Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,535,342 |
T→C |
R405G (AGG→GGG) |
envZ ← |
two‑component system sensor histidine kinase EnvZ |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,535,342 | 0 | T | C | 99.5%
| 1462.0
/ NA
| 424 | R405G (AGG→GGG) | envZ | two‑component system sensor histidine kinase EnvZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (235/187); minor base A (2/0); total (237/187) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 424 total aligned reads displayed.
CCTTCTTTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCTTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTG > NZ_CP025268/3535206‑3535478
|
tcttTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGACTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAAATGCCAGCCCTAATcc > 2:587276/1‑140 (MQ=255)
tgttGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCCGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCCGCAACCCGTTCTGGTTAACCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCg > 2:183335/3‑140 (MQ=255)
tttGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGt < 2:599522/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGTCCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCACGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCCAATCCCGt < 2:3171706/140‑1 (MQ=255)
cgtGTCGGGCCCTGCGCCCGCGTGACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGCATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATAGGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGt < 2:7919915/138‑1 (MQ=255)
tGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGc < 2:3407968/140‑1 (MQ=255)
tGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGc < 1:6504089/140‑1 (MQ=255)
tCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCg < 1:990805/140‑1 (MQ=255)
gCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTaa > 2:4161342/1‑140 (MQ=255)
gCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTaa > 1:3471326/1‑140 (MQ=255)
cctgcgcgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTaa > 1:5132852/6‑140 (MQ=255)
cccTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGCAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAAt < 2:9530275/140‑1 (MQ=255)
cccTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAAt > 2:6961763/1‑140 (MQ=255)
cTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATgg < 1:1223011/140‑1 (MQ=255)
gcgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTg < 1:2208800/140‑1 (MQ=255)
cgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTgc > 2:1271457/1‑140 (MQ=255)
cgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTgc > 1:7376098/1‑140 (MQ=255)
cgcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCGAATGGGgc > 1:6571347/1‑140 (MQ=255)
cgTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCAc > 1:3762322/1‑140 (MQ=255)
ttACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTg > 2:1643286/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTc > 1:2980720/1‑140 (MQ=255)
ggCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTcgcc < 2:3480377/140‑1 (MQ=255)
aCTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCcgcg > 2:3877834/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCCCGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGAGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGAc > 2:4584422/1‑140 (MQ=255)
gCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTCATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACa > 2:6759935/1‑140 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa < 1:8296915/140‑1 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa < 2:7429744/140‑1 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa < 1:5395594/140‑1 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa < 1:1787756/140‑1 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAAGTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa < 2:5085806/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACg < 1:4732113/140‑1 (MQ=255)
cggCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGc < 2:8839921/139‑1 (MQ=255)
aGGCGCGCATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGGGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAAGTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCAAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGc < 2:7827494/140‑1 (MQ=255)
gcgcGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTg > 1:8086239/1‑140 (MQ=255)
cgAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACGGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGaa < 1:8824599/140‑1 (MQ=255)
gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAAc < 2:5723939/140‑1 (MQ=255)
gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAAc < 1:6782397/140‑1 (MQ=255)
gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAAc < 1:7720068/140‑1 (MQ=255)
gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAAc < 1:440854/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACACTTGCCAGCCCTAAGCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACACACGGCTGGAACa < 2:8700344/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACa > 1:1449873/1‑140 (MQ=255)
aaTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACa < 2:1206492/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACa < 2:2360112/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACa < 2:7040730/140‑1 (MQ=255)
aTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAg > 2:4031035/1‑140 (MQ=255)
aTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAg < 2:8292828/140‑1 (MQ=255)
aTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAg > 2:6806121/1‑140 (MQ=255)
aaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTCGGGTTATCCACGAAACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCt < 1:9371210/140‑1 (MQ=255)
ccgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACg < 1:1079740/140‑1 (MQ=255)
ccgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACg < 1:4161342/140‑1 (MQ=255)
cgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGCACAGGAGCTTACgt > 2:6575286/1‑140 (MQ=255)
cgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgt < 1:3850909/140‑1 (MQ=255)
ccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgttg > 1:5842490/1‑140 (MQ=255)
ccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgttg > 2:8145490/1‑140 (MQ=255)
ctcgctGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCg > 1:9146706/1‑140 (MQ=255)
tcgctGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCgg > 1:1628889/1‑140 (MQ=255)
gctGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTACTGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGgcg < 2:6203470/140‑1 (MQ=255)
tGCCAAGCTCCAGCATCCCGGTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAAtt > 2:7497292/1‑140 (MQ=255)
aGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCgg > 2:2690102/1‑140 (MQ=255)
cAGCCTCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTACTCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACACACGGCTGGACAAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCACTgcccggcccga > 2:8463760/1‑139 (MQ=255)
cAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGt > 2:227175/1‑140 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 1:3391155/140‑1 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 2:519821/140‑1 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt > 1:7890932/1‑140 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 1:3222912/140‑1 (MQ=255)
ccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGc < 2:9349941/52‑1 (MQ=255)
ccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTc > 2:3316785/1‑140 (MQ=255)
cGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTcc > 1:7664038/1‑140 (MQ=255)
ttATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCAc > 1:7070063/1‑140 (MQ=255)
tGGTTATCCACGANACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCNATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTg > 1:5533408/1‑140 (MQ=255)
gTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGa > 1:2394223/1‑140 (MQ=255)
gTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGa > 1:6261012/1‑140 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACCGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAAcc < 2:2011613/140‑1 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAAcc > 2:2115982/1‑140 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTAACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAAcc > 2:7198794/1‑140 (MQ=255)
tCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCa > 2:410310/1‑140 (MQ=255)
tCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCa > 1:5003248/1‑140 (MQ=255)
tCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCa > 1:4485668/1‑140 (MQ=255)
tCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGATCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCAACCTGGAAcaa > 1:6903709/1‑138 (MQ=255)
ccACGATACGCTGCACCATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACGGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAAGTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGACCCAg > 2:5678624/1‑140 (MQ=255)
cACGATACGCTGCACAAGTGCCAGCCCTAAGCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAgg < 2:1483459/140‑1 (MQ=255)
cGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGgcg > 2:3074539/1‑140 (MQ=255)
cGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGgcg < 1:3688501/140‑1 (MQ=255)
gATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGgcgc > 2:2553479/1‑140 (MQ=255)
aTACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGcgcg > 2:6535544/1‑140 (MQ=255)
tACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGa > 1:8576309/1‑140 (MQ=255)
gCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTc > 1:3078418/1‑140 (MQ=255)
tGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCAGGCGCACTTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGACCCAGGCGCGATTCgg > 2:2925633/1‑140 (MQ=255)
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CCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACACTTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGG < SRR14920174.549353/151‑1 (MQ=60)
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GGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGC < SRR14920174.494867/151‑1 (MQ=60)
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GAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCGGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCTGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACG < SRR14920174.9447374/151‑1 (MQ=60)
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GAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACG < SRR14920174.6439979/151‑1 (MQ=60)
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AATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGT < SRR14920174.8697004/151‑1 (MQ=60)
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CAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCT > SRR14920174.5996537/1‑151 (MQ=60)
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CAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCGTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCT > SRR14920174.8519260/1‑151 (MQ=60)
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ATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGA > SRR14920174.9587908/1‑151 (MQ=60)
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CCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATCC > SRR14920174.6339004/1‑151 (MQ=60)
CCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATCC > SRR14920174.516762/1‑151 (MQ=60)
CCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATCC < SRR14920174.2412044/151‑1 (MQ=60)
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TCCCGTTTATTTACCCTTCTTTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCTTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATCC > NZ_CP025268/3535192‑3535491
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |