Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
253 |
508.7 |
22197442 |
99.2% |
22019862 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,281,477 |
G→C |
intergenic (‑25/+44) |
katE ← / ← PA14_RS14985 |
catalase HPII/general stress protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,281,477 | 0 | G | C | 100.0%
| 1416.4
/ NA
| 366 | intergenic (‑25/+44) | katE/PA14_RS14985 | catalase HPII/general stress protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (181/185); total (181/185) |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
GGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGGGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTG > NC_008463/3281330‑3281623
|
cGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGAt < 2:1495335/150‑1 (MQ=255)
gTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATg < 2:491858/150‑1 (MQ=255)
cTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCt > 1:5887949/1‑150 (MQ=255)
cTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCt > 2:6059883/1‑150 (MQ=255)
cgcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTcc < 2:3636137/150‑1 (MQ=255)
gcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTccc > 1:9524466/1‑150 (MQ=255)
gcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTccc < 2:8778061/150‑1 (MQ=255)
cgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCt > 1:7517442/1‑150 (MQ=255)
cgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCt < 2:8992968/150‑1 (MQ=255)
cgATAGGCCTCCAGCTGGTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCt < 2:1099124/150‑1 (MQ=255)
gATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTg > 2:5533882/1‑150 (MQ=255)
gATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTg < 2:5196762/150‑1 (MQ=255)
aTAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGc > 2:4254807/1‑150 (MQ=255)
tAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCt > 2:8537129/1‑150 (MQ=255)
aGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTc < 2:7731171/150‑1 (MQ=255)
aGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTc < 2:9515889/150‑1 (MQ=255)
cAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCa < 1:9674034/150‑1 (MQ=255)
aGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAt > 2:10197091/1‑150 (MQ=255)
cTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttc < 1:6643066/150‑1 (MQ=255)
cTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTGTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttc < 2:7858268/150‑1 (MQ=255)
cTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCAGCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttc < 2:7535351/150‑1 (MQ=255)
tGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttca > 1:7230987/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcactt < 1:5490771/150‑1 (MQ=255)
aGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCAGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCAACGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcacttcac < 1:8004240/150‑1 (MQ=255)
gCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATtcacttcact < 1:2911905/150‑1 (MQ=255)
gCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATtcacttcact < 2:5659090/150‑1 (MQ=255)
gCTTGGCGTTGCTGTAGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATtcacttcact < 2:10833346/150‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgc > 1:880504/1‑150 (MQ=255)
ggCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgcgc > 2:7312133/1‑150 (MQ=255)
tGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTa < 1:6832497/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTAt < 1:3517820/150‑1 (MQ=255)
cGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCccgc < 1:4303532/150‑1 (MQ=255)
ggTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCccgcc < 2:1738179/150‑1 (MQ=255)
ggTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACGGCGCGGTTATCAGTTCccgcc < 2:1244509/150‑1 (MQ=255)
gTCGACCGTGTCGGAGCCGGCCGCCTGGCTGCGCAGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCccgccg > 1:4569295/1‑150 (MQ=255)
gACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTgg < 2:5752421/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGc < 2:9784853/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGc < 2:10685992/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGc < 2:1572470/150‑1 (MQ=255)
cGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCt > 1:409684/1‑150 (MQ=255)
gtgtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgc > 1:10189053/1‑150 (MQ=255)
gtgtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgc > 1:2395593/1‑150 (MQ=255)
tgtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgcg < 1:9007758/150‑1 (MQ=255)
tCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCt < 1:10072180/150‑1 (MQ=255)
gccggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCa < 1:1240223/150‑1 (MQ=255)
ccggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCAc < 2:7116526/150‑1 (MQ=255)
ccggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAGTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCAc > 1:1971423/1‑150 (MQ=255)
ccgccTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCttt > 2:4765611/1‑150 (MQ=255)
ccTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGcc < 2:2893948/141‑1 (MQ=255)
ccTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCtt > 1:8079296/1‑150 (MQ=255)
ccTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCtt > 1:5639767/1‑150 (MQ=255)
cTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTg < 2:10972851/150‑1 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc > 1:7070985/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc < 1:4502924/150‑1 (MQ=255)
ggCTGCGCTGCTCGTTGTTCGGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGcc < 2:10576509/150‑1 (MQ=255)
gctgcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCa > 1:8500073/1‑150 (MQ=255)
gctgcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCa < 1:5034133/150‑1 (MQ=255)
gcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGcc > 1:3059891/1‑150 (MQ=255)
cgctgcTCGTTGGTCTGCTCGCACATCGGTTTCCTCTCCTCATCCAGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACGGCGCGGTTATCAGGTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCt < 2:2495076/150‑1 (MQ=255)
tgctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCgg > 1:5114761/1‑150 (MQ=255)
tgctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCgg < 1:9875917/150‑1 (MQ=255)
gctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGa > 1:3348238/1‑150 (MQ=255)
gctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCGTGCCAGCCTCGGa < 2:6707666/150‑1 (MQ=255)
ttgttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGccc > 2:6407492/1‑150 (MQ=255)
gttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGc > 2:2691302/1‑150 (MQ=255)
ttCTGCTCGCTCAGCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAACTGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCt < 2:8155538/150‑1 (MQ=255)
cTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGc < 1:17671/150‑1 (MQ=255)
tGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCg > 1:8915047/1‑150 (MQ=255)
gctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCg > 1:2541976/1‑150 (MQ=255)
gctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCg > 2:2046304/1‑150 (MQ=255)
ctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGt > 1:166832/1‑150 (MQ=255)
cATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTc > 2:3065713/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCCGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCt < 2:9086615/150‑1 (MQ=255)
tCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCtg > 1:7951316/1‑149 (MQ=255)
ggTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGa < 2:2360627/150‑1 (MQ=255)
ggTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGa < 1:1701878/150‑1 (MQ=255)
gTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGc < 2:4821203/120‑1 (MQ=255)
gTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGc > 1:4821203/1‑120 (MQ=255)
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cctctcctcATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTg > 2:6634677/1‑150 (MQ=255)
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CAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCAC > SRR18135100.7779589/1‑151 (MQ=60)
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AGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACT < SRR18135100.8040530/151‑1 (MQ=60)
AGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACT > SRR18135100.5453816/1‑151 (MQ=60)
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TGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTAT > SRR18135100.10786770/1‑151 (MQ=60)
GCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATC < SRR18135100.3534576/151‑1 (MQ=60)
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CCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCC > SRR18135100.6671905/1‑151 (MQ=60)
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CGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTG > SRR18135100.1759276/1‑151 (MQ=60)
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TGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCC > SRR18135100.3074541/1‑151 (MQ=60)
CGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTC > SRR18135100.6717392/1‑151 (MQ=60)
GCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCG < SRR18135100.1040914/151‑1 (MQ=60)
GCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCG > SRR18135100.483410/1‑151 (MQ=60)
CTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGG > SRR18135100.5139305/1‑151 (MQ=60)
TGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGA > SRR18135100.6314162/1‑151 (MQ=60)
TGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGA > SRR18135100.3364233/1‑151 (MQ=60)
TGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGA < SRR18135100.9919638/151‑1 (MQ=60)
TCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGC > SRR18135100.7493920/1‑151 (MQ=60)
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TGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGC > SRR18135100.3807513/1‑151 (MQ=60)
TGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGC > SRR18135100.967872/1‑151 (MQ=60)
GTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCT < SRR18135100.6212499/151‑1 (MQ=60)
CTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCG > SRR18135100.8954989/1‑151 (MQ=60)
CTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCG < SRR18135100.17778/151‑1 (MQ=60)
CTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCG > SRR18135100.8954923/1‑151 (MQ=60)
CTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGAT > SRR18135100.6766597/1‑151 (MQ=60)
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TCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAGATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTC > SRR18135100.427760/1‑151 (MQ=60)
CATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCT > SRR18135100.7951153/1‑151 (MQ=60)
ATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTG > SRR18135100.7987454/1‑151 (MQ=60)
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CGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGA > SRR18135100.1702969/1‑151 (MQ=60)
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GGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAA < SRR18135100.1710114/151‑1 (MQ=60)
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ATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGG > SRR18135100.5617232/1‑151 (MQ=60)
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GCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCCG < SRR18135100.4271657/151‑1 (MQ=60)
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GCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTCCTTGCCG < SRR18135100.6955896/151‑1 (MQ=60)
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GGTGGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGGGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCCG > NC_008463/3281327‑3281626
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
