Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
990,729 |
A→G |
*183* (TAA→TAG) |
mepK → |
YcbK family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 990,729 | 0 | A | G | 99.7%
| 2548.3
/ NA
| 730 | *183* (TAA→TAG) | mepK | YcbK family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (397/330); minor base T (0/2); total (397/333) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 744 total aligned reads displayed.
GCGATGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAA > NZ_CP025268/990592‑990865
|
tGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGGGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATCTTGATACCGGGCCAGCTCGGCACTGGTAGTAATTg > 1:2692107/1‑140 (MQ=255)
tGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTg < 2:8584225/140‑1 (MQ=255)
tCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAAc > 2:870432/1‑140 (MQ=255)
tatTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGACAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGaaa < 2:650017/140‑1 (MQ=255)
tGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAg > 2:2408526/1‑140 (MQ=255)
cggTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:6620659/139‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAATCAATTTTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:1685123/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:1226434/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:911094/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:7497585/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:5931100/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:5755122/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 2:722720/140‑1 (MQ=255)
aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAgggg < 2:8933415/140‑1 (MQ=255)
aTCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTCGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGt > 1:7084721/1‑140 (MQ=255)
aTCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTCGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGt > 2:2177178/1‑140 (MQ=255)
tCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACTGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTa > 2:3306282/1‑140 (MQ=255)
tCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTa > 2:422725/1‑140 (MQ=255)
cgcgTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTAt > 2:7706904/1‑140 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAATGCCGCGGTATCTATGCGCGCTGGGGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTCGTCATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAAcga > 1:2308208/1‑138 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 1:3291113/140‑1 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 2:3660448/140‑1 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 1:1477842/140‑1 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 1:1323656/140‑1 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 2:6280176/140‑1 (MQ=255)
aaGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 1:8286613/140‑1 (MQ=255)
atatTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGta < 2:1325137/140‑1 (MQ=255)
gCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTc > 2:4056557/1‑140 (MQ=255)
gCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTc > 1:3653150/1‑140 (MQ=255)
aGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGt < 1:2779449/140‑1 (MQ=255)
cgcgTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCAc > 2:4784774/1‑140 (MQ=255)
cgcgTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCAc > 1:4515110/1‑140 (MQ=255)
cgcgTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCAc > 1:397726/1‑140 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 1:2202499/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 1:69929/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 2:1851289/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 1:68633/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 2:9234368/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 1:6435381/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 1:3566830/140‑1 (MQ=255)
tATCTAAGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGGGCATAGTGAGACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 2:5762353/140‑1 (MQ=255)
tCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATtc < 2:3845674/140‑1 (MQ=255)
tCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATtc < 2:6923397/140‑1 (MQ=255)
cgcgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAg > 2:4492970/1‑140 (MQ=255)
cgcgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAAGTGCTTAACGAAACAGGGGCAGGATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAg < 2:8115881/140‑1 (MQ=255)
cgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCAc < 1:9395363/125‑1 (MQ=255)
cgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCTCATTCTCCCAGaa < 2:1133050/140‑1 (MQ=255)
cgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGaa > 1:8807356/1‑140 (MQ=255)
cgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGaa > 1:2930244/1‑140 (MQ=255)
cgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGaa < 1:4257430/140‑1 (MQ=255)
cgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGaa < 1:4860177/140‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACt > 1:7727371/1‑140 (MQ=255)
cAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACt > 2:5311744/1‑140 (MQ=255)
aGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTg < 2:8403903/140‑1 (MQ=255)
ggtgTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCa < 1:1093344/140‑1 (MQ=255)
gtgtAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTACCAGAACTGTTCAt > 2:6656757/1‑140 (MQ=255)
tAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTGACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTaa > 1:5551068/1‑140 (MQ=255)
aGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCAGATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAAt < 2:6063529/140‑1 (MQ=255)
tattatCGACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGACCTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGACCTGGTCATTACTCTgg > 1:9554756/1‑140 (MQ=255)
tattatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTgg > 1:9269595/1‑140 (MQ=255)
tattatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTgg > 2:3200698/1‑140 (MQ=255)
ttctCCACCTCGCAACCTTGTTCATATGGCTCCCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAAGTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTCTGACCTATCGCATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATGAATCGGgtg < 2:507947/137‑1 (MQ=255)
ttatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtg > 1:8664716/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCa > 1:6069647/1‑118 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtgt > 1:4382588/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtgt > 1:627205/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtgt > 2:516140/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtgt > 1:5336063/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtgt > 1:5224494/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtgt > 2:4669986/1‑140 (MQ=255)
tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGGTCCTTAATCTGgtgt > 1:7837356/1‑140 (MQ=255)
tCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGa > 2:2981229/1‑140 (MQ=255)
tCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGa > 1:3103096/1‑140 (MQ=255)
cGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCAGTAATCTGGTGTGAACaa > 1:4718970/1‑140 (MQ=255)
gtagtaACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACaaa > 1:3489069/1‑140 (MQ=255)
gtaACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAAccc > 2:8195274/1‑140 (MQ=255)
taACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACGGGGAGTAATTGCTTAACGAAAGAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAGTCTCCCGGTACGGTTCATTAATCTGGTGTGAAGAAACCCg > 2:7371949/1‑140 (MQ=255)
aCTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCTCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTc > 1:5054592/1‑140 (MQ=255)
tgtgCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGATTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAATCCCGTCTGGc > 2:6993531/1‑140 (MQ=255)
tgtgCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCAATGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATATGGTGTGAACAAACCCGTCTGGc < 2:6117390/140‑1 (MQ=255)
tgtgCATAGTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGc > 2:3507049/1‑140 (MQ=255)
tgCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCg > 2:9407537/1‑140 (MQ=255)
tgCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCg > 2:5949786/1‑140 (MQ=255)
cacaatGACACCGGGCCAGCCCGGCACCGGTAGTAATAGCTTAACGACACAGGGGCACTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCa < 1:7276187/135‑1 (MQ=255)
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cATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCa > 2:7893222/1‑140 (MQ=255)
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ATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACGGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGT > SRR14920174.3031137/1‑151 (MQ=60)
TCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTC > SRR14920174.5083990/1‑151 (MQ=60)
CGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCCCCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGC > SRR14920174.7594402/1‑151 (MQ=60)
CGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGC > SRR14920174.957780/1‑151 (MQ=60)
CGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGC > SRR14920174.3720999/1‑151 (MQ=60)
TAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCG > SRR14920174.2470701/1‑151 (MQ=60)
TAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCG > SRR14920174.5827775/1‑151 (MQ=60)
TAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCG > SRR14920174.1339924/1‑151 (MQ=60)
TAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCG > SRR14920174.4319367/1‑151 (MQ=60)
AGGAACATTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGC < SRR14920174.7876584/151‑1 (MQ=60)
GTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCA > SRR14920174.5013238/1‑151 (MQ=60)
GTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCA > SRR14920174.4355652/1‑151 (MQ=60)
TAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCAC < SRR14920174.3610/151‑1 (MQ=60)
ACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTG > SRR14920174.1723767/1‑151 (MQ=60)
CTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGG > SRR14920174.1213369/1‑151 (MQ=60)
GTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGA > SRR14920174.8101345/1‑151 (MQ=60)
GTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTGCATTAATCTGGTGTGAACAAGCCCGGCTGGCCGCAGTGGTCGT > SRR14920174.7714873/1‑151 (MQ=60)
TGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGAT > SRR14920174.325147/1‑151 (MQ=60)
TGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGAT < SRR14920174.1267415/151‑1 (MQ=60)
GCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATC > SRR14920174.8709576/1‑151 (MQ=60)
GCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATC > SRR14920174.4072947/1‑151 (MQ=60)
cacaatgacACCGGGCCAGCCCGGCACCGGTAGTAATAGCTTAACGACACAGGGGCACTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCC < SRR14920174.7317356/142‑1 (MQ=60)
CATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCC > SRR14920174.7038659/1‑151 (MQ=60)
CATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCC < SRR14920174.3230932/151‑1 (MQ=60)
CATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATGAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCC < SRR14920174.3844267/151‑1 (MQ=60)
TATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTG > SRR14920174.449543/1‑151 (MQ=60)
TATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTG > SRR14920174.4859991/1‑151 (MQ=60)
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TATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTG > SRR14920174.1363894/1‑151 (MQ=60)
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TATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTG > SRR14920174.7296416/1‑151 (MQ=60)
ATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGG > SRR14920174.4649572/1‑151 (MQ=60)
TTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGC > SRR14920174.7056644/1‑151 (MQ=60)
agagacaGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCG < SRR14920174.92164/144‑1 (MQ=60)
TGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCG < SRR14920174.2683692/151‑1 (MQ=60)
ATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACACACCCGTCTGGtccgacacctcaaacagcgctga > SRR14920174.5670879/1‑128 (MQ=60)
ATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGAGCCTGGCGGC > SRR14920174.6405262/1‑151 (MQ=60)
TACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCG > SRR14920174.9359303/1‑151 (MQ=60)
TACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCG > SRR14920174.4891543/1‑151 (MQ=60)
GGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGC > SRR14920174.1313002/1‑151 (MQ=60)
GGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGC > SRR14920174.264637/1‑151 (MQ=60)
GGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCG > SRR14920174.4443156/1‑151 (MQ=60)
GCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAA > SRR14920174.5407757/1‑151 (MQ=60)
GCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAA < SRR14920174.2912439/151‑1 (MQ=60)
GCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAAAATCA > SRR14920174.1826825/1‑151 (MQ=60)
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GGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAAAATCAAACAG > SRR14920174.1077036/1‑151 (MQ=60)
GGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATACTGGCGGCGATGCGGAAAAAATCAAACAG > SRR14920174.9474066/1‑151 (MQ=60)
AGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAAAATCAAACAGGAA > SRR14920174.6520503/1‑151 (MQ=60)
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CACTAAAGGCCAGGCGATGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGGCGATGCGGAAAAAATCAAACAGGAA > NZ_CP025268/990579‑990878
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |