Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22377240 |
99.2% |
22198222 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,807,266 |
G→C |
V137L (GTG→CTG) |
PA14_RS13175 → |
leucine‑rich repeat‑containing protein kinase family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,807,266 | 0 | G | C | 99.6%
| 2113.1
/ NA
| 545 | V137L (GTG→CTG) | PA14_RS13175 | leucine‑rich repeat‑containing protein kinase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (266/277); total (266/279) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 559 total aligned reads displayed.
GCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGGTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTCGCCGGCCGTTGCAGAAGCTGATG > NC_008463/2807119‑2807412
|
cGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAg < 2:4288867/150‑1 (MQ=255)
cGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGGTCTGTTCCGCCACCGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAg < 2:6666566/150‑1 (MQ=255)
tCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATg < 1:1050335/150‑1 (MQ=255)
ccTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGt < 1:8462896/150‑1 (MQ=255)
gAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGc > 2:10447548/1‑150 (MQ=255)
gCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCaa < 1:8832884/150‑1 (MQ=255)
ccTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCaa < 1:4291692/150‑1 (MQ=255)
cTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAAc < 2:1551589/150‑1 (MQ=255)
tCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCATGTCCTAcc > 2:6393376/1‑150 (MQ=255)
cAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCg > 1:9386644/1‑150 (MQ=255)
gCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCa > 1:5335873/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATc < 2:3638166/150‑1 (MQ=255)
aaCGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAg > 1:8344524/1‑150 (MQ=255)
aCGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGc < 2:3081898/150‑1 (MQ=255)
aCGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGc > 1:6475836/1‑150 (MQ=255)
ccTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGt < 1:1671174/150‑1 (MQ=255)
ccTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGt < 1:1234378/150‑1 (MQ=255)
ccTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGt < 2:4446950/150‑1 (MQ=255)
cTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTg < 2:3448293/150‑1 (MQ=255)
aCAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTgccgg > 1:6013995/1‑150 (MQ=255)
cAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTgccggc > 1:5006641/1‑150 (MQ=255)
cGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGccc > 2:7022897/1‑150 (MQ=255)
ggACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCTACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCt > 2:6854388/1‑150 (MQ=255)
ggACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCt > 2:7550805/1‑150 (MQ=255)
acgacCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgc > 1:3657573/1‑150 (MQ=255)
acgacCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgc < 1:5891410/150‑1 (MQ=255)
gacCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgccg > 2:7385433/1‑150 (MQ=255)
acCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgccgc > 1:8680766/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGccgccg > 2:5588306/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGccgccg < 1:10001556/150‑1 (MQ=255)
cTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGccgccg > 1:11167316/1‑150 (MQ=255)
tCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTTCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATGGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCgg < 2:8512403/150‑1 (MQ=255)
tCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCgg > 2:9051687/1‑150 (MQ=255)
ccggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGtt < 1:721771/150‑1 (MQ=255)
gcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACATCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTgcg > 1:2687845/1‑150 (MQ=255)
tGCTTCGTCTCACGGTGCTGTTCTGGTCGGCCAACGACTTCGCCGCATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGGTGTGCCTGGTCGGCTTCAAGTCCTACCGCAGCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgct < 2:9285295/150‑1 (MQ=255)
gCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctg > 2:1982389/1‑150 (MQ=255)
gCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctg > 1:3124185/1‑150 (MQ=255)
cATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctgg < 1:3439416/150‑1 (MQ=255)
ctCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCGGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctggc < 2:7566964/149‑1 (MQ=255)
tCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctggct < 1:6992701/150‑1 (MQ=255)
gTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGa > 1:1554916/1‑150 (MQ=255)
tctcAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGAt > 2:165383/1‑150 (MQ=255)
tcAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATcc > 2:25988/1‑150 (MQ=255)
tcAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATcc < 2:7303587/150‑1 (MQ=255)
tcAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATcc > 2:10942617/1‑150 (MQ=255)
cAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCt > 2:2459855/1‑150 (MQ=255)
aaGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTc > 2:10796179/1‑150 (MQ=255)
aaGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTc > 1:5229888/1‑150 (MQ=255)
aaGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTc > 1:3913352/1‑150 (MQ=255)
aGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCa > 2:9763970/1‑150 (MQ=255)
ggTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCAc > 1:3325077/1‑150 (MQ=255)
tgttctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGAct > 1:1091681/1‑149 (MQ=255)
tgttctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGAcc > 1:8574296/1‑149 (MQ=255)
tctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAAcc < 2:1300189/150‑1 (MQ=255)
ctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCg > 2:8790401/1‑150 (MQ=255)
ctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCg > 1:6617371/1‑150 (MQ=255)
tgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCgg > 2:5015379/1‑150 (MQ=255)
ccAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCa > 1:2857559/1‑150 (MQ=255)
ccAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCa < 1:1365908/150‑1 (MQ=255)
ccAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCGCACCGACAACCGGATTGCCa > 2:11186437/1‑150 (MQ=255)
cAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCAc < 1:562260/150‑1 (MQ=255)
aCGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGc < 1:1778521/150‑1 (MQ=255)
aCGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGc > 2:7058933/1‑150 (MQ=255)
gACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTg < 2:8126590/150‑1 (MQ=255)
gACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTg > 2:7819437/1‑150 (MQ=255)
gACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTg < 2:4820982/150‑1 (MQ=255)
aCTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGc > 2:2174321/1‑150 (MQ=255)
ttCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGccc > 1:10178917/1‑150 (MQ=255)
tCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCg > 2:5836974/1‑150 (MQ=255)
gCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAg < 2:721710/150‑1 (MQ=255)
cGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGa > 1:2402913/1‑150 (MQ=255)
cGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGa > 1:9118831/1‑150 (MQ=255)
cGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGa > 1:6253807/1‑150 (MQ=255)
gAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCTTCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACTACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGaa < 2:10157247/150‑1 (MQ=255)
aTTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGACCt > 1:4559213/1‑150 (MQ=255)
aTTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACt > 1:10778685/1‑150 (MQ=255)
aTTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACt < 1:188636/150‑1 (MQ=255)
cggcggcggTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTc > 2:8343010/1‑150 (MQ=255)
ggcggcggTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTCg < 1:2096762/150‑1 (MQ=255)
cggcggTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCTCATCGAGCGTGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTCgcc < 2:3323169/150‑1 (MQ=255)
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CTGGCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGGTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTCGCCGGCCGTTGCAGAAGCTGATGCTGG > NC_008463/2807116‑2807416
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
