Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
256 |
520.0 |
22514234 |
99.3% |
22356634 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,885,933 |
G→C |
G71G (GGG→GGC) |
gcvH → |
glycine cleavage system protein GcvH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,885,933 | 0 | G | C | 100.0%
| 1990.3
/ NA
| 511 | G71G (GGG→GGC) | gcvH | glycine cleavage system protein GcvH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (261/250); total (261/250) |
Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
CCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTG > NC_008463/2885785‑2886080
|
tCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggt > 2:2360270/1‑151 (MQ=255)
ggCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtgg > 2:87086/1‑151 (MQ=255)
ggCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtgg > 2:4651650/1‑151 (MQ=255)
cATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTa < 1:4773758/151‑1 (MQ=255)
cATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTa > 2:5347319/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCGACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGa < 1:6142573/151‑1 (MQ=255)
ccGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 1:9346364/151‑1 (MQ=255)
ccGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTGGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 2:409560/151‑1 (MQ=255)
cGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATc < 1:906901/151‑1 (MQ=255)
gCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCa > 1:8339767/1‑151 (MQ=255)
ccTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCaa < 1:7316185/151‑1 (MQ=255)
tACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGGAGCGATCAacg < 1:6299561/151‑1 (MQ=255)
aCGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacga < 1:8570531/151‑1 (MQ=255)
cGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgac < 1:10038869/151‑1 (MQ=255)
gCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGGTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgacg < 2:9075857/151‑1 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc > 2:3925787/1‑151 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc > 1:5102202/1‑151 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc > 1:5044183/1‑151 (MQ=255)
cccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGAGGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgc < 2:10260728/151‑1 (MQ=255)
cccggACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGGTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGGGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgcg < 2:2119087/148‑1 (MQ=255)
aCGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGcc > 2:1836659/1‑151 (MQ=255)
cGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCg > 1:10258070/1‑151 (MQ=255)
cccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCTAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGa < 1:5422481/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGAc < 1:1211816/151‑1 (MQ=255)
cTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACg > 2:1375410/1‑151 (MQ=255)
cGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGcc > 1:10424572/1‑151 (MQ=255)
ggTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGccc > 2:956058/1‑151 (MQ=255)
gTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGcccc > 2:8537405/1‑151 (MQ=255)
gACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCgg < 2:2854405/151‑1 (MQ=255)
aCGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCTAGGCCGCCAGCAACATCCTGTTGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGa > 1:2353792/1‑151 (MQ=255)
tGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCt > 1:9293033/1‑151 (MQ=255)
aTTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTc > 2:6592345/1‑151 (MQ=255)
cGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAAc > 1:9204178/1‑151 (MQ=255)
cGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAAc < 2:3737413/151‑1 (MQ=255)
gCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCATGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAg > 2:10095355/1‑151 (MQ=255)
gCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGGCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAg > 2:5764611/1‑151 (MQ=255)
cAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAgg > 1:4095666/1‑151 (MQ=255)
aGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGa < 2:1063767/151‑1 (MQ=255)
tGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGAccc < 2:1976715/151‑1 (MQ=255)
gCCGGAACTCGGCTAACACGCCGCCGGCAGTGACGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCa > 1:11025804/1‑151 (MQ=255)
gCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCAGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCa > 2:9740644/1‑151 (MQ=255)
ggAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTc > 2:1534192/1‑151 (MQ=255)
gAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCg < 2:3026302/151‑1 (MQ=255)
tCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGa < 2:6993729/151‑1 (MQ=255)
gCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGc > 1:3045933/1‑151 (MQ=255)
cGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc > 1:8172786/1‑151 (MQ=255)
gAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCt < 1:8693759/151‑1 (MQ=255)
gAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCt > 1:7697692/1‑151 (MQ=255)
gAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCt < 2:8183457/151‑1 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTg > 2:5059813/1‑151 (MQ=255)
cacGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGt < 2:7254338/151‑1 (MQ=255)
ccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccg > 1:9617542/1‑151 (MQ=255)
ccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccg < 1:10948554/151‑1 (MQ=255)
cgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgc > 2:2578869/1‑151 (MQ=255)
cAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttc < 2:7728298/151‑1 (MQ=255)
cAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttc > 2:8370432/1‑151 (MQ=255)
aGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttcc < 1:5663779/151‑1 (MQ=255)
tGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGc > 1:3264713/1‑151 (MQ=255)
tGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGc < 1:4607186/151‑1 (MQ=255)
ggCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGcc < 1:2245907/151‑1 (MQ=255)
ggCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGcc < 2:2645964/151‑1 (MQ=255)
gCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCg < 1:10740100/151‑1 (MQ=255)
cGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGa > 1:5998946/1‑151 (MQ=255)
tGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGc > 1:654916/1‑151 (MQ=255)
gCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCCACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTGCCGTCCGGCCGACGcc > 2:3415552/1‑151 (MQ=255)
cTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCg > 1:2868053/1‑151 (MQ=255)
cTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCg < 1:9798993/151‑1 (MQ=255)
tGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCgg > 2:7767165/1‑151 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:1742838/151‑1 (MQ=255)
gAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgcg > 2:1619080/1‑151 (MQ=255)
gTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGcc < 1:3252834/151‑1 (MQ=255)
cGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTg < 1:6775186/151‑1 (MQ=255)
ggTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTgg < 1:6997985/151‑1 (MQ=255)
ggTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTgg > 2:5930104/1‑151 (MQ=255)
tCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGa > 1:9931654/1‑151 (MQ=255)
ggCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAg > 1:1365867/1‑151 (MQ=255)
ccgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgct > 1:5907495/1‑151 (MQ=255)
ccgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgct > 1:7394871/1‑151 (MQ=255)
cgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGACAAgctg > 2:6146648/1‑151 (MQ=255)
cgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgctg < 1:3522976/151‑1 (MQ=255)
gccAGCAACATCCTGAGGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgctgc < 2:10872592/151‑1 (MQ=255)
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TGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGG > SRR18135074.9129075/1‑151 (MQ=60)
TGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGG > SRR18135074.9128375/1‑151 (MQ=60)
TGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGG > SRR18135074.9128883/1‑151 (MQ=60)
GGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACCTCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGTCGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGC > SRR18135074.1834987/1‑151 (MQ=60)
GGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGC < SRR18135074.1762045/151‑1 (MQ=60)
GTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCC < SRR18135074.7391238/151‑1 (MQ=60)
GTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCC < SRR18135074.3266041/151‑1 (MQ=60)
TCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCT < SRR18135074.389473/151‑1 (MQ=60)
CGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTG > SRR18135074.9020704/1‑151 (MQ=60)
CGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTG < SRR18135074.6801788/151‑1 (MQ=60)
GGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGG < SRR18135074.7025324/151‑1 (MQ=60)
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TCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGA > SRR18135074.9968328/1‑151 (MQ=60)
CAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAA > SRR18135074.10686594/1‑151 (MQ=60)
AAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGACA > SRR18135074.3418817/1‑151 (MQ=60)
AAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAA > SRR18135074.3413502/1‑151 (MQ=60)
AAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAA < SRR18135074.4097658/151‑1 (MQ=60)
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GGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAG > SRR18135074.1371663/1‑151 (MQ=60)
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CAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGAC < SRR18135074.5026335/151‑1 (MQ=60)
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ACCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTGCT > NC_008463/2885784‑2886082
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
