Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
259 |
502.6 |
21734322 |
99.3% |
21582181 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,390,474 |
Δ1 bp |
pseudogene (440/1997 nt) |
PA14_RS15455 → |
alkaline phosphatase D family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,390,472 | 0 | G | . | 100.0%
| 2424.3
/ NA
| 487 | pseudogene (438/1997 nt) | PA14_RS15455 | alkaline phosphatase D family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (227/260); total (227/260) |
Only 100 of 505 total aligned reads displayed.
CCTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCGGGCGGCCGATGGGCCTGCTGCAGGTAGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATGGGC > NC_008463/3390322‑3390619
|
cTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCgg > 1:9049404/1‑151 (MQ=255)
tGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGACCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGTCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCggc < 2:7150851/151‑2 (MQ=255)
ccTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGcc < 2:2859239/151‑1 (MQ=255)
cTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCg > 2:3895276/1‑151 (MQ=255)
cTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCg > 2:3313754/1‑151 (MQ=255)
gccgccGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCGGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATg > 2:7710221/1‑151 (MQ=255)
ccgACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggcct < 2:10225233/151‑4 (MQ=255)
cgACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCCCGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggcctg > 1:10723271/1‑147 (MQ=255)
gACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCctgc > 2:7120993/1‑151 (MQ=255)
cggcggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCctgctg < 2:7378977/151‑1 (MQ=255)
ggcggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGACGCCAGCGCGCCAGCCTGGAGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCAGCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCtgctgc > 2:6131161/1‑151 (MQ=255)
gcggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCa > 1:4941040/1‑151 (MQ=255)
gcggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCa > 2:7667938/1‑151 (MQ=255)
cggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAg > 1:9905499/1‑151 (MQ=255)
gggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGt < 2:6296145/151‑1 (MQ=255)
gtaGCCAGCGGGAATCGCCGATTTGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCTACCATTTGATCCACTGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCTGGtc < 2:2314225/149‑2 (MQ=255)
ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCCTCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 2:2510153/151‑2 (MQ=255)
ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:5220539/151‑2 (MQ=255)
ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 2:9777351/151‑2 (MQ=255)
gCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAc > 1:10408925/1‑151 (MQ=255)
cccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAcc < 1:5921211/151‑1 (MQ=255)
ccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCCTCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCg < 2:957584/151‑1 (MQ=255)
ccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCg < 1:8844473/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCgg > 1:10280668/1‑151 (MQ=255)
gcgGGAATCGCCGTATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgc > 1:2220192/1‑151 (MQ=255)
gcgGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCTGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgc < 2:636441/151‑1 (MQ=255)
gcgGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgc < 2:9184667/151‑1 (MQ=255)
gggAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgctg > 1:1551574/1‑151 (MQ=255)
gggAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgctg < 1:8987386/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTgga < 1:3047196/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGATgga > 1:259255/1‑151 (MQ=255)
cGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCTAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaa > 2:8467244/1‑151 (MQ=255)
aTGGGCGCCGCCTCAGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAAc < 1:6960444/151‑1 (MQ=255)
aTGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAAc > 1:6822745/1‑151 (MQ=255)
tGGGCGCCGCATCTGCTCGCCCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAAcc < 2:6865420/151‑1 (MQ=255)
gggCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACct < 1:6165434/151‑1 (MQ=255)
gccgcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACctgctg < 1:4117213/151‑1 (MQ=255)
gccgcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACctgctg > 1:8291297/1‑151 (MQ=255)
ccgcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGGCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCtgctgc > 1:3286271/1‑151 (MQ=255)
cgcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCa < 1:7100989/151‑1 (MQ=255)
cATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAgg > 2:4615247/1‑151 (MQ=255)
cATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAgg < 2:10817708/151‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGc < 1:7611858/151‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCAAGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGc < 2:2970751/151‑1 (MQ=255)
tctACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAACACCTGCTGCAGGCCGAAAg > 2:6510087/1‑151 (MQ=255)
tctACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAg < 1:436923/151‑1 (MQ=255)
tACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgcc > 1:2680281/1‑151 (MQ=255)
ccGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGccc < 2:4250649/151‑1 (MQ=255)
gTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGc < 2:471924/151‑1 (MQ=255)
tCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCg < 1:9276093/151‑1 (MQ=255)
tCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCg > 2:48826/1‑151 (MQ=255)
cAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGc < 1:2410219/151‑1 (MQ=255)
cAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGGTGc > 2:5004618/1‑151 (MQ=255)
aGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCt < 1:7255088/151‑1 (MQ=255)
gcgcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtg < 2:9651037/151‑1 (MQ=255)
cgcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGACAGCCGCCCGGCGGTGCgga > 2:5471424/1‑151 (MQ=255)
gcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgat < 1:4652761/151‑1 (MQ=255)
gcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgat > 2:6718025/1‑151 (MQ=255)
gcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgat < 2:5400214/151‑1 (MQ=255)
cgcCAGCCTGGTGCTCACGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatg < 1:946727/151‑1 (MQ=255)
cgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCCCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatg < 1:1258993/151‑1 (MQ=255)
gcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatga > 1:5541171/1‑151 (MQ=255)
ccAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgat > 2:8201078/1‑151 (MQ=255)
ccAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgat < 1:7024934/151‑1 (MQ=255)
cAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgatg > 2:4509/1‑151 (MQ=255)
aGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgatga < 2:7015993/151‑1 (MQ=255)
ggTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAgcggc < 2:5910861/151‑1 (MQ=255)
gTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAgcggcg < 1:1907238/151‑1 (MQ=255)
gCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAc > 1:536/1‑151 (MQ=255)
cTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAcc < 2:5637802/151‑1 (MQ=255)
cAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAg > 1:7841741/1‑151 (MQ=255)
aaGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAgg > 2:799784/1‑151 (MQ=255)
cACGTCTCGACCAGTGGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTa < 1:10073178/151‑1 (MQ=255)
gTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGc > 1:3934419/1‑151 (MQ=255)
tctcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTTCGcc < 1:565418/151‑1 (MQ=255)
ctcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcg > 2:9152805/1‑151 (MQ=255)
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tcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcga > 1:8592928/1‑151 (MQ=255)
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AATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTG > SRR18135085.2616960/1‑151 (MQ=60)
AATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTG < SRR18135085.7056780/151‑1 (MQ=60)
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TCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGATGGA > SRR18135085.260425/1‑151 (MQ=60)
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ATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAAC < SRR18135085.1382069/151‑1 (MQ=60)
ATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAAC > SRR18135085.6848258/1‑151 (MQ=60)
ATGGGCGCCGCAACTGCTCGACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAAC < SRR18135085.8528481/151‑1 (MQ=60)
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GGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCT < SRR18135085.2470903/151‑1 (MQ=60)
GGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCT < SRR18135085.2963644/151‑1 (MQ=60)
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GGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCACAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCT < SRR18135085.2471742/151‑1 (MQ=60)
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CCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCCAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGAT < SRR18135085.5457464/151‑1 (MQ=60)
CCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGAT < SRR18135085.7051018/151‑1 (MQ=60)
CAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATG > SRR18135085.8772893/1‑151 (MQ=60)
CCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGC < SRR18135085.6949547/151‑1 (MQ=60)
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GTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCG < SRR18135085.1914607/151‑1 (MQ=60)
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GCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAC > SRR18135085.538/1‑151 (MQ=60)
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AAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGG > SRR18135085.7930894/1‑151 (MQ=60)
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ACGACTCGACCAGGTGCTCCACGGCTCCACCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGCT‑GGCCCGCTGCAGCTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGCAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTAC < SRR18135085.4991688/151‑1 (MQ=60)
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CTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCG > SRR18135085.8470684/1‑151 (MQ=60)
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TGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCGGGCGGCCGATGGGCCTGCTGCAGGTAGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATGGGCTGATCC > NC_008463/3390324‑3390625
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
