Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
775 |
316.5 |
10245680 |
97.2% |
9958800 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
581,201 |
T→C |
pseudogene (667/667 nt) |
CXP41_RS03085 ← |
class I SAM‑dependent methyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 581,201 | 0 | T | C | 99.7%
| 1219.3
/ NA
| 362 | pseudogene (667/667 nt) | CXP41_RS03085 | class I SAM‑dependent methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (167/194); total (168/194) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
AATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑T‑GATGTTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGAT > NZ_CP025268/581068‑581334
|
gggtTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGTTATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGAGTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTg < 2:1694566/138‑1 (MQ=255)
tttGCTGAACCGTCTTGATACATCAACTGCACCTGATATGCAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCATCACCTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGaa < 2:3961478/139‑1 (MQ=255)
ttGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAg < 1:4800782/140‑1 (MQ=255)
gAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa < 1:2971266/140‑1 (MQ=255)
gAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa < 2:2229241/140‑1 (MQ=255)
gAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa < 1:2384968/140‑1 (MQ=255)
ccGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAAc > 2:1747767/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt < 1:4675207/140‑1 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGCGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:2549686/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:1103381/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:4485670/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:98480/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:1190422/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:1545996/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:709471/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:4911470/1‑140 (MQ=255)
gtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAATCGGAAAACATta < 2:5064525/140‑1 (MQ=255)
gtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATta < 1:369713/140‑1 (MQ=255)
gtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATta < 1:96891/140‑1 (MQ=255)
aTACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa < 1:1793468/129‑1 (MQ=255)
tACATCACCTGCACCTGCTATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 2:4402598/140‑1 (MQ=255)
tACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 1:2092755/140‑1 (MQ=255)
tACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 1:48860/140‑1 (MQ=255)
tACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 1:5004819/140‑1 (MQ=255)
tACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 1:859180/140‑1 (MQ=255)
tACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 1:1499267/140‑1 (MQ=255)
aCATCAACTGCAACTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAg < 2:474409/140‑1 (MQ=255)
tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 1:32426/1‑140 (MQ=255)
tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 1:3167924/1‑140 (MQ=255)
tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 1:2489180/1‑140 (MQ=255)
tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 2:5030251/1‑140 (MQ=255)
cACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAAc > 1:2239420/1‑140 (MQ=255)
cACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAAc > 1:2923531/1‑140 (MQ=255)
cACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTA‑TTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAAcc < 2:2048233/140‑1 (MQ=255)
tGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTa > 1:5101109/1‑140 (MQ=255)
gAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTaa < 2:4086848/140‑1 (MQ=255)
aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCCAGAACCTGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTTAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:1512706/1‑140 (MQ=255)
aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:1417552/1‑140 (MQ=255)
aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 2:3814688/1‑140 (MQ=255)
aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 2:3100627/1‑140 (MQ=255)
gTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGACGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACa < 2:1082425/140‑1 (MQ=255)
gCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATGATTGGGAGGATGCCGCAGCACGGCGTAAGCAAGAACATGCTGTGGT‑TGGATGCTATGTTTTTGGTGAAGCGTAAAACATGACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATtc > 2:4276752/1‑140 (MQ=255)
gCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATtc > 2:2435695/1‑140 (MQ=255)
gCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCCGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATtc > 2:4570332/1‑140 (MQ=255)
aCGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGa < 2:4691151/140‑1 (MQ=255)
aCGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGa < 1:3966755/140‑1 (MQ=255)
cGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaa < 2:1803161/140‑1 (MQ=255)
cGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaa < 2:2363418/140‑1 (MQ=255)
gAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaaa < 1:2804986/140‑1 (MQ=255)
gAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaaa < 2:4198762/140‑1 (MQ=255)
gAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaaa > 2:2821669/1‑140 (MQ=255)
ccTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGct < 2:2940451/140‑1 (MQ=255)
cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 1:894126/1‑140 (MQ=255)
cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 2:4804001/1‑140 (MQ=255)
cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 2:1138148/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGGTAGTAATCATTGCGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGCAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGACCCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct < 2:1621801/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGACATGctct < 2:1868611/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct < 1:727492/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct > 1:4330744/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct < 2:2254978/140‑1 (MQ=255)
gTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTg > 1:1929442/1‑140 (MQ=255)
tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 2:894160/140‑1 (MQ=255)
tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 2:1987369/140‑1 (MQ=255)
tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 1:2604476/140‑1 (MQ=255)
tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 2:1342126/140‑1 (MQ=255)
tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 1:3931432/140‑1 (MQ=255)
tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCGATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAATCTTGGTGTTAACATTCTCGAAAGGCTTTga > 2:4028717/1‑140 (MQ=255)
cAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTgag < 1:4040669/140‑1 (MQ=255)
aGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTgaga < 1:1867895/140‑1 (MQ=255)
gTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtata < 1:1077306/140‑1 (MQ=255)
gTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtata < 2:843547/140‑1 (MQ=255)
gTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtata < 1:1254334/140‑1 (MQ=255)
gTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtata < 1:1344733/140‑1 (MQ=255)
gTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtata < 1:2644770/140‑1 (MQ=255)
tAAACATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCCAGAACATGCTGCGGT‑TGGATACTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACGTTACTACAGTACCCTGAACCTTGGGTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTatat > 2:567944/1‑140 (MQ=255)
atcatcGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGct > 2:3945337/1‑126 (MQ=255)
aTCATTGGGGCTATGCCGCAGCACGTCGTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACCTTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGTGAGTATAtgt > 2:3762880/1‑140 (MQ=255)
aTCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATAtgt > 2:3259040/1‑140 (MQ=255)
aTCATTGGGAGGATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATTCTGCGGTGG‑GATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTATCGTTAACCTTGGTTTTAACAGTCGCGAAATTCTCTGAGAGtattttt > 2:1493914/1‑136 (MQ=255)
ttGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTa > 2:4973216/1‑140 (MQ=255)
ttGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTa > 2:4948267/1‑140 (MQ=255)
gggATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAg > 2:3326437/1‑140 (MQ=255)
gggATTATGCCGCAGCACGACTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCACGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAg > 2:3580685/1‑140 (MQ=255)
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aTGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCcttct > 1:4595994/1‑140 (MQ=255)
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tctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTG < SRR14920169.3580052/118‑1 (MQ=60)
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GGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTGTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAA > SRR14920169.3392802/1‑151 (MQ=60)
GGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAA > SRR14920169.4802860/1‑151 (MQ=60)
GATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAAT < SRR14920169.1878630/151‑1 (MQ=60)
CCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGT > SRR14920169.4486022/1‑151 (MQ=60)
CAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTT < SRR14920169.2616205/151‑1 (MQ=60)
CAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTT < SRR14920169.2616348/151‑1 (MQ=60)
CGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAA > SRR14920169.2543245/1‑151 (MQ=60)
GTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAA > SRR14920169.3961749/1‑151 (MQ=60)
CTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccggagcctatctcgtatgccgtcttctgcttgataaaaagaaagagcagg > SRR14920169.2851731/1‑69 (MQ=60)
CTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGA < SRR14920169.1084938/151‑1 (MQ=60)
AACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTG < SRR14920169.4206992/151‑1 (MQ=60)
AACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTG < SRR14920169.4910093/151‑1 (MQ=60)
CATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGAT < SRR14920169.2309869/151‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAA < SRR14920169.4872100/151‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTCGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAA < SRR14920169.4126177/151‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGATGCTATTTCTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAA < SRR14920169.4872018/151‑1 (MQ=60)
GGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATG > SRR14920169.685217/1‑151 (MQ=60)
GGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATG < SRR14920169.2646846/151‑1 (MQ=60)
GGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATG < SRR14920169.3216701/151‑1 (MQ=60)
GGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATG < SRR14920169.1181302/151‑1 (MQ=60)
GGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATG < SRR14920169.1181326/151‑1 (MQ=60)
GTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGC > SRR14920169.3936413/1‑151 (MQ=60)
TG‑GATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGC < SRR14920169.633933/151‑1 (MQ=60)
TG‑GATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGC < SRR14920169.566221/151‑1 (MQ=60)
TG‑GATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGC < SRR14920169.1806681/151‑1 (MQ=60)
ATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGCTGCCTTTCTGATTGTAGATGCGAATC > SRR14920169.4459158/1‑151 (MQ=60)
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GGAAAAAATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTT‑GATGTTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGCATC > NZ_CP025268/581062‑581348
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |