Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22386308 |
99.2% |
22207217 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,651,339 |
T→C |
F68L (TTC→CTC) |
PA14_RS12480 → |
MFS transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,651,339 | 0 | T | C | 100.0%
| 1892.7
/ NA
| 480 | F68L (TTC→CTC) | PA14_RS12480 | MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (239/241); total (239/241) |
Only 100 of 480 total aligned reads displayed.
GTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCG > NC_008463/2651192‑2651485
|
tggCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCa < 1:10136918/150‑1 (MQ=255)
cGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAgg > 1:6419150/1‑150 (MQ=255)
tCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggct < 2:198282/150‑1 (MQ=255)
aTGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctgg < 1:940588/150‑1 (MQ=255)
tGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctggc < 1:1851327/150‑1 (MQ=255)
gCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctggct > 2:7923604/1‑150 (MQ=255)
cGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGAt < 2:7997315/150‑1 (MQ=255)
cGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGAt < 1:5147899/150‑1 (MQ=255)
gggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATc < 1:2985648/150‑1 (MQ=255)
ggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCTCCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGTGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcg > 2:1753697/1‑149 (MQ=255)
gCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcga > 2:7631354/1‑148 (MQ=255)
gCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcga < 2:3758351/150‑3 (MQ=255)
gCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcga < 1:772342/150‑3 (MQ=255)
cccACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGAc < 1:2141290/150‑1 (MQ=255)
ccACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGTTCGAcc > 2:8187074/1‑150 (MQ=255)
cACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCg > 2:5349/1‑150 (MQ=255)
aCCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGt > 2:3494207/1‑150 (MQ=255)
cGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTg < 1:7406163/150‑1 (MQ=255)
ggCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTgg > 1:2364181/1‑150 (MQ=255)
ggCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTgg < 1:7484057/150‑1 (MQ=255)
ggCAGCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTgg < 2:5912358/150‑1 (MQ=255)
gCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTggg < 2:4243140/150‑1 (MQ=255)
gCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTggg > 1:5962298/1‑150 (MQ=255)
cATCCTGCTCAACACCTTCAGCCTGTACCTCGCACCCTTGCGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGCTGTCGTTGCAGCTGACGCTGTTCGGCCGGGCGCTCGCCATCACCACCCCGCTCAAGCGCCGGCTGATCGACCGTTgggg < 2:156084/150‑1 (MQ=255)
aTCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgc > 1:832053/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcg > 2:4524363/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcg > 1:6251515/1‑150 (MQ=255)
ctgAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCgcgg > 1:5510692/1‑150 (MQ=255)
gAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCgcggcg > 1:4152307/1‑150 (MQ=255)
acacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGa > 1:10971337/1‑150 (MQ=255)
cAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCt > 2:2201049/1‑150 (MQ=255)
gTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg > 2:3263614/1‑150 (MQ=255)
gTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTGGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg > 2:6814398/1‑150 (MQ=255)
gTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTCGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg > 1:10872964/1‑150 (MQ=255)
tCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCgg < 2:7695527/150‑1 (MQ=255)
cATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGAc < 1:9119442/150‑1 (MQ=255)
cATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGAc < 1:5773474/150‑1 (MQ=255)
tCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcg < 1:5244718/150‑1 (MQ=255)
tCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcg > 2:8599113/1‑150 (MQ=255)
tCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcg < 1:3421346/150‑1 (MQ=255)
tCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGGTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcg > 2:4691663/1‑150 (MQ=255)
gCACCGATGTGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGCCGCTGTTCGGTCTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcgcg > 2:3651434/1‑150 (MQ=255)
gCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCAGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcgcg > 2:811159/1‑150 (MQ=255)
cACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCgg > 2:7454711/1‑150 (MQ=255)
cGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGccc > 1:9946373/1‑150 (MQ=255)
aTGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGTGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACACTGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTg < 2:10198039/150‑1 (MQ=255)
tGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGt > 1:1557795/1‑150 (MQ=255)
tGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGt > 1:387704/1‑150 (MQ=255)
gcgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACACTGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgc > 2:6005354/1‑150 (MQ=255)
gcgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgc < 1:9657093/150‑1 (MQ=255)
cgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgct < 1:1151698/150‑1 (MQ=255)
gcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctg < 2:3958372/150‑1 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgc < 2:551705/150‑1 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgc < 1:8498714/150‑1 (MQ=255)
aGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgc > 1:2662539/1‑150 (MQ=255)
aGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgc < 2:2964172/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctgc < 1:6745621/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTc < 2:5761916/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTc > 1:2199625/1‑150 (MQ=255)
ccTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCg > 1:1384778/1‑150 (MQ=255)
tGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGc > 2:7063327/1‑150 (MQ=255)
gcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGgcggcg > 1:8746573/1‑150 (MQ=255)
aGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGa < 2:4313269/150‑1 (MQ=255)
gtgtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAAt > 1:3654577/1‑150 (MQ=255)
tgtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATg > 1:3201111/1‑150 (MQ=255)
cGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCg < 2:1055268/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGt < 1:7150242/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTc < 2:280416/150‑1 (MQ=255)
ctGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTc < 2:10994809/149‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCt < 2:6140540/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTg < 2:9963434/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTg > 1:8066643/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTgg > 2:1460023/1‑150 (MQ=255)
ggTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACCATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGAGGTGAATGCCGTCAGGCa > 2:3147399/1‑150 (MQ=255)
ggTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCa > 1:1285677/1‑150 (MQ=255)
ggTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCa > 2:4943844/1‑150 (MQ=255)
gTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCaa > 1:8926654/1‑150 (MQ=255)
gACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAAct > 2:66824/1‑150 (MQ=255)
gACGCTGTTCGGACTGGCAGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAAct > 1:10176086/1‑150 (MQ=255)
aCGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAActc > 2:958495/1‑150 (MQ=255)
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gTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgc > 2:9097017/1‑150 (MQ=255)
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CTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGC > SRR18135095.5102799/1‑151 (MQ=60)
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TGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCA < SRR18135095.5830222/151‑1 (MQ=60)
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CGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTG < SRR18135095.9347906/151‑1 (MQ=60)
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CTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG < SRR18135095.6369185/151‑1 (MQ=60)
CTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG < SRR18135095.3871894/151‑1 (MQ=60)
CTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG < SRR18135095.2131891/151‑1 (MQ=60)
CTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG > SRR18135095.8659848/1‑151 (MQ=60)
|
GTGGTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG > NC_008463/2651189‑2651489
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
