Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
258 |
497.4 |
21541912 |
99.2% |
21369576 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
6,130,460 |
A→G |
F403S (TTC→TCC) |
argA ← |
amino‑acid N‑acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 6,130,460 | 0 | A | G | 75.8%
| 871.5
/ inf
| 457 | F403S (TTC→TCC) | argA | amino‑acid N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/58); new base G (178/166); total (232/225) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 462 total aligned reads displayed.
CCTGATCAGCAACTGAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTGGCGGTACTCCGGGTTGACCGCCAGACAGGCCA > NC_008463/6130311‑6130610
|
aGCAACTGAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCgcgc < 2:1523352/151‑1 (MQ=255)
cAACTGAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTc > 2:9532571/1‑151 (MQ=255)
aaCTGAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCAGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTcg > 1:6332674/1‑151 (MQ=255)
cTGAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTcgcg < 1:85677/151‑1 (MQ=255)
gAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGa < 1:2169213/151‑1 (MQ=255)
gAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCa < 2:3354976/151‑1 (MQ=255)
aGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGt < 1:6841384/151‑1 (MQ=255)
ccGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCGGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACCGCGAGGCCCGCGCCGCCGGGAGCCGCTCTCCGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTgc < 2:966177/151‑1 (MQ=255)
ccGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGATCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTgc < 1:5137003/151‑1 (MQ=255)
ccccTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCcg < 2:5610304/151‑1 (MQ=255)
cccTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCcgc > 1:815202/1‑151 (MQ=255)
cccTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCcgc < 2:10174048/151‑1 (MQ=255)
ccgcCCAGGGACGCGCCGGCGGAACACAGGCTCTTCTCGAATCCCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGAAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCACGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCgtgg < 1:3580620/150‑1 (MQ=255)
gcCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCgtggtg > 1:9528010/1‑151 (MQ=255)
ccAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAg > 1:8225680/1‑151 (MQ=255)
aGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCa > 2:10501766/1‑151 (MQ=255)
aGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCa < 1:6617467/151‑1 (MQ=255)
cgcgCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAAc > 1:1269901/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACa < 2:90448/151‑1 (MQ=255)
cgcCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAg < 1:2379957/151‑1 (MQ=255)
ccGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAggg < 1:10026374/151‑1 (MQ=255)
ggcggATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTc < 2:4787742/151‑1 (MQ=255)
gATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCa > 2:3503939/1‑151 (MQ=255)
gATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCa > 2:8582059/1‑151 (MQ=255)
aTCACAGGCTCTTCTCGAATACATGCGAATTGAGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAg > 2:10259211/1‑151 (MQ=255)
tCACAGGCTCTTCTCGAAGACCTGCGAAGTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAgg < 2:5390730/151‑1 (MQ=255)
cacaGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGc < 1:9723545/151‑1 (MQ=255)
cacaGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGc > 1:4977227/1‑151 (MQ=255)
cacaGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGc < 1:8883951/151‑1 (MQ=255)
acaGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGcc < 1:6196249/151‑1 (MQ=255)
acaGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGACCCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCGTCAGGcc > 2:6112399/1‑151 (MQ=255)
ggCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAg > 2:6884219/1‑151 (MQ=255)
ctctTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTc > 2:6287130/1‑151 (MQ=255)
ctactcGAATACCTGCGAATAGCGATGGAAGTAGTACAGCGAGGCCCGCGACGAATGTAGCAGCTCAACGAATCTGGGCTGGAAGACGCTCTCGCGGAACCAGTGCTCGGTCCGCGTGGTGAGCACTAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcg > 2:3139682/4‑151 (MQ=255)
ttctCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcgc < 1:1424243/151‑1 (MQ=255)
ctcGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCAGGGAGACGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcgcgc > 2:258547/1‑151 (MQ=255)
tcGAATACCTGCGAAGTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcgcgcg < 2:3926411/151‑1 (MQ=255)
gAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGACCCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcgcgcgcg > 2:5867229/1‑151 (MQ=255)
gAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcgcgcgcg < 1:10716431/151‑1 (MQ=255)
gAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCcgcgcgcg > 2:10608085/1‑151 (MQ=255)
aCCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGct > 1:1838402/1‑151 (MQ=255)
cTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGctcc > 1:10354802/1‑151 (MQ=255)
tGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGctcct > 1:4165031/1‑151 (MQ=255)
gCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGctcctc < 2:1112847/151‑1 (MQ=255)
gCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGctcctc < 1:3291363/151‑1 (MQ=255)
gCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGctcctc < 2:4457545/151‑1 (MQ=255)
cGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCg > 2:8049360/1‑151 (MQ=255)
cGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCg > 2:8427253/1‑151 (MQ=255)
gAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGa > 1:5793834/1‑151 (MQ=255)
gAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGa > 1:6051361/1‑151 (MQ=255)
gAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGa < 1:7664755/151‑1 (MQ=255)
gAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGa < 2:4152136/151‑1 (MQ=255)
aaTTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGAt < 1:910857/151‑1 (MQ=255)
ttGCGCTTGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATcc < 1:10121365/151‑1 (MQ=255)
cgcTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCt > 1:6483417/1‑151 (MQ=255)
gcTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTc > 1:10503809/1‑151 (MQ=255)
cTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTcc < 1:1522668/151‑1 (MQ=255)
aaGGTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCGGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCcagca < 1:6955079/151‑1 (MQ=255)
aGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCcagcag > 2:10414475/1‑151 (MQ=255)
gTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGAACCGCTCCAGCAGt < 2:526663/151‑1 (MQ=255)
gTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTtcg < 2:8811006/151‑1 (MQ=255)
gTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTtcg < 2:825338/151‑1 (MQ=255)
aCAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTtcgtc < 2:2097659/151‑1 (MQ=255)
aCAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTtcgtc < 1:9197202/151‑1 (MQ=255)
aGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGc > 2:7103693/1‑151 (MQ=255)
gAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAc < 2:1180326/151‑1 (MQ=255)
gAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGAGAGCACGGACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGAGCGCTCCGCGATCCGCTCCAGCAGGTCGTCGCCAc > 2:7557212/1‑151 (MQ=255)
aGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcg < 1:8457414/151‑1 (MQ=255)
aGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcg < 2:6697882/151‑1 (MQ=255)
aGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcg > 1:9352569/1‑151 (MQ=255)
gCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCGTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcgcc > 1:7517069/1‑151 (MQ=255)
cccGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcgccc > 1:7750325/1‑151 (MQ=255)
cccGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcgccc < 1:1694943/151‑1 (MQ=255)
ccGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCGGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcgcccg > 2:736605/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCAcgcccgcc > 2:2777455/1‑151 (MQ=255)
gccgccGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGACCAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGt > 2:7869136/1‑151 (MQ=255)
gccgccGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGt > 2:2844856/1‑151 (MQ=255)
gccgccGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGt > 1:3926951/1‑151 (MQ=255)
cgccgGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTgg < 1:9860915/151‑1 (MQ=255)
cgccgGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTgg < 1:2794441/151‑1 (MQ=255)
cgccgGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTgg > 2:3281059/1‑151 (MQ=255)
cgccgGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTgg > 1:5862421/1‑151 (MQ=255)
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GCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTACAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCC > SRR18135086.10638575/1‑151 (MQ=60)
GCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCGTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCC > SRR18135086.7549438/1‑151 (MQ=60)
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CGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCG < SRR18135086.10544652/151‑1 (MQ=60)
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GGCTGGGAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTGGCGGTACTCCGGGGTGACCGCCAGAC > SRR18135086.9551722/1‑151 (MQ=60)
GCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTGGCGGTACTCCGGGTTGACCGCCAGACA < SRR18135086.9522602/151‑1 (MQ=60)
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GGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTGGCGGTACTCCGGGTTGACCGCCAGACAGGC < SRR18135086.2828755/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGGTCGTCGCCACGCCCGCCGTGGCGGTCCTCCGGGTTGACCGCCTGACAGGCCA > SRR18135086.6647784/1‑151 (MQ=60)
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GCCTGATCAGCAACTGAGCGAAGCCGGCGCGCCCCTGCGCCCAGGGACGCGCCGGCGGATCACAGGCTCTTCTCGAATACCTGCGAATTGCGCTGGAAGTTGTACAGCGAGGCCCGCGCCGCCGGTAGCCGCTCTACGCTGCTGGGCTGGAAGCCGCGCTCGCGGAACCAGTGCGCGGTCCGCGTGGTGAGCACGAACAGGGTCTTCAGGCCGAGTCCGCGCGCGCGCTCCTCGATCCGCTCCAGCAGTTCGTCGCCACGCCCGCCGTGGCGGTACTCCGGGTTGACCGCCAGACAGGCCA > NC_008463/6130310‑6130610
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
