Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22386308 |
99.2% |
22207217 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,051,443 |
T→C |
K359E (AAG→GAG) |
PA14_RS13990 ← |
SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,051,443 | 0 | T | C | 100.0%
| 1890.7
/ NA
| 484 | K359E (AAG→GAG) | PA14_RS13990 | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (236/248); total (236/248) |
Only 100 of 484 total aligned reads displayed.
GACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCGTCGAGGACCTGGCCGGCCTTCTCCAGCAGGG > NC_008463/3051296‑3051589
|
gACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGa > 2:10221160/1‑150 (MQ=255)
cgcgCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAag < 1:5788473/150‑1 (MQ=255)
cgcgCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAag < 1:718268/150‑1 (MQ=255)
gcCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGc < 2:4687987/150‑1 (MQ=255)
ccGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCt > 1:10028827/1‑150 (MQ=255)
ccGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCt > 2:7075906/1‑150 (MQ=255)
cGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCtt < 1:10510612/150‑1 (MQ=255)
gtcGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtct > 1:9936551/3‑150 (MQ=255)
gACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGCACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCCGCTCGAAGAGCTtct > 2:10783361/1‑150 (MQ=25)
aCGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtctc > 2:4337065/1‑150 (MQ=255)
gggCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCATCCAGCGAACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGATGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGc > 2:1400030/1‑150 (MQ=25)
gcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggc < 2:2311530/150‑1 (MQ=255)
gcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggc > 1:7801476/1‑150 (MQ=255)
gcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggc < 1:8369395/150‑1 (MQ=255)
gcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGGACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggc < 2:1803059/150‑1 (MQ=255)
cGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcgg > 1:1068546/1‑150 (MQ=255)
gTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcggc > 1:9194994/1‑150 (MQ=255)
gTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcggc > 2:5613064/1‑150 (MQ=255)
gTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcggc > 2:4261974/1‑150 (MQ=255)
ttCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGcc > 2:285052/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAg < 1:865051/150‑1 (MQ=255)
aGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAgg > 1:3987560/1‑150 (MQ=255)
ggTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGc > 2:1675720/1‑150 (MQ=255)
ggTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGc > 2:11025464/1‑150 (MQ=255)
agtagtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGa < 1:9429857/150‑1 (MQ=255)
tagtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAtc > 1:5501131/1‑150 (MQ=255)
gtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAtctc > 1:8009872/1‑150 (MQ=255)
cGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCgg < 2:2541902/150‑1 (MQ=255)
cGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCgg < 1:2821991/150‑1 (MQ=255)
aCCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTc > 2:940574/1‑150 (MQ=255)
aCCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTc > 2:4036073/1‑150 (MQ=255)
ccGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCa > 1:3067548/1‑150 (MQ=255)
cgcgTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAg < 1:3338911/150‑1 (MQ=255)
gcgTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGc < 1:6872378/150‑1 (MQ=255)
cgTGGACCTTCCAGCGGACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCa < 2:19302/150‑1 (MQ=255)
ggACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCt > 2:6818669/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTg < 1:9509727/150‑1 (MQ=255)
gtCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGcc < 1:515142/149‑1 (MQ=255)
tCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCt > 2:1568432/1‑150 (MQ=255)
aGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCgg > 1:4503514/1‑150 (MQ=255)
gTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCa > 1:1927235/1‑150 (MQ=255)
gTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCa < 2:6063513/150‑1 (MQ=255)
gTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCa > 2:6697467/1‑150 (MQ=255)
cGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGc < 2:4821006/150‑1 (MQ=255)
gggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCCGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCg > 1:2087684/1‑150 (MQ=255)
gggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCg < 1:1041946/150‑1 (MQ=255)
ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGa > 2:1146096/1‑150 (MQ=255)
ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGa > 1:9092174/1‑150 (MQ=255)
gTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTTGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTTGCCTCGGCCACGGCGAt < 2:2628199/150‑1 (MQ=37)
gTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGAt < 1:8136149/150‑1 (MQ=255)
cGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCg < 1:1742016/150‑1 (MQ=255)
gCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAgg < 1:10931418/150‑1 (MQ=255)
gCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCAACGGCGATCGAgg > 1:7507826/1‑150 (MQ=255)
aGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgcg > 1:2536359/1‑150 (MQ=255)
gggTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGTACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgcgc > 2:792437/1‑150 (MQ=255)
tgGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTgcc < 2:7313837/150‑1 (MQ=255)
gTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTGGCCCTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTgccgcc < 1:4607966/150‑1 (MQ=38)
gCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGATCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGa < 1:12013/150‑1 (MQ=255)
cGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGAc < 2:8864558/150‑1 (MQ=255)
gggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACt < 2:7176468/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTc < 1:8896117/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTc < 1:6466153/150‑1 (MQ=255)
gCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCg > 2:7674897/1‑150 (MQ=255)
cGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCgg > 2:1109182/1‑150 (MQ=255)
gTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGc < 2:9615848/150‑1 (MQ=255)
ttGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCg > 2:2169071/1‑150 (MQ=255)
tGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGt > 2:852703/1‑150 (MQ=255)
gcgcCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTc > 1:728511/1‑150 (MQ=255)
cgcCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGACGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTcc > 2:7832814/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc > 2:8374689/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc < 1:2954930/150‑1 (MQ=255)
ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc > 2:644438/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc < 1:5876033/150‑1 (MQ=255)
ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc < 2:3713849/150‑1 (MQ=255)
ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc < 1:7619815/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCg < 2:3068714/121‑1 (MQ=255)
aGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCg > 1:4211146/1‑150 (MQ=255)
gTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCgg > 1:4099983/1‑150 (MQ=255)
tGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGc > 1:8852900/1‑150 (MQ=255)
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CGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCG > SRR18135095.5408735/1‑151 (MQ=60)
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TTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTT > SRR18135095.5937502/1‑151 (MQ=60)
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GAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCG < SRR18135095.1171366/151‑1 (MQ=60)
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CTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCGTCG < SRR18135095.8896256/151‑1 (MQ=60)
CGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCGTCGAG > SRR18135095.3205180/1‑151 (MQ=60)
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|
AGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCGTCGAGGACCTGGCCGGCCTTCTCCAGCAGGGCGTT > NC_008463/3051293‑3051593
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
