Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
857,496 |
C→T |
P20S (CCC→TCC) |
CXP41_RS24120 → |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 857,496 | 0 | C | T | 99.7%
| 1212.9
/ NA
| 311 | P20S (CCC→TCC) | CXP41_RS24120 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (163/147); minor base A (1/0); total (164/147) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
GATGAATGACAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTCCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTT > NZ_CP025268/857360‑857632
|
atgaatgaCAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCa > 1:7318179/1‑140 (MQ=255)
aatgaCAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTa > 1:2158959/1‑140 (MQ=255)
atgaCAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTaa > 2:2730159/1‑140 (MQ=255)
aGGGAAAACATGCGTAATACTAACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATAGCGAAGAGTTTCCCATTAAttttt > 1:8019224/1‑140 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTCGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:5107050/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:1480639/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:786717/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:7478524/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:646163/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTGAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:1149745/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATAATTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGTAAAAGTTATGTTACATGTAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:7068186/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAAGACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGAATAAAATTTAGCTGGAGAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:6353919/140‑1 (MQ=255)
aaaaCATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGGTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTGTGata > 1:7183082/1‑140 (MQ=255)
tGCTTAAGACTTACGCAGTTCTCTTAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATATCTGTGTATGGAAACGTTCTGTTAAATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGAtttattta < 2:8502673/140‑1 (MQ=255)
tGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTa > 2:3684339/1‑140 (MQ=255)
tGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTa < 1:6541499/140‑1 (MQ=255)
tGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTa < 2:7976831/140‑1 (MQ=255)
gCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTaa < 2:9034524/140‑1 (MQ=255)
tAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATATTTGAGATATTTAAAAc > 2:5783686/1‑140 (MQ=255)
caTACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTTATTAAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATCGCCCGATAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGTTATATATAAAACt < 2:5009156/139‑1 (MQ=255)
tACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGAc < 2:7318179/140‑1 (MQ=255)
tACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGAc > 2:8734818/1‑140 (MQ=255)
aCGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACt > 2:4850741/1‑140 (MQ=255)
cAGTTCTCTGAAAAAGTGAATTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAACCGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTAt < 2:1358734/140‑1 (MQ=255)
ttCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTg > 1:8399866/1‑140 (MQ=255)
ttCTCAGAAAAAGTGATTTAAAATTAGATGGATATCGGTGTATGGAAACTTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTATACATCAAAAAACGCGAAGAGTTTCCCATTAAAATTAGATATATATAAAACTTAGGACTTATTTg > 2:816392/1‑140 (MQ=255)
tctcTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGa > 2:8928144/1‑140 (MQ=255)
ctctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGaa > 2:2832726/1‑140 (MQ=255)
ctctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGaa > 1:518670/1‑140 (MQ=255)
tctTAAATAGTGATTTATTTTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCTCACATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAATCTTAGGACTTATTTGAAt < 1:4894121/140‑1 (MQ=255)
tctGAAATAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATAATTAAAACTTAGGACTTATTTGAAt < 1:3559057/140‑1 (MQ=255)
tctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAAt < 2:474314/140‑1 (MQ=255)
tctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGAGGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCAGAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATGTGAAt < 2:6947413/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATca > 1:1288889/1‑140 (MQ=255)
aaaaGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGTACTTATATGAATCACAt > 2:6137360/1‑140 (MQ=255)
aaGTGCTTTAAATTTAGATGGATATCGGTGACTGGAAACGTTCTGTTACAGGAAATGGCCCGTTAGAACTCACAAATCGCGAAGATTTTACCATTATTTTTTGATCTAGTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACAttt > 2:3064773/1‑140 (MQ=255)
aaGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACAttt > 2:1994610/1‑140 (MQ=255)
aaGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACAttt > 2:6709045/1‑140 (MQ=255)
aaGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACAttt > 2:8782843/1‑140 (MQ=255)
tGATTTAAATTTAGATTGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCACTTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCACATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAg < 2:8849398/140‑1 (MQ=255)
tGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAg > 1:4413391/1‑140 (MQ=255)
gCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCa < 2:5261049/140‑1 (MQ=255)
gCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCa < 1:139901/140‑1 (MQ=255)
gCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCa < 1:824913/140‑1 (MQ=255)
gCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACACGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATNTATTTAAAACTTATGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAANAAATTGCa < 1:5607017/140‑1 (MQ=255)
cGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCAt > 1:8646690/1‑140 (MQ=255)
cGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTGATGAAAAAAATTGCAt > 1:9413804/1‑140 (MQ=255)
ggTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGNAATGGCCCGTAAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 1:6349878/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGTCTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 2:3129416/140‑1 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATCTTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 1:6488628/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGAGTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAATAAATTGCATGTCtt > 2:9322222/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTcgt > 1:5054121/1‑138 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 1:4588636/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 1:3069225/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 2:8118415/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 2:1913734/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 2:2243196/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 1:706092/1‑140 (MQ=255)
aaCGTTCAGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTAATTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCa < 1:8530741/140‑1 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAATCTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 1:1802464/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 2:1005412/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 2:408315/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 2:1186210/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 1:1646020/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATAAATTTAAAACTTAGGACTTCTTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTTCATGTCTTTCAGCACt > 2:353877/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCAGTATTTTTTGCTAGATTGAAAACTGAGGACTTATTTGAATCACAGTTGAGGTGGTTTTGACAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 2:5369455/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAACAAATTTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 1:6751280/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 1:7625374/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 2:5507655/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 1:8995454/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 1:8909047/1‑140 (MQ=255)
tGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCg < 2:4904421/140‑1 (MQ=255)
tGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCg < 2:4413391/140‑1 (MQ=255)
tGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCg > 1:1886433/1‑140 (MQ=255)
tGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCg < 2:2993783/140‑1 (MQ=255)
tACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAg < 1:2929603/140‑1 (MQ=255)
aTGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAAATTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTTGTTATGAAAAAAATTTCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTc > 2:7210760/1‑140 (MQ=255)
tGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg > 1:6526401/1‑111 (MQ=255)
tGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCtt < 1:9149711/140‑1 (MQ=255)
tGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCtt > 1:4001041/1‑140 (MQ=255)
tGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCtt > 1:1023093/1‑140 (MQ=255)
gCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTc < 1:6175917/140‑1 (MQ=255)
gCCCGATAGACATCACAAATCGCGAAGAGTGTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACAATTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTc < 1:5901515/140‑1 (MQ=255)
cccGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCa > 1:271921/1‑140 (MQ=255)
cGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCAcc < 1:3708685/140‑1 (MQ=255)
ttAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGc > 1:15077/1‑140 (MQ=255)
ttAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGc > 1:3359135/1‑140 (MQ=255)
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GACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAG < SRR14920174.6396631/151‑1 (MQ=60)
ACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGC < SRR14920174.2066729/151‑1 (MQ=60)
ACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGC > SRR14920174.1096281/1‑151 (MQ=60)
ACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGC < SRR14920174.4162786/151‑1 (MQ=60)
ACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGC < SRR14920174.6537349/151‑1 (MQ=60)
CATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCT > SRR14920174.735035/1‑151 (MQ=60)
ATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTG > SRR14920174.6767632/1‑151 (MQ=60)
TCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGC > SRR14920174.8218110/1‑151 (MQ=60)
TCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCANGAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCNTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGC > SRR14920174.5566614/1‑151 (MQ=60)
CACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCG > SRR14920174.6756352/1‑151 (MQ=60)
CAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGAC < SRR14920174.1675545/151‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATATAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTAC < SRR14920174.3776632/151‑1 (MQ=60)
GAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACGTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTG < SRR14920174.8886195/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920174.7550995/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920174.6177828/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920174.5475882/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920174.5324879/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA > SRR14920174.4278350/1‑151 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA > SRR14920174.4278367/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACT < SRR14920174.2089843/151‑1 (MQ=60)
GTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACT < SRR14920174.6398375/151‑1 (MQ=60)
TTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACTG < SRR14920174.1073576/151‑1 (MQ=60)
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GGAATAATCTGGATGAATGACAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTCCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACTG > NZ_CP025268/857349‑857644
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |