Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
449,814 |
T→C |
T283A (ACT→GCT) |
cyoA ← |
cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 449,814 | 0 | T | C | 99.9%
| 2264.6
/ NA
| 648 | T283A (ACT→GCT) | cyoA | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (463/184); minor base A (1/0); total (464/184) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 648 total aligned reads displayed.
TAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGTCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGGTGTTCGGCGACTGCTTCGCT > NZ_CP025268/449677‑449950
|
tAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCa < 2:8774783/140‑1 (MQ=255)
tAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCa > 2:7835317/1‑140 (MQ=255)
atgttCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGAGGCTCATGTCCATGCCTTCCAAACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATa < 2:8949455/137‑1 (MQ=255)
aTTTTACGCACATCTATATGAGTCCTCATCCACTTTAAGGGGCGGTTTCAGCGGGGCTCATGTACATGCCTTACATAACTTCGTGTGCGCTGTTCTCACCTTCTGGCTGTGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATa < 2:8038132/140‑1 (MQ=255)
ccTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTATTTACATCGGCaaa > 1:4030692/1‑140 (MQ=255)
ccTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCaaa > 1:2137384/1‑140 (MQ=255)
aCCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGt < 1:3090998/140‑1 (MQ=255)
ccccTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTc > 2:6304156/1‑140 (MQ=255)
tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCCTAAACTTGTTAATTCCATCGGCAAACAAGTCTGGt > 2:3852521/1‑140 (MQ=255)
tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGt > 2:5789035/1‑140 (MQ=255)
tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGt > 1:2266134/1‑140 (MQ=255)
ttaaaTGTGCGTATTACGCGTGGATCATGTACATCACTACCATACCATCTTTTGCGCTGTGCTCACCTTCTTGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCTTGAGCCATAAACTTCTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTCGt > 2:4956488/4‑140 (MQ=255)
tAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGttt < 1:8436239/140‑1 (MQ=255)
tAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGttt < 1:7939894/140‑1 (MQ=255)
tAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCAGACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGttt < 2:8531466/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCAc < 1:6110167/140‑1 (MQ=255)
gggCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGAGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTGTCACg > 1:5614206/1‑140 (MQ=255)
ggCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGt > 2:5431277/1‑140 (MQ=255)
ggCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGt > 2:43018/1‑140 (MQ=255)
cGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTGGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTg > 1:6464711/1‑140 (MQ=255)
gtaTTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTgg > 2:110668/3‑140 (MQ=255)
ggATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTgg > 2:2451590/1‑140 (MQ=255)
gATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGga > 2:8269973/1‑140 (MQ=255)
aTTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgag > 2:2366143/1‑140 (MQ=255)
aTTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgag > 2:1964662/1‑140 (MQ=255)
aTTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgag > 2:3008686/1‑140 (MQ=255)
ttCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgaga < 1:9024905/140‑1 (MQ=255)
tCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGaa > 1:1259596/1‑140 (MQ=255)
cTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCAc < 2:1425389/140‑1 (MQ=255)
tCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCAcc < 2:5611917/140‑1 (MQ=255)
tCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCAcc < 2:2733487/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 1:8878761/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 2:3996067/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 1:7506968/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCACTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 2:3178351/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTGCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTACATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 2:5344128/140‑1 (MQ=255)
gTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGt > 2:6068369/1‑140 (MQ=255)
ccATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTGCCCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTg < 1:1390289/140‑1 (MQ=255)
tGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAt > 1:5991792/1‑140 (MQ=255)
tCCATACCTTCGTCTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTAGTTAATTACATCGGCAATCAAGTCTGGTTTCTCGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCt > 2:6644680/1‑140 (MQ=255)
ccATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTa > 1:5176734/1‑140 (MQ=255)
ccTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGgcgc < 1:510958/140‑1 (MQ=255)
ttCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCgg > 1:8416062/1‑140 (MQ=255)
ttCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCgg > 1:911946/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCTAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGcc > 2:1727888/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGcc > 1:3817353/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGcc > 1:4281698/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGcc > 1:5024497/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCGTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAGTCGCTAGGCGCGGcc > 1:2750180/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCAGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCTCTAGGCGCGGcc > 2:1614408/1‑140 (MQ=255)
tgtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAACTATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAg > 1:5917375/1‑140 (MQ=255)
tgtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTCGGCGCGGCCAg > 1:5400598/1‑140 (MQ=255)
tgtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAg > 1:991994/1‑140 (MQ=255)
tgtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAg > 1:1778088/1‑140 (MQ=255)
tgtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAAAACGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAg > 1:524437/1‑140 (MQ=255)
gtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGGATTCGCTCGGCGCGGCCAGt > 1:3660105/1‑140 (MQ=255)
cgcTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGtttt > 1:2022879/1‑140 (MQ=255)
cgcTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGtttt > 1:4449398/1‑140 (MQ=255)
gcTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGttttt > 1:4856056/1‑140 (MQ=255)
tgCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTGTTTCGac > 2:2894467/1‑139 (MQ=255)
tgCTCACCTTCTGGCTGGGTAATGTCCATGCTCTTAACGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCTAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCCCCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCgcc < 2:7183237/140‑3 (MQ=255)
tCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGc < 1:8539180/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCTGTTTTTCGAACGCAGcc < 1:1626440/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGcc < 1:7347418/140‑1 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGCACGCAGCCagg > 1:1111658/1‑138 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCCTg > 1:8675653/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 2:4151721/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:2894453/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 2:7676918/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:3888743/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTAGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:6600614/1‑140 (MQ=255)
tggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGt < 2:3368199/140‑1 (MQ=255)
tggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGt < 2:526515/140‑1 (MQ=255)
tggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGa > 2:8642257/1‑140 (MQ=255)
ggacATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCGTGTTGAATTCGCTCGGCGCGGCCAGTTGTTCGAAAGCAGCCATGTCAGACa > 2:6547770/4‑140 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa < 2:3610563/140‑1 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 1:6834656/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATAGTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa < 2:6793990/140‑1 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTGGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGaga > 2:6982838/1‑138 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGGTTCACGTTGGAGAAATATTCCACGTGGGTGTATTCGCTAGGCGCGGCCCGTGTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 2:7476461/1‑140 (MQ=255)
tCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATg > 2:473958/1‑140 (MQ=255)
tGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGgtg > 1:7845443/1‑140 (MQ=255)
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GATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCA > SRR14920174.3452120/1‑151 (MQ=60)
ATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCAC < SRR14920174.4300436/151‑1 (MQ=60)
TTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACC < SRR14920174.9075498/151‑1 (MQ=60)
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GTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTACATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTG < SRR14920174.3865633/151‑1 (MQ=60)
TGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGT > SRR14920174.2288956/1‑151 (MQ=60)
TGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGT > SRR14920174.8711615/1‑151 (MQ=60)
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CATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGATAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCTCGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCG < SRR14920174.3603285/151‑1 (MQ=60)
TGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGTAATATTCCACCTGGGTGTATTCGCT > SRR14920174.9142359/1‑151 (MQ=60)
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CCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTGCCCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGG < SRR14920174.1398163/151‑1 (MQ=60)
ATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCG < SRR14920174.5525868/151‑1 (MQ=60)
GCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCG > SRR14920174.1294455/1‑151 (MQ=60)
CCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGG > SRR14920174.1189156/1‑151 (MQ=60)
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CTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGC > SRR14920174.5538572/1‑151 (MQ=60)
CGTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGC > SRR14920174.9543167/1‑151 (MQ=60)
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ACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGAC < SRR14920174.8667464/151‑1 (MQ=60)
CCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACA > SRR14920174.7103553/1‑151 (MQ=60)
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CCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTGTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACA > SRR14920174.2119858/1‑151 (MQ=60)
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GCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAGTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGGTGTTCGGCGACTGCTTCGCTTTTGCGACCCACT > SRR14920174.4938129/1‑151 (MQ=60)
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|
CTGCATCAAGTGATAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGTCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGGTGTTCGGCGACTGCTTCGCTTTTGCGACCCACTG > NZ_CP025268/449664‑449964
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
