (MQ=255)
cTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGc < 1:3215144/140‑1 (MQ=255)
tCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGgcg < 2:4788680/140‑1 (MQ=255)
tCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGgcg < 2:6033031/140‑1 (MQ=255)
tCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGGTCACTCACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACCAGCGAACAATGGCTATCCTGGATAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGgcg < 2:10169257/140‑1 (MQ=255)
tGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAAGCTGTCCTTCAGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCt > 2:11069690/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACACGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTCCTTCTGGCCGTTTCTGCGGGTGCTGGCGCGGa > 2:7291711/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGa > 2:8289202/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGa > 2:3329802/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGGATTACGTCCGCACCTTGGTCACTCACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTGATGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGa > 2:1737834/1‑140 (MQ=255)
tGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGAt > 2:3657252/1‑140 (MQ=255)
gCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGAt > 1:9981578/1‑140 (MQ=255)
gCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGAt > 2:6480565/1‑140 (MQ=255)
gCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGAt > 1:3460118/1‑140 (MQ=255)
gCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGAt > 1:4662781/1‑140 (MQ=255)
cACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGgcg < 2:5424816/119‑1 (MQ=255)
aCCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTc < 2:10365845/140‑1 (MQ=255)
ttGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGa > 2:3040882/1‑140 (MQ=255)
tGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAg > 1:4405982/1‑140 (MQ=255)
tGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAg > 2:8025684/1‑140 (MQ=255)
tGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAg > 1:3881678/1‑140 (MQ=255)
gTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGc < 1:8406431/140‑1 (MQ=255)
gTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGGTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGc > 2:10595206/1‑140 (MQ=255)
tCACTAACCAGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACAATGGTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGa < 2:8878481/140‑1 (MQ=255)
cACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGaa < 2:2688502/140‑1 (MQ=255)
cTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACg < 1:7868581/140‑1 (MQ=255)
tAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGc > 2:5803126/1‑140 (MQ=255)
acccTGCCGTATATCATCGGGTAGCCNTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAAAGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa < 1:6929904/138‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa < 2:8744845/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa < 2:987807/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa < 2:3525964/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa > 1:3729298/1‑140 (MQ=255)
aaCCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa > 1:3806140/1‑140 (MQ=255)
aaCCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCa > 1:6544092/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACACTGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGAGCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGc > 2:9236558/1‑140 (MQ=255)
tGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGt > 2:4334716/1‑140 (MQ=255)
tGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGt > 2:7073781/1‑140 (MQ=255)
ccGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTAc > 2:7554211/1‑140 (MQ=255)
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cGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTAcc > 1:10651810/1‑140 (MQ=255)
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GTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTG > SRR14920170.1417864/1‑151 (MQ=60)
GTATTTATCGCCATTATTATAGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCTCACCATGTACACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTTCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTG > SRR14920170.8697215/1‑151 (MQ=60)
ATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTA > SRR14920170.2967432/1‑151 (MQ=60)
ATTTATCGCCAGTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTA > SRR14920170.2225695/1‑151 (MQ=60)
TTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTAC < SRR14920170.1783522/151‑1 (MQ=60)
TTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTAC < SRR14920170.1193927/151‑1 (MQ=60)
TTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTAC < SRR14920170.1004155/151‑1 (MQ=60)
TTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTAC < SRR14920170.8496478/151‑1 (MQ=60)
TATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTT < SRR14920170.4388596/151‑1 (MQ=60)
TATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTT < SRR14920170.5913885/151‑1 (MQ=60)
CGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTG < SRR14920170.1732674/151‑1 (MQ=60)
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CCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGC > SRR14920170.3880774/1‑151 (MQ=60)
CCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGC > SRR14920170.1583363/1‑151 (MQ=60)
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TTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTAC < SRR14920170.8787092/151‑1 (MQ=60)
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TGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCG > SRR14920170.6454173/1‑151 (MQ=60)
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CTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGAGCTCCACCGCGCCGATGCTGAGCGACCGCAGCGTACCGA > SRR14920170.10819836/1‑151 (MQ=60)
CTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGCTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGA < SRR14920170.6594504/151‑1 (MQ=60)
CTAACCTGCCGTAGATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGA < SRR14920170.11354589/151‑1 (MQ=60)
AACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAA > SRR14920170.7773682/1‑151 (MQ=60)
AACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAA < SRR14920170.7440275/151‑1 (MQ=60)
AACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAA > SRR14920170.7135511/1‑151 (MQ=60)
AACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAA < SRR14920170.5656253/151‑1 (MQ=60)
AACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAA > SRR14920170.2860529/1‑151 (MQ=60)
AACCTGCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTNACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAA < SRR14920170.10719307/151‑1 (MQ=60)
GCCGTATATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccggagcctatctcgtatgccgtcttctg > SRR14920170.8319849/1‑90 (MQ=60)
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TTATCATCGGGTAGCCGTACTATGGTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAAC < SRR14920170.7908677/151‑1 (MQ=60)
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TATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACT < SRR14920170.8374184/151‑1 (MQ=60)
ATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccggagcctatct > SRR14920170.6811716/1‑106 (MQ=60)
ATCATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTG > SRR14920170.4160723/1‑151 (MQ=60)
TCATCGGGTAGCCGTACTACGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGG > SRR14920170.7195948/1‑151 (MQ=60)
ATCGGGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGT < SRR14920170.2602552/151‑1 (MQ=60)
GGTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGG > SRR14920170.748899/1‑151 (MQ=60)
GTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGC < SRR14920170.189524/151‑1 (MQ=60)
GTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGC > SRR14920170.9728929/1‑151 (MQ=60)
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AGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGCAA < SRR14920170.4828310/151‑1 (MQ=60)
AGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGCAA < SRR14920170.4827029/151‑1 (MQ=60)
GCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGCAAT > SRR14920170.11139241/1‑151 (MQ=60)
GCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGCAAT > SRR14920170.10509780/1‑151 (MQ=60)
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GCCACGCAGATTAACGAAATGACGCTGTCGTTTATTCCGAAAATCATCGCCGTATTTATCGCCATTATTATTGCCGGACCGTGGATGCTCAATCTGTTGCTGGATTACGTCCGCACCTTGTTCACTAACCTGCCGTATATCATCGGGTAACCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTCTGGCCGTTACTGCGCGTGCTGGCGCTGATCTCCACCGCGCCGATTCTGAGCGAACGCAGCGTACCGAAACGGGTAAAACTGGGTCTGGCAAT > NZ_CP025268/2026776‑2027075
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |