Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
253 |
508.7 |
22197442 |
99.2% |
22019862 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,885,933 |
G→C |
G71G (GGG→GGC) |
gcvH → |
glycine cleavage system protein GcvH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,885,933 | 0 | G | C | 100.0%
| 1834.7
/ NA
| 469 | G71G (GGG→GGC) | gcvH | glycine cleavage system protein GcvH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (203/266); total (203/266) |
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
CGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCT > NC_008463/2885786‑2886079
|
cGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGa > 1:6471093/1‑150 (MQ=255)
gTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGGGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAg < 2:7484095/150‑1 (MQ=255)
ggCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtg > 1:10561174/1‑150 (MQ=255)
ggCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtg > 2:5058750/1‑150 (MQ=255)
aTCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACCTCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTa > 2:8359417/1‑150 (MQ=255)
tCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAg > 1:3557007/1‑150 (MQ=255)
aCCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCg > 1:9872615/1‑150 (MQ=255)
cGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 2:5967958/150‑1 (MQ=255)
cGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 2:4213778/150‑1 (MQ=255)
gCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATc < 2:2872006/150‑1 (MQ=255)
ccTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCa < 2:4976125/150‑1 (MQ=255)
cTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCaa > 2:10631805/1‑150 (MQ=255)
gCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgac < 1:2792286/150‑1 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgacg < 2:9574399/150‑1 (MQ=255)
ccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc < 1:1143704/150‑1 (MQ=255)
cggACGCCCTCGGTGACGGGGTATTCGAGCAGTTGCCGCAACACGGCGAACACGCCGCCGGCACTGAAGAGGCGGTGCAGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACgcgc < 2:3857166/149‑1 (MQ=255)
ggACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCt < 2:3501990/150‑1 (MQ=255)
aCGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGc < 1:1600473/150‑1 (MQ=255)
gCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCg > 2:2168424/1‑150 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGa > 2:10863301/1‑150 (MQ=255)
cGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGc < 2:2430599/150‑1 (MQ=255)
ggTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGcc > 1:7877681/1‑150 (MQ=255)
gTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGccc > 1:3938902/1‑150 (MQ=255)
tGACGTGGTATTCGTGCAGGTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGcccc < 2:9452928/150‑1 (MQ=255)
aCGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCgg < 2:7704524/150‑1 (MQ=255)
cGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACCTCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGa > 2:11067241/1‑150 (MQ=255)
cGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGa < 2:10525991/150‑1 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAg < 1:3385312/150‑1 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAg > 1:8493566/1‑150 (MQ=255)
ggTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCt > 2:5777272/1‑150 (MQ=255)
gTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTg > 1:10888982/1‑150 (MQ=255)
aTTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGt < 1:4926052/150‑1 (MQ=255)
ttCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTc < 1:7196467/150‑1 (MQ=255)
ggCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAAcc < 2:8136002/149‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAgg < 1:5225623/150‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAgg < 1:1468655/150‑1 (MQ=255)
tGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGAcc < 2:2692463/150‑1 (MQ=255)
gCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGAccc > 1:5010166/1‑150 (MQ=255)
ccGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCa < 2:7865244/150‑1 (MQ=255)
cGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCAc > 1:1821341/1‑150 (MQ=255)
ggAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACt > 1:2873182/1‑150 (MQ=255)
ggAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACt > 1:5589574/1‑150 (MQ=255)
gAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTc < 1:8332783/150‑1 (MQ=255)
aaCTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCg > 2:10361988/1‑150 (MQ=255)
aCTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCgg < 2:3596563/150‑1 (MQ=255)
aCTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCgg < 1:8773304/150‑1 (MQ=255)
tCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCg > 1:7294072/1‑150 (MQ=255)
tCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCg < 2:3124331/150‑1 (MQ=255)
cGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGa < 2:5263754/150‑1 (MQ=255)
cGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGc < 1:4214046/150‑1 (MQ=255)
gAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc < 1:4647633/150‑1 (MQ=255)
gAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc > 1:9395505/1‑150 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCt < 1:9125227/150‑1 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGAGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCt < 1:1000949/150‑1 (MQ=255)
acacGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTg < 1:10062748/150‑1 (MQ=255)
acGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGt < 2:2347830/150‑1 (MQ=255)
gccgccGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGttc < 2:7224209/150‑1 (MQ=255)
cAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACCTCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgctt < 1:2193163/150‑1 (MQ=255)
aGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttc > 1:3748130/1‑150 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttcc > 1:2028423/1‑150 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGAGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCACCATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttcc < 1:8048445/150‑1 (MQ=255)
tGAAGTGGCGGAGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg < 1:6590660/150‑1 (MQ=255)
gacgTGGCGGGGCAGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACCTCCTGCAGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGACAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgt < 2:9803521/147‑1 (MQ=255)
aaGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgtc > 2:183100/1‑150 (MQ=255)
aaGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgtc > 2:3332476/1‑150 (MQ=255)
gCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGcc < 1:10127237/150‑1 (MQ=255)
gCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGcc > 1:4512547/1‑150 (MQ=255)
cGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCg > 1:6787339/1‑150 (MQ=255)
ggTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGa < 1:2263969/150‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACg > 2:6696189/1‑150 (MQ=255)
gCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGc < 2:8937646/150‑1 (MQ=255)
gCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGc < 1:1667585/150‑1 (MQ=255)
tGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCg > 2:9339445/1‑150 (MQ=255)
tGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCg < 2:9070952/150‑1 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCgg < 2:9385792/150‑1 (MQ=255)
tCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGcc < 1:7479851/150‑1 (MQ=255)
tCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGcc > 1:4820796/1‑150 (MQ=255)
gTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTgg > 1:6249644/1‑150 (MQ=255)
cacgccgccAGCCACAGCCTGATGCCGCGGGCCCGCGAGGTGGTAGCGAACAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGCGCCGCTCCACCAGGACCCACTCGGCGACGCCTGGATCTTCCGCTTCCGACCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGaa < 2:4470604/147‑1 (MQ=255)
ggCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGaaaa > 1:5446854/1‑150 (MQ=255)
gccgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAg > 1:2985121/1‑150 (MQ=255)
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GGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGG > SRR18135100.4786953/1‑151 (MQ=60)
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AGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAA > SRR18135100.8389005/1‑151 (MQ=60)
AGGCCGCCAGCAACATCCGGAAGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAA < SRR18135100.8793720/151‑1 (MQ=60)
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GACCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTGCT > NC_008463/2885783‑2886082
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
