Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
275 |
500.0 |
21685688 |
99.2% |
21512202 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,051,401 |
T→C |
N373D (AAC→GAC) |
PA14_RS13990 ← |
SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,051,401 | 0 | T | C | 99.8%
| 1831.0
/ NA
| 468 | N373D (AAC→GAC) | PA14_RS13990 | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (241/226); minor base A (1/0); total (242/226) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 497 total aligned reads displayed.
TAGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGC > NC_008463/3051253‑3051548
|
tAGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga < 1:3581641/151‑1 (MQ=255)
tAGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga > 2:10670544/1‑151 (MQ=255)
cGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggt > 2:5345923/1‑151 (MQ=255)
cGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggt > 2:3838333/1‑151 (MQ=255)
gtgtGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCTTGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgtggtt < 2:8465762/151‑1 (MQ=255)
gtgtGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggtt < 1:5549681/151‑1 (MQ=255)
gtgCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggttga > 1:1089573/1‑151 (MQ=255)
cGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACt > 2:2315227/1‑151 (MQ=255)
aGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACtcg < 2:7994899/151‑3 (MQ=255)
aGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACtcg < 1:1527932/151‑3 (MQ=255)
gCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGc < 1:6288650/151‑1 (MQ=255)
aTCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGc < 2:3470096/151‑1 (MQ=255)
aTCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGc > 1:9355224/1‑151 (MQ=255)
gggCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTg < 2:735809/151‑1 (MQ=255)
gggCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTg > 2:971799/1‑151 (MQ=255)
ggCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTgg < 1:2455982/151‑1 (MQ=255)
gcgcTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGgc < 1:4617517/151‑1 (MQ=255)
gcgcTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGgc < 2:758739/151‑1 (MQ=255)
cgcTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGgcg > 2:2026920/1‑151 (MQ=255)
tcctcAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCgg < 1:1994834/151‑1 (MQ=255)
tcAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTg < 2:1786303/151‑1 (MQ=255)
tcAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGAACGCGAGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGAGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTg > 2:3045224/1‑151 (MQ=255)
gATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCg > 1:10455250/1‑151 (MQ=255)
ccATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGcc > 1:29210/1‑151 (MQ=255)
cATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTGCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCa < 2:9463991/151‑1 (MQ=255)
gAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCt < 1:6447205/151‑1 (MQ=255)
aGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCtc > 2:4941919/1‑150 (MQ=255)
gACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTCGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGaa < 1:6966709/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGCCCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAag < 2:4407671/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAag > 1:8214413/1‑151 (MQ=255)
aCGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAag > 1:3656490/1‑151 (MQ=255)
cgcCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGc < 1:4275098/151‑1 (MQ=255)
gcCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCt > 2:6713278/1‑151 (MQ=255)
ccGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCtt < 1:3270174/151‑1 (MQ=255)
cGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtc > 2:6273536/1‑151 (MQ=255)
gACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtctc < 1:4871764/151‑1 (MQ=255)
aCGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCg > 1:5104867/1‑151 (MQ=255)
cGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGc > 2:9188286/1‑151 (MQ=255)
gggCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCt < 2:5167885/151‑1 (MQ=255)
gggCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGCGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCt < 2:8602740/151‑1 (MQ=255)
gcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcg < 1:3386684/151‑1 (MQ=255)
gcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcg > 1:9655892/1‑151 (MQ=255)
gcCGGTCAGGTAGTAGTCGCCGCCCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGGGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCGggcg < 2:3701279/151‑1 (MQ=21)
ccGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcgg < 2:5567268/151‑1 (MQ=255)
gTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCGTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGcc < 2:6789413/151‑1 (MQ=255)
ttCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCa > 2:8801710/1‑151 (MQ=255)
cAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCATCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAgg < 1:8851033/151‑1 (MQ=255)
cAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAgg < 1:3113068/151‑1 (MQ=255)
aGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGc < 1:7367795/151‑1 (MQ=255)
aGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGc > 1:7050398/1‑151 (MQ=255)
tagtagTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGa > 1:7150673/1‑151 (MQ=255)
tcgtCGCCGCCCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGGGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAtct < 2:7131852/149‑1 (MQ=37)
tagtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAtct < 1:7474334/151‑1 (MQ=255)
gtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCg > 1:1305167/1‑151 (MQ=255)
ccGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGc > 2:2700529/1‑151 (MQ=255)
ccGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGc > 2:5749273/1‑151 (MQ=255)
ccGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAg > 1:2827498/1‑151 (MQ=255)
ccGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAg < 2:8936902/151‑1 (MQ=255)
cgcgTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGc > 1:828453/1‑151 (MQ=255)
gTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCAcc > 2:10551573/1‑151 (MQ=255)
gACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTg > 1:5364129/1‑151 (MQ=255)
aCCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTgg > 1:10057215/1‑151 (MQ=255)
ccatCCAGCGTACCGGGTCGGGCAGGGTGTGGGAGCGGGCGTGGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCGTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGc < 2:10208940/148‑1 (MQ=255)
ttCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGAGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGCAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCt < 2:10776428/151‑1 (MQ=255)
cAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCgg < 2:2292172/151‑1 (MQ=255)
aGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGc < 1:2632812/151‑1 (MQ=255)
cGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCa > 2:1332007/1‑151 (MQ=255)
ccGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGc > 1:7642470/1‑151 (MQ=255)
ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGAt < 1:9760461/151‑1 (MQ=255)
ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGAt > 2:3352235/1‑151 (MQ=255)
gTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATc > 2:4194396/1‑151 (MQ=255)
gTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGGTGCGCCAGAGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATc < 1:6689101/151‑1 (MQ=255)
gTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAg > 2:116637/1‑151 (MQ=255)
gCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgc < 1:1206149/151‑1 (MQ=255)
cAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgcg > 1:1378041/1‑151 (MQ=255)
cAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgcg > 2:5914637/1‑151 (MQ=255)
gggTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGcgcg < 2:2480542/151‑1 (MQ=255)
gggTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGcgcg > 1:9004205/1‑151 (MQ=255)
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TACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACG > SRR18135068.10012300/1‑151 (MQ=60)
GACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACG < SRR18135068.9185497/151‑1 (MQ=60)
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GTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATC > SRR18135068.2944282/1‑151 (MQ=60)
GTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGGTGCGCCAGAGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATC < SRR18135068.6721768/151‑1 (MQ=60)
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GTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTG > SRR18135068.3942303/1‑151 (MQ=60)
GTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTG > SRR18135068.5190931/1‑151 (MQ=60)
GTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTG < SRR18135068.7862386/151‑1 (MQ=60)
TGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCG > SRR18135068.127981/1‑151 (MQ=60)
TGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCG > SRR18135068.5837708/1‑151 (MQ=60)
GGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGC > SRR18135068.5289872/1‑151 (MQ=60)
GGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCC > SRR18135068.1398001/1‑151 (MQ=60)
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GGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGC > SRR18135068.360142/1‑151 (MQ=60)
GGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGC > SRR18135068.367373/1‑151 (MQ=60)
GGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGC > SRR18135068.8954438/1‑151 (MQ=60)
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GTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCG > SRR18135068.4528386/1‑151 (MQ=60)
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CGTAGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGC > NC_008463/3051251‑3051551
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
