Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
259 |
538.5 |
23252398 |
99.3% |
23089631 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,885,933 |
G→C |
G71G (GGG→GGC) |
gcvH → |
glycine cleavage system protein GcvH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,885,933 | 0 | G | C | 99.8%
| 2140.5
/ NA
| 536 | G71G (GGG→GGC) | gcvH | glycine cleavage system protein GcvH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (246/289); total (247/289) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.61e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 536 total aligned reads displayed.
CCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTG > NC_008463/2885785‑2886080
|
cGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAg < 1:7977042/151‑1 (MQ=255)
cGGCATCACCGCCTTCGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtg < 2:6161630/151‑1 (MQ=255)
ggCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtgg < 1:5388685/151‑1 (MQ=255)
gCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtggt < 2:8685467/151‑1 (MQ=255)
cATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTa < 2:4182657/151‑1 (MQ=255)
ccGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 1:10128929/151‑1 (MQ=255)
ccGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 2:10002892/151‑1 (MQ=255)
gCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCa < 2:8887202/151‑1 (MQ=255)
gCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCa < 2:7442363/151‑1 (MQ=255)
cTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAac < 2:4957063/151‑1 (MQ=255)
cGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgac < 1:10005746/151‑1 (MQ=255)
gCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgacg < 1:3456782/151‑1 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc < 1:6469859/151‑1 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc < 1:5184990/151‑1 (MQ=255)
ccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgcg < 1:10622462/151‑1 (MQ=255)
aGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCt > 1:10715921/1‑151 (MQ=255)
gACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGc > 2:5635210/1‑151 (MQ=255)
aCGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGcc > 2:6358960/1‑151 (MQ=255)
gCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCgg > 1:2695133/1‑151 (MQ=255)
cccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGa > 2:6671758/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGAc > 2:2203359/1‑151 (MQ=255)
cTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACg < 1:607686/151‑1 (MQ=255)
ggTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGccc > 2:8293851/1‑151 (MQ=255)
ggTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGccc > 2:6784068/1‑151 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAATGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGc > 2:707520/1‑151 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGc < 1:11154146/151‑1 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGc > 2:6727940/1‑151 (MQ=255)
tGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCt > 1:3896641/1‑151 (MQ=255)
gTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAAcc > 2:3169461/1‑151 (MQ=255)
gTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGGGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGCCGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAAcc > 2:2981593/1‑151 (MQ=255)
gCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCa < 1:1955322/151‑1 (MQ=255)
gCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCa > 2:2704551/1‑151 (MQ=255)
ccGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCAc < 2:11143275/151‑1 (MQ=255)
cGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACt < 1:5025464/151‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCg < 2:576659/151‑1 (MQ=255)
aaCTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCgg < 2:1645809/151‑1 (MQ=255)
aCTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCCGCAACATCCTTATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGc < 2:923696/151‑1 (MQ=255)
cTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCg < 2:11024896/151‑1 (MQ=255)
tCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGa > 1:625697/1‑151 (MQ=255)
cGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAg > 2:2446884/1‑151 (MQ=255)
ggCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAgg < 1:2940717/151‑1 (MQ=255)
gCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGc < 1:23209/151‑1 (MQ=255)
cGAACACGCCGCCGGCAGTGTAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc < 2:9692289/151‑1 (MQ=255)
cGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc < 2:9359053/151‑1 (MQ=255)
cGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc > 2:7934709/1‑151 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTg < 1:4043096/151‑1 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTg < 1:4350573/151‑1 (MQ=255)
acacGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTgg > 1:1179724/1‑151 (MQ=255)
cacGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGt > 2:4023129/1‑151 (MQ=255)
cgccgcCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGttc > 2:10703986/1‑151 (MQ=255)
ccgccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGttctt < 2:2157302/151‑1 (MQ=255)
ccgccgGCAGAGACGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGttctt < 2:1467850/151‑1 (MQ=255)
gccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttcc < 1:9290152/151‑1 (MQ=255)
ccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccg < 2:9157434/151‑1 (MQ=255)
ggCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgct < 2:4569155/151‑1 (MQ=255)
gCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgctt < 1:2765534/151‑1 (MQ=255)
aGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttcc > 1:3589488/1‑151 (MQ=255)
aGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttcc < 1:3288136/151‑1 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg > 1:4233591/1‑151 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg > 1:8096160/1‑151 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg > 2:10138629/1‑151 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg > 1:8344385/1‑151 (MQ=255)
tGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgt > 1:1824294/1‑151 (MQ=255)
tGAAGTGGCGCTGCGGGAGTCGGTCACGGCCGCCAGCTCCATCCAGATGCCCCTGGACGGCGAGCGGGGAGCGATCAACGTCGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgt < 2:10870392/151‑1 (MQ=255)
aaGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgtcc < 1:7428170/151‑1 (MQ=255)
aGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgtccg < 1:8654127/151‑1 (MQ=255)
gTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACg < 1:2158251/151‑1 (MQ=255)
cTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCg > 1:4933621/1‑151 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:10225250/151‑1 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:6971754/151‑1 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:10867840/151‑1 (MQ=255)
ggTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTgg > 2:6454781/1‑151 (MQ=255)
tCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGa < 1:5989977/151‑1 (MQ=255)
tCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGa > 2:4813401/1‑151 (MQ=255)
tCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGa > 1:7701694/1‑151 (MQ=255)
aGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGaaaa > 1:1318640/1‑151 (MQ=255)
ccgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgct < 2:3280875/151‑1 (MQ=255)
tccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgctgc > 2:3825679/2‑151 (MQ=255)
ccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgctgct < 2:5944719/151‑1 (MQ=255)
cAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTc < 2:1743973/151‑1 (MQ=255)
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GGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGC > SRR18135097.8249768/1‑151 (MQ=60)
GGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGC < SRR18135097.7001662/151‑1 (MQ=60)
AGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGC > SRR18135097.1418191/1‑151 (MQ=60)
CGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTG < SRR18135097.10231786/151‑1 (MQ=60)
GGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGATTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGG > SRR18135097.11529531/1‑151 (MQ=60)
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GTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGG < SRR18135097.3547917/151‑1 (MQ=60)
GTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGG > SRR18135097.3598712/1‑151 (MQ=60)
GTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGG > SRR18135097.1579678/1‑151 (MQ=60)
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CAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAA < SRR18135097.1901122/151‑1 (MQ=60)
AAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAA > SRR18135097.429232/1‑151 (MQ=60)
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GGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAG > SRR18135097.2976688/1‑151 (MQ=60)
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CAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTC > SRR18135097.1251961/1‑151 (MQ=60)
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GACCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTGCTG > NC_008463/2885783‑2886083
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
