Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
775 |
316.5 |
10245680 |
97.2% |
9958800 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,183,367 |
C→T |
S170S (AGC→AGT) |
yegT → |
nucleoside permease |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,183,367 | 0 | C | T | 99.6%
| 817.5
/ NA
| 223 | S170S (AGC→AGT) | yegT | nucleoside permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (112/109); minor base G (1/0); total (114/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTGATTTCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGCTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATCCTGCTGCGCGATAAAAACTTCCTCGTCTTTTTC > NZ_CP025268/2183231‑2183502
|
tGATTTCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGTGTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAGATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCGGCGGCTGATTACCGCCGGAAggtctg > 2:1612060/1‑140 (MQ=255)
tGATTTCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAgttctg > 1:1491005/1‑140 (MQ=255)
gATTTCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAgttctgc > 1:4996159/1‑140 (MQ=255)
tttCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAgttctgctc > 1:4181047/1‑140 (MQ=255)
tCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGttctgctctg < 1:1468977/140‑1 (MQ=255)
ccGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTctgctctgct < 1:3835054/140‑1 (MQ=255)
ccGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTctgctctgct < 1:3971210/140‑1 (MQ=255)
ccGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTctgctctgct < 2:1784517/140‑1 (MQ=255)
gcgcATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCg < 1:320808/140‑1 (MQ=255)
gcgcATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCg > 1:2456656/1‑140 (MQ=255)
gcATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGgt < 2:1678216/140‑1 (MQ=255)
gcATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGgt < 2:3399333/140‑1 (MQ=255)
tCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGgtgt‑gt > 2:4963240/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑Gtt < 1:4709461/140‑1 (MQ=255)
tgATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCg < 1:451233/140‑1 (MQ=255)
gggCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGtttt < 2:4948679/140‑1 (MQ=255)
ggCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGttttt > 2:2945756/1‑140 (MQ=255)
ggCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGttttt > 1:819438/1‑140 (MQ=255)
ggCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGttttt > 2:2175960/1‑140 (MQ=255)
ggCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGGCTGGCGTGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGCGG‑GTTTGCTgtttt > 1:2596998/1‑140 (MQ=255)
gCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGAATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTc < 1:2847636/140‑1 (MQ=255)
cACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTcc > 2:3283324/1‑140 (MQ=255)
cACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTcc > 2:3218402/1‑140 (MQ=255)
tATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGGCGATGTCTCACCGACTAGCATCCCGCTGCTGATGACCGCGGGAAGTTCTGCTCTG‑TTGGTGTGGTTGGGGTTTTTCCTGc > 2:4126370/1‑140 (MQ=255)
tATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGc > 2:2473924/1‑140 (MQ=255)
gCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGAGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGACGTTCTGCTCTCCTCGGTGT‑GTTCGCGCTCTTCCTGCCCGac > 2:4585725/1‑140 (MQ=255)
cTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGaca < 2:4283048/140‑1 (MQ=255)
gATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGc < 2:728227/140‑1 (MQ=255)
gATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGc < 1:2195029/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCTCCGGTCTGGCGTGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTTCTGCCCGACATGcc > 2:3733299/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGcc > 1:663094/1‑140 (MQ=255)
ttGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGcca < 2:3144798/140‑1 (MQ=255)
tGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGccac > 1:2930430/1‑140 (MQ=255)
ccTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGccacca > 2:2210164/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGGTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCAc < 1:3074812/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCAc < 1:1379167/140‑1 (MQ=255)
ggCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCg > 2:3766812/1‑140 (MQ=255)
ggCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCg > 2:1890097/1‑140 (MQ=255)
ggCATGTGGTGACTTGCCGCAAATACTGGGATATGCCGATATCTCACCGACTACCATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGACGTTCAGCGCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCg > 2:3529654/1‑140 (MQ=255)
gCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCgg < 2:856444/140‑1 (MQ=255)
gtgGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCaaa < 1:4587774/140‑1 (MQ=255)
gtgGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCaaa < 1:2556565/140‑1 (MQ=255)
tgGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCaaaa > 1:4186780/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAAt < 1:3029994/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAAt < 1:1592607/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCCCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAAt < 1:501474/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCTTGACGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCTCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAAt < 2:1002965/140‑1 (MQ=255)
tttCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATgg > 2:677097/1‑140 (MQ=255)
ttCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGa < 1:2152095/140‑1 (MQ=255)
tCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGat > 1:1762345/1‑140 (MQ=255)
gCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCCAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTa < 2:717826/140‑1 (MQ=255)
gCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTa < 1:130961/140‑1 (MQ=255)
gCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTa < 1:274135/140‑1 (MQ=255)
tACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATg < 1:3235497/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTGTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 1:4262859/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAACGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 1:33969/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 1:1039640/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 2:806305/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 2:5078890/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 2:4865908/140‑1 (MQ=255)
cTGGGCTACGCCGATATCTCACGGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCGGCTCTGCTCGGTGT‑GTATGCGTTTTTCCTGCCTGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt < 2:2830516/140‑1 (MQ=255)
ggggTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGGTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCg > 2:2197330/1‑140 (MQ=255)
ggTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGc > 1:1746583/1‑140 (MQ=255)
gcgagtccGATATCTCTACGACTTACATCCCGCTGCTGATTACCGTCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGGGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCCTCGGCAAAATGGATATTATAGTCATGCTCGGc < 2:3021689/134‑1 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTc < 1:1822167/79‑1 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTa > 2:4675349/1‑122 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCt > 2:1429871/1‑132 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTgg > 1:1964177/1‑140 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTgg > 2:1360797/1‑140 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTgg > 2:5054161/1‑140 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTgg > 1:2283223/1‑140 (MQ=255)
tGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTgg > 2:1931879/1‑140 (MQ=255)
gCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGa < 1:4851045/140‑1 (MQ=255)
caatatCACACCGACCAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGTTCTGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATg < 2:3344971/138‑1 (MQ=255)
gATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATgc < 2:1317759/140‑1 (MQ=255)
gATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATgc < 1:694851/140‑1 (MQ=255)
atatCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATgcg > 1:2500764/1‑140 (MQ=255)
atatCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATgcg > 1:3353998/1‑140 (MQ=255)
atatCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATgcg > 1:866246/1‑140 (MQ=255)
tatCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATgcgc < 1:4655138/140‑1 (MQ=255)
atCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCt > 1:2055796/1‑140 (MQ=255)
tctcACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATACGCTg > 2:4495515/1‑140 (MQ=255)
tcACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGAt > 2:3935762/1‑140 (MQ=255)
tcACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCCCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCTACACGCCACCAACAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTGGGACTGGATGCGCTGAt > 2:3116320/1‑140 (MQ=255)
aCCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGTATGCGCTGATcc > 1:1066769/1‑140 (MQ=255)
aCCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATcc > 2:3924300/1‑140 (MQ=255)
aCCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATcc > 1:4916002/1‑140 (MQ=255)
cccGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGT‑GTTTGCGTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTACAGTTATGCTCGGCCTGGATGCGATGAACATGCTGCGCGATa > 2:1369430/1‑140 (MQ=255)
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GGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCCCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAG < SRR14920169.502643/151‑1 (MQ=60)
GTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGT < SRR14920169.4205069/151‑1 (MQ=60)
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TTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCA < SRR14920169.2156968/151‑1 (MQ=60)
gagacagATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTC < SRR14920169.4686727/144‑1 (MQ=60)
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GCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTC < SRR14920169.131300/151‑1 (MQ=60)
GCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTC < SRR14920169.274762/151‑1 (MQ=60)
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CAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCC < SRR14920169.90415/151‑1 (MQ=60)
CAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCC < SRR14920169.1525858/151‑1 (MQ=60)
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GTTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATCCTGCTGCGCGATAAAAACTTCCTCGTCTTTTTCTTCTGTTCATTCCT > SRR14920169.2890164/1‑151 (MQ=60)
TTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATCCTGCTGCGCGATAAAAACTTCCTCGTCTTTTTCTTCTGTTCATTCCTG < SRR14920169.2163044/151‑1 (MQ=60)
TTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATCCTGCTGCGCGATAAAAACTTCCTCGTCTTTTTCTTCTGTTCATTCCTG < SRR14920169.2163630/151‑1 (MQ=60)
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GCCGGATGTTGAGCGTGATTTCCCGCGCATTCGTGTGATGGGCACTATCGGCTGGATTGCCTCCGGTCTGGCATGTGGTTTCTTGCCGCAAATACTGGGGTATGCCGATATCTCACCGACTAACATCCCGCTGCTGATTACCGCCGGAAGCTCTGCTCTGCTCGGTGTGTTTGC‑GTTTTTCCTGCCCGACACGCCACCAAAAAGCACCGGCAAAATGGATATTAAAGTCATGCTCGGCCTGGATGCGCTGATCCTGCTGCGCGATAAAAACTTCCTCGTCTTTTTCTTCTGTTCATTCCTG > NZ_CP025268/2183217‑2183517
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |