Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
258 |
544.5 |
23589312 |
99.3% |
23424186 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,103,303 |
G→T |
T247N (ACC→AAC) |
ftsZ ← |
cell division protein FtsZ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,103,303 | 0 | G | T | 99.4%
| 2202.2
/ NA
| 529 | T247N (ACC→AAC) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base T (309/217); total (309/220) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 531 total aligned reads displayed.
GCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCGG > NC_008463/5103155‑5103450
|
gCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTg < 1:3441715/151‑1 (MQ=255)
gCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTAGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTg < 1:10223947/151‑1 (MQ=255)
ccACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCg > 2:5333626/1‑151 (MQ=255)
ccACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCg > 1:5546044/1‑151 (MQ=255)
aCCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGa < 1:4586295/151‑1 (MQ=255)
aCCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGa > 1:6148521/1‑151 (MQ=255)
cTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGAtt > 2:11307855/1‑151 (MQ=255)
tCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgc < 2:4228137/151‑1 (MQ=255)
acaGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgccg > 2:10469089/1‑151 (MQ=255)
tGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGGTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTc < 2:11492402/151‑1 (MQ=255)
ggCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCCGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCg > 1:2632346/1‑151 (MQ=255)
cGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCggt > 1:11421458/1‑150 (MQ=255)
gTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCggtg > 1:3078249/1‑149 (MQ=255)
gCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGc > 1:9316690/1‑151 (MQ=255)
tCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCt < 1:4546456/151‑1 (MQ=255)
cGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTc > 1:10993503/1‑151 (MQ=255)
tgAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcg > 2:2158895/2‑151 (MQ=255)
gAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcgc < 1:8918359/151‑1 (MQ=255)
gAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcgc > 2:7403187/1‑151 (MQ=255)
aaGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTcgcg > 2:7186079/1‑151 (MQ=255)
aGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCgg > 2:3455434/1‑151 (MQ=255)
aGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCgg > 1:421422/1‑151 (MQ=255)
aGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCgg > 2:2445416/1‑151 (MQ=255)
gCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCggg > 2:974729/1‑151 (MQ=255)
cGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGc > 1:7726073/1‑151 (MQ=255)
aaCTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCAc < 2:8471468/151‑1 (MQ=255)
aCTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACg > 1:5798524/1‑151 (MQ=255)
aCTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACg < 1:6385554/151‑1 (MQ=255)
ttCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTc < 2:4843366/151‑1 (MQ=255)
tCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCg > 1:9681362/1‑151 (MQ=255)
tCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCg > 2:7592548/1‑151 (MQ=255)
tCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCg > 2:4675924/1‑151 (MQ=255)
tgTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCt < 2:3659890/151‑1 (MQ=255)
tgTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCt > 1:509694/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTg > 2:2857966/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTg < 1:877340/151‑1 (MQ=255)
ttGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTgg > 2:8985226/1‑151 (MQ=255)
gCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGgcg > 2:8665348/1‑151 (MQ=255)
gACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAg > 2:4020403/1‑151 (MQ=255)
tCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCgg < 1:4056810/151‑1 (MQ=255)
cGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGt < 1:11610510/151‑1 (MQ=255)
ggAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTa > 2:11643154/1‑151 (MQ=255)
aGTACTCGCCCAGGGACAGCTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTAcc < 2:6897344/151‑1 (MQ=255)
cTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcatc > 2:9434865/1‑151 (MQ=255)
cgcccagggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcatcat > 1:10718518/7‑151 (MQ=255)
gcccagggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCatcatc < 2:10114485/146‑1 (MQ=255)
ccagggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGc < 2:439840/148‑1 (MQ=255)
ccagggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGc < 2:8037034/148‑1 (MQ=255)
ccagggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGc > 1:247721/4‑151 (MQ=255)
agggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCa > 1:1955665/2‑151 (MQ=255)
gggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCAt < 2:3287292/151‑1 (MQ=255)
gggACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCAt < 1:9987223/151‑1 (MQ=255)
gACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGGTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGc > 2:2516571/1‑151 (MQ=255)
tCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCAttt > 1:4473007/1‑151 (MQ=255)
cGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCg > 1:6832623/1‑151 (MQ=255)
gACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCt < 1:10013499/151‑1 (MQ=255)
cccGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCa > 1:2268209/1‑151 (MQ=255)
ccGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCAt > 1:1368041/1‑151 (MQ=255)
gcgGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCATCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGa < 2:6093408/151‑1 (MQ=255)
gcgGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGa < 1:5473865/151‑1 (MQ=255)
tGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGt < 2:9251706/151‑1 (MQ=255)
tGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGt < 1:8080453/151‑1 (MQ=255)
aTGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCt > 1:6013617/1‑151 (MQ=255)
gTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTc > 1:7242452/1‑151 (MQ=255)
ttCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCa < 2:9557244/151‑1 (MQ=255)
tCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCAc > 1:9791699/1‑151 (MQ=255)
cACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACg < 2:3914991/151‑1 (MQ=255)
aCCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGt < 2:6598578/151‑1 (MQ=255)
ccAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTc < 2:8687774/151‑1 (MQ=255)
ccAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTc < 1:8449035/151‑1 (MQ=255)
ccAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTc > 1:11306041/1‑151 (MQ=255)
caggatgCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCg < 1:8643560/148‑1 (MQ=255)
caggatgCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCg > 1:11494932/4‑151 (MQ=255)
caggatgCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCg > 2:7751778/4‑151 (MQ=255)
tgCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTATTCACGTCGTCGaa < 2:10955564/151‑1 (MQ=255)
gCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAg > 1:11128984/1‑151 (MQ=255)
gcgcgcgcCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCg > 1:9389512/1‑151 (MQ=255)
cgcgcgcCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGa > 1:2946833/1‑151 (MQ=255)
cgcgcCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACg > 1:1590985/1‑151 (MQ=255)
cgcCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGtt < 1:7996154/151‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTTGTCGTCTTCCAGCTGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCTCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATTCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGa < 2:6298483/151‑1 (MQ=255)
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GGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGC > SRR18135070.5638659/1‑151 (MQ=60)
GGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGC < SRR18135070.11590739/151‑1 (MQ=60)
GGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGC < SRR18135070.1765415/151‑1 (MQ=60)
GGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGC < SRR18135070.4106119/151‑1 (MQ=60)
GGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGC < SRR18135070.11160976/151‑1 (MQ=60)
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ATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGA > SRR18135070.4255262/1‑151 (MQ=60)
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GCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAG < SRR18135070.2599998/151‑1 (MQ=60)
CCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGT > SRR18135070.10006244/1‑151 (MQ=60)
GCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCG > SRR18135070.2175376/1‑151 (MQ=60)
CGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACG < SRR18135070.10782165/151‑1 (MQ=60)
CGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACG > SRR18135070.1598310/1‑151 (MQ=60)
CGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTT < SRR18135070.6915656/151‑1 (MQ=60)
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GCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTG > SRR18135070.6034224/1‑151 (MQ=60)
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TGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGG < SRR18135070.1433071/151‑1 (MQ=60)
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CCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGAT > SRR18135070.5706778/1‑151 (MQ=60)
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GTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCGGAG < SRR18135070.239703/151‑1 (MQ=60)
GTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCGGAG > SRR18135070.7911257/1‑151 (MQ=60)
TTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCGGAGA < SRR18135070.6175093/151‑1 (MQ=60)
|
GTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCGGAGA > NC_008463/5103153‑5103453
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
