Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
258 |
516.3 |
22354760 |
99.3% |
22198276 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,198,405 |
T→C |
intergenic (+31/+37) |
PA14_RS23800 → / ← mdpA |
ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,198,405 | 0 | T | C | 99.8%
| 1607.1
/ NA
| 410 | intergenic (+31/+37) | PA14_RS23800/mdpA | ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (183/226); minor base A (0/1); total (183/227) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 414 total aligned reads displayed.
GATGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCTTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCAGGCGAATGCCGAACTCGCC > NC_008463/5198257‑5198552
|
gATGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTATTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCctt < 2:5836009/151‑1 (MQ=255)
aTGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTg < 1:10660969/151‑1 (MQ=255)
tGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGc < 1:8017691/151‑1 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCt < 1:5333223/151‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc < 2:135322/151‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc < 1:1134962/151‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc > 2:3621959/1‑151 (MQ=255)
tGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTcc < 1:5709652/151‑1 (MQ=255)
ggTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTccc < 1:4747021/151‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgc < 1:5400508/151‑1 (MQ=255)
tGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCCGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAATCCCTGGCCCATGCCTTCCCGCGTgcggc > 1:8618147/1‑151 (MQ=255)
cgcATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGtt < 2:1669116/151‑1 (MQ=255)
ctCCGATGCTGTTCGACGCGCAACGCACGAACGTCAGCGGCTACCTCATGAGCCCGATGTCGCCGCGGGACCTTCCGCGGGTGCAGCTGGACCGAGCGCAGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATc < 2:4942304/150‑1 (MQ=255)
aTCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATc > 1:4027300/1‑151 (MQ=255)
tCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCg > 1:8490237/1‑151 (MQ=255)
gTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGttg > 1:6947780/1‑150 (MQ=255)
tGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcgg > 2:8905903/1‑151 (MQ=255)
tGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcgg > 2:1841013/1‑151 (MQ=255)
tGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTagg > 1:10837076/1‑151 (MQ=255)
tGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCAACCGGGAAGCCCAGGCCCGTGGCTTCCCGCGTGCGGCGGTATAGTTagg > 1:2855720/1‑151 (MQ=255)
aTGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggcc > 2:5619568/1‑151 (MQ=255)
aTGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggcc < 1:9220878/151‑1 (MQ=255)
gTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggccgg < 2:2085238/151‑1 (MQ=255)
gTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggccgg < 1:5432930/151‑1 (MQ=255)
ttCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACGTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggccggc > 2:3353682/1‑151 (MQ=255)
caacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccgcc < 1:8886778/151‑1 (MQ=255)
gcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAgg < 2:6789149/151‑1 (MQ=255)
aaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGcc > 1:3505772/1‑151 (MQ=255)
aaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGcc > 1:8251558/1‑151 (MQ=255)
aaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGcc > 2:150012/1‑151 (MQ=255)
aaCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACATTTCGCGGGTGAAGCTGGACCGAACGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGaa < 1:4228663/151‑1 (MQ=255)
aCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAg > 1:7769891/1‑151 (MQ=255)
aCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAg < 2:7490634/151‑1 (MQ=255)
cGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAgg > 1:6749007/1‑151 (MQ=255)
gTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAggg < 1:3306743/151‑1 (MQ=255)
tCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGa < 2:7281239/151‑1 (MQ=255)
cAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAt < 2:2572058/151‑1 (MQ=255)
gCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGGGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGTAGGGAtcg > 1:4286460/1‑151 (MQ=255)
gCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtcg < 1:999334/151‑1 (MQ=255)
aCCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATg > 2:9613128/1‑151 (MQ=255)
ccGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgg < 2:7685851/151‑1 (MQ=255)
gCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggac < 1:10079410/151‑1 (MQ=255)
gCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggac > 1:7298664/1‑151 (MQ=255)
gCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggac > 1:6249046/1‑151 (MQ=255)
cATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacg > 2:10310512/1‑151 (MQ=255)
aTGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacgg < 1:8767193/151‑1 (MQ=255)
gCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTc < 1:9612175/151‑1 (MQ=255)
cccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCg < 2:6307728/151‑1 (MQ=255)
cccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCg < 1:3870577/151‑1 (MQ=255)
ccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTggg < 2:403486/151‑1 (MQ=255)
ccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCgg < 2:9804758/151‑1 (MQ=255)
cGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGt < 2:8077082/151‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTg < 2:7059122/151‑1 (MQ=255)
ggCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGa < 1:2989409/151‑1 (MQ=255)
cgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCa < 2:4148118/151‑1 (MQ=255)
cgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCa > 1:9726516/1‑151 (MQ=255)
gggACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAg < 1:8190682/151‑1 (MQ=255)
gACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCg < 2:6970756/151‑1 (MQ=255)
gACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCg < 2:6265173/151‑1 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGt > 2:9355361/1‑151 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGt > 1:10034944/1‑151 (MQ=255)
cTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGAACGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTg < 1:7013476/151‑1 (MQ=255)
tttCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGt < 1:3098365/151‑1 (MQ=255)
tCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtcc < 2:799100/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtcct < 1:10192090/151‑1 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcc < 1:5200678/151‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcct > 2:11088138/1‑151 (MQ=255)
tGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctcc > 2:11021386/1‑151 (MQ=255)
tGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctcc < 2:7899662/151‑1 (MQ=255)
aaGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTTGCCCTTGCCTTACCGCGTGCGGGGTTAACGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCCGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGt > 1:10155837/1‑151 (MQ=255)
tGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATg < 2:10226958/151‑1 (MQ=255)
tGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCATCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGCGGCCGAAGGGATCGGCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATg > 1:2646752/1‑151 (MQ=255)
ggACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGt > 2:473618/1‑151 (MQ=255)
tGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGaa < 1:8998800/151‑1 (MQ=255)
gATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAg < 1:1746517/151‑1 (MQ=255)
tCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTg < 1:11047089/151‑1 (MQ=255)
cGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGa > 2:10881963/1‑151 (MQ=255)
cTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCTGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGAtc < 2:8587423/151‑1 (MQ=255)
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cTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCGTGCCCTTGCCTTGCCGCGTGCGGCTTTATCGTTCTGCCGGGTCATCCGGCGAGGCCGATGTGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGAtc < 2:7110199/151‑1 (MQ=255)
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AACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCG < SRR18135069.4475577/151‑1 (MQ=60)
AACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCG < SRR18135069.169724/151‑1 (MQ=60)
AACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACATTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGATGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCG < SRR18135069.4475402/151‑1 (MQ=60)
ACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGA < SRR18135069.9346193/151‑1 (MQ=60)
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GCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGAC > SRR18135069.7327404/1‑151 (MQ=60)
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ATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGG < SRR18135069.8801073/151‑1 (MQ=60)
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GAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGAC < SRR18135069.3941780/151‑1 (MQ=60)
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AGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCCGGAAGCCCAGGCCCGTGCCCTCCCCCGGGCGGCGTTATAGTTAGGCCGGCGCAGCCCCCGAGGCCGAAGGGgtaggcctaggacggccacgggttggtgtaccagcgggggccatacaccggc > SRR18135069.9494874/1‑99 (MQ=40)
GCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTTGCCCGTGCCATGCCGCGTGCGGGGGTTTAGTTCGGCCGGCGCACCCGCCGTGGCCGAAGGGTTCGGGGATGGTCGGGCTCGGGTGGGTGGACCAGCGTGGGGCTTCCTCCGTCA > SRR18135069.10768917/1‑151 (MQ=32)
CTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCAT < SRR18135069.8665134/151‑1 (MQ=60)
TGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCATCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGCGGCCGAAGGGATCGGCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATG > SRR18135069.2657532/1‑151 (MQ=60)
GACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTA < SRR18135069.9590023/151‑1 (MQ=60)
GACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTA < SRR18135069.11083615/151‑1 (MQ=60)
TGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAA < SRR18135069.9033421/151‑1 (MQ=60)
GATCGCTGCGCCGCACGCGGGAATCCCTTGCCCATTCCATACCGCGTGCGGCGTTAACGTTCGGCCGGCTCACCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATTGACCGACTCGGTTGGGTTTACCAGCGTGGTCCTTCCaacgtactgtagaag > SRR18135069.8061515/1‑136 (MQ=60)
GATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAG < SRR18135069.1753726/151‑1 (MQ=60)
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CGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGA < SRR18135069.5009414/151‑1 (MQ=60)
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CGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTC > SRR18135069.9243331/1‑151 (MQ=60)
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GCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCC < SRR18135069.3989487/151‑1 (MQ=60)
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CCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCA > SRR18135069.5431842/1‑151 (MQ=60)
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
