| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F50 I1 R1 | 775 | 316.5 | 10245680 | 97.2% | 9958800 | 138.8 |
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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CXP41_RS16620 → CXP41_RS16625 → |
IS3‑like element IS2 family transposase fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,188,101 | 0 | A | G | 99.6% | 722.3 / NA | 228 | *410* (TAA→TAG) R6G (AGG→GGG) | CXP41_RS16620 CXP41_RS16625 | IS3‑like element IS2 family transposase fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (113/114); minor base C (0/1); total (113/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAAGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGG > NZ_CP025268/3187975‑3188234 | tGCAGAGGCGTTCGAGAATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGt < 1:1678442/140‑1 (MQ=2) cAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGCATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTTCGGCAGCGGGCTTGTCATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGACATATCGGGGCAAATCCAGTTa < 2:2606574/140‑1 (MQ=11) cAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTa < 1:4488224/140‑1 (MQ=17) cAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTa < 2:3929979/140‑1 (MQ=17) cAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTa < 2:1375773/140‑1 (MQ=17) gagGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatc < 2:3440998/140‑1 (MQ=18) gCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatcatc < 2:4519689/140‑1 (MQ=37) ttCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCAtt > 2:1055672/1‑140 (MQ=255) ttCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCAtt > 1:841418/1‑140 (MQ=255) gAGCATTATGTCGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGCAATATCTGCGGCCGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACCGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGt < 2:4886353/140‑1 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TCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTGGTAATGGGATAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACA > SRR14920169.2737202/1‑151 (MQ=60) CCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAA < SRR14920169.4664595/151‑1 (MQ=60) GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAG > SRR14920169.1993487/1‑151 (MQ=60) TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGACTTCAACAAAGATT < SRR14920169.4401683/151‑1 (MQ=60) GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccggagcctatctcgtatgccgt > SRR14920169.64868/1‑96 (MQ=0) GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTA > SRR14920169.3050510/1‑151 (MQ=60) CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATC < SRR14920169.115115/151‑1 (MQ=60) CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATC < SRR14920169.35444/151‑1 (MQ=60) CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATC < SRR14920169.1250809/151‑1 (MQ=60) CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATC < SRR14920169.760643/151‑1 (MQ=60) CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATC < SRR14920169.2208671/151‑1 (MQ=60) CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATC < SRR14920169.1992370/151‑1 (MQ=60) GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCG < SRR14920169.4565173/151‑1 (MQ=60) GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCATCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAG > SRR14920169.5068068/1‑151 (MQ=60) GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAG > SRR14920169.3351217/1‑151 (MQ=60) GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAG > SRR14920169.3350319/1‑151 (MQ=60) GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAG > SRR14920169.4111362/1‑151 (MQ=60) GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAG > SRR14920169.1726958/1‑151 (MQ=60) GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCC > SRR14920169.1853300/1‑151 (MQ=60) GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCC > SRR14920169.3578716/1‑151 (MQ=60) TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATCACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAG < SRR14920169.3651811/151‑1 (MQ=60) TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACATATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAG < SRR14920169.3651858/151‑1 (MQ=60) TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAG < SRR14920169.2254227/151‑1 (MQ=60) TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAG < SRR14920169.3667749/151‑1 (MQ=60) GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCTTCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGCTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGAT < SRR14920169.3071625/151‑1 (MQ=60) GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGAT < SRR14920169.1143190/151‑1 (MQ=60) GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGAT < SRR14920169.3388073/151‑1 (MQ=60) GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGAT < SRR14920169.566983/151‑1 (MQ=60) GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGAT < SRR14920169.3710632/151‑1 (MQ=60) GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAACTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGAT < SRR14920169.2745148/151‑1 (MQ=60) CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGA > SRR14920169.2590814/1‑151 (MQ=60) CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGA > SRR14920169.2590958/1‑151 (MQ=60) CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGA > SRR14920169.113527/1‑151 (MQ=60) CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGA > SRR14920169.4158096/1‑151 (MQ=60) CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAA > SRR14920169.2358746/1‑151 (MQ=60) CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAA > SRR14920169.2357982/1‑151 (MQ=60) CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAA < SRR14920169.4802766/151‑1 (MQ=60) ggagatgtgtataagagacaGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAAC < SRR14920169.4580944/131‑1 (MQ=60) GAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTTAAAACGT > SRR14920169.3816455/1‑151 (MQ=60) GAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGT > SRR14920169.3820950/1‑151 (MQ=60) ATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAAC > SRR14920169.338701/1‑151 (MQ=60) CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCT > SRR14920169.1434081/1‑151 (MQ=60) GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCC < SRR14920169.4391141/151‑1 (MQ=60) GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAGTTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTG > SRR14920169.3899182/1‑151 (MQ=60) GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCGACAAAGATTTAATCGAGGCCTAAGATCGTGATAACGTTAACCTTTCCCAATTTG > SRR14920169.1977135/1‑151 (MQ=60) GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTG > SRR14920169.592022/1‑151 (MQ=60) GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTG > SRR14920169.3893327/1‑151 (MQ=60) GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTG > SRR14920169.21960/1‑151 (MQ=60) TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAAC < SRR14920169.3466205/151‑1 (MQ=60) TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAAC < SRR14920169.186018/151‑1 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT > SRR14920169.5006810/1‑151 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT > SRR14920169.1902507/1‑151 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT > SRR14920169.1902247/1‑151 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT < SRR14920169.4052104/151‑1 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT > SRR14920169.1557835/1‑151 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT > SRR14920169.3627182/1‑151 (MQ=60) GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCACTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGACGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACT < SRR14920169.2859171/151‑1 (MQ=60) GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGG > SRR14920169.4864106/1‑151 (MQ=60) GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAATATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGC > SRR14920169.1745552/1‑151 (MQ=60) GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGC > SRR14920169.4560488/1‑151 (MQ=60) GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCC > SRR14920169.3015567/1‑151 (MQ=60) GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCC > SRR14920169.3015279/1‑151 (MQ=60) GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCC < SRR14920169.2361007/151‑1 (MQ=60) GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCC < SRR14920169.1298073/151‑1 (MQ=60) AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATT > SRR14920169.4403512/1‑151 (MQ=60) AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATT > SRR14920169.1461902/1‑151 (MQ=60) AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATT > SRR14920169.4664989/1‑151 (MQ=60) GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTA > SRR14920169.5008033/1‑151 (MQ=60) GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTA > SRR14920169.2280653/1‑151 (MQ=60) GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTA > SRR14920169.2281705/1‑151 (MQ=60) TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTAC < SRR14920169.4453780/151‑1 (MQ=60) TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGATGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAGACTGATGGCCAATTAC > SRR14920169.4078700/1‑151 (MQ=60) TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTAATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCG > SRR14920169.3885293/1‑151 (MQ=60) ACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTC > SRR14920169.3204585/1‑151 (MQ=60) GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAA > SRR14920169.4354313/1‑151 (MQ=60) GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAA > SRR14920169.4160916/1‑151 (MQ=60) TGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTATTCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATAT < SRR14920169.3741873/151‑1 (MQ=60) TGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATAT < SRR14920169.1598778/151‑1 (MQ=60) TGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATAT < SRR14920169.4179661/151‑1 (MQ=60) TGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATAT < SRR14920169.4036261/151‑1 (MQ=60) 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AGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGC < SRR14920169.2816722/151‑1 (MQ=60) | CGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAAGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGC > NZ_CP025268/3187951‑3188250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |