Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
256 |
507.2 |
22121016 |
99.2% |
21944047 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 266 total aligned reads displayed.
GCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGC‑CTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG > NC_008463/791711‑792004
|
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CGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgc > SRR18135078.3110716/1‑149 (MQ=60)
GGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgct > SRR18135078.96449/1‑148 (MQ=60)
GGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgct < SRR18135078.1257282/151‑4 (MQ=60)
CGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGG > SRR18135078.750699/1‑151 (MQ=60)
CGGGTCGCGGAGAAGCCGCCGAAAAGCGCCGCGCAAAAGGTCGCGGTGATCGGCATCCACCAGGCCGGCGCAGCCAATCTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGG < SRR18135078.4337552/151‑1 (MQ=60)
GGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgctggtc > SRR18135078.1967506/1‑144 (MQ=60)
GGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgctggtc > SRR18135078.1967248/1‑144 (MQ=60)
GGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgctggtc < SRR18135078.5047023/151‑8 (MQ=60)
GTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgctggtct < SRR18135078.4658404/151‑9 (MQ=60)
TCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgctggtctg < SRR18135078.3939901/151‑10 (MQ=60)
CGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCgctggtctgc < SRR18135078.8942141/151‑11 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAACAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCT < SRR18135078.6990396/151‑1 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCCGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCT > SRR18135078.9053440/1‑151 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCT > SRR18135078.5876056/1‑151 (MQ=60)
CGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCT > SRR18135078.1629742/1‑151 (MQ=60)
GTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGG > SRR18135078.10873601/1‑151 (MQ=60)
GTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGG > SRR18135078.8117808/1‑151 (MQ=60)
GTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGG > SRR18135078.1173275/1‑151 (MQ=60)
TGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGA < SRR18135078.5932771/151‑1 (MQ=60)
GATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAA < SRR18135078.6783684/151‑1 (MQ=60)
GATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAA > SRR18135078.431557/1‑151 (MQ=60)
TGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCACTTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAG < SRR18135078.8897907/151‑1 (MQ=60)
TGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAG > SRR18135078.1060232/1‑151 (MQ=60)
GCTGCCGAATAGCGCCGCGCAATTTGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTTTGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGC < SRR18135078.6076991/151‑1 (MQ=60)
GCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGC < SRR18135078.567086/151‑1 (MQ=60)
GCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGC > SRR18135078.1855517/1‑151 (MQ=60)
GCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGC > SRR18135078.1855739/1‑151 (MQ=60)
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GCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGAT < SRR18135078.7886128/151‑1 (MQ=60)
GCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGAT < SRR18135078.687698/151‑1 (MQ=60)
CGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGT < SRR18135078.1595674/151‑1 (MQ=60)
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GAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTC > SRR18135078.563563/1‑151 (MQ=60)
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AAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCG < SRR18135078.1613422/151‑1 (MQ=60)
AGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGG < SRR18135078.3780845/151‑1 (MQ=60)
GCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACG < SRR18135078.7691258/151‑1 (MQ=60)
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GCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACG < SRR18135078.2502222/151‑1 (MQ=60)
CCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGC > SRR18135078.6277011/1‑151 (MQ=60)
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GCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCG < SRR18135078.693993/151‑1 (MQ=60)
CGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGG > SRR18135078.2917409/1‑151 (MQ=60)
CGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGG > SRR18135078.8799186/1‑151 (MQ=60)
GCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGC < SRR18135078.2762967/151‑1 (MQ=60)
GCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGC > SRR18135078.6940041/1‑151 (MQ=60)
ctttttcaagcacaacacgccatccgagattcgtgaccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT < SRR18135078.5670681/79‑1 (MQ=60)
cattcccaaccccaagacgccaaccgagattcgtgaccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT < SRR18135078.131625/79‑1 (MQ=60)
CAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT < SRR18135078.3871028/151‑1 (MQ=60)
CAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT > SRR18135078.4294097/1‑151 (MQ=60)
CAATGGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT < SRR18135078.4340201/151‑1 (MQ=60)
AATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTG > SRR18135078.5392674/1‑151 (MQ=60)
AATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTG > SRR18135078.7229953/1‑151 (MQ=60)
AATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCAGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTG > SRR18135078.1696007/1‑151 (MQ=60)
ATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGC > SRR18135078.2877353/1‑151 (MQ=60)
ATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGC < SRR18135078.630067/151‑1 (MQ=60)
TGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGC > SRR18135078.7173324/1‑151 (MQ=60)
GGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGCCATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCC > SRR18135078.7298554/1‑151 (MQ=60)
GGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCC > SRR18135078.7298443/1‑151 (MQ=60)
GTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCT > SRR18135078.7429434/1‑151 (MQ=60)
TCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTG < SRR18135078.4040732/151‑1 (MQ=60)
TCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTG > SRR18135078.8020525/1‑151 (MQ=60)
CGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACCTCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGC > SRR18135078.5337895/1‑151 (MQ=60)
CGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGC < SRR18135078.1454927/151‑1 (MQ=60)
CGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGC > SRR18135078.6447582/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG > SRR18135078.7663833/1‑151 (MQ=60)
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CCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGAC > SRR18135078.5975698/1‑151 (MQ=60)
CCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGAC > SRR18135078.5903978/1‑151 (MQ=60)
CAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACC > SRR18135078.740673/1‑151 (MQ=60)
CAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACC > SRR18135078.1033512/1‑151 (MQ=60)
CAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACC > SRR18135078.3617744/1‑151 (MQ=60)
CAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGACGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGCCGGACGACC > SRR18135078.10949652/1‑151 (MQ=60)
AGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCT > SRR18135078.9270324/1‑151 (MQ=60)
AGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCT > SRR18135078.9394055/1‑151 (MQ=60)
GGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTC < SRR18135078.9271565/151‑1 (MQ=60)
GGCGAACCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCAGGAAAGCGATGGCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTC < SRR18135078.9919719/151‑1 (MQ=60)
CGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGC > SRR18135078.331783/1‑151 (MQ=60)
GATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCC > SRR18135078.4238631/1‑151 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTAC < SRR18135078.929978/151‑1 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTAC < SRR18135078.888466/151‑1 (MQ=60)
CTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACG > SRR18135078.6057065/1‑151 (MQ=60)
TCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGT < SRR18135078.7157499/151‑1 (MQ=60)
CGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTG > SRR18135078.10852541/1‑151 (MQ=60)
CCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGAT > SRR18135078.2135683/1‑151 (MQ=60)
CCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGAT < SRR18135078.3016338/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGAT < SRR18135078.3014509/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGAG > SRR18135078.6589081/1‑151 (MQ=60)
CAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATC > SRR18135078.1941157/1‑151 (MQ=60)
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CAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATC > SRR18135078.2595735/1‑151 (MQ=60)
AGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCT > SRR18135078.6650776/1‑151 (MQ=60)
GCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTA < SRR18135078.7779134/151‑1 (MQ=60)
GCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTA > SRR18135078.5746365/1‑151 (MQ=60)
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AAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTC < SRR18135078.7607494/151‑1 (MQ=60)
AGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGCCCTCGCCTACGTGATCTACACCTCC < SRR18135078.8113629/151‑1 (MQ=60)
AGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCC > SRR18135078.778605/1‑151 (MQ=60)
GTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG > SRR18135078.9284570/1‑151 (MQ=60)
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GCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGC‑CTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG > NC_008463/791711‑792004
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |