Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
492.8 |
21425088 |
99.3% |
21275112 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
1,271,763 |
Δ1 bp |
intergenic (+20/+69) |
PA14_RS05965 → / ← PA14_RS05970 |
YidB family protein/aldo/keto reductase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 1,271,761 | 0 | G | . | 100.0%
| 2024.2
/ NA
| 408 | intergenic (+18/+71) | PA14_RS05965/PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (237/171); total (237/171) |
Only 100 of 434 total aligned reads displayed.
GGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTC > NC_008463/1271612‑1271906
|
gAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCgg > 2:4000670/1‑150 (MQ=255)
tCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCggagc > 1:2781255/1‑147 (MQ=255)
cAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCggagcg < 1:4562115/150‑5 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCgg > 2:2775027/1‑150 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCgg > 1:3090081/1‑150 (MQ=255)
gCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATgc‑ggagcgga < 1:2231280/150‑1 (MQ=255)
ccAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAt < 2:4662973/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGCCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAg < 2:4382595/150‑1 (MQ=255)
ggCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGcc < 2:8646673/150‑1 (MQ=255)
cGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgc > 2:5121022/1‑150 (MQ=255)
aGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGa > 2:1368468/1‑150 (MQ=255)
aGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGa > 1:9463174/1‑150 (MQ=255)
cggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 1:8556625/150‑1 (MQ=255)
cggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 2:4294693/150‑1 (MQ=255)
gcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg < 2:8896659/150‑1 (MQ=255)
ccGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGt < 1:9114054/150‑1 (MQ=255)
cGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCTGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGtt > 2:8015541/1‑150 (MQ=255)
gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTa > 2:7586002/1‑150 (MQ=255)
gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTa > 2:10456282/1‑150 (MQ=255)
aaCACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTag > 2:6711751/1‑149 (MQ=255)
aaCACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAt > 2:6124787/1‑150 (MQ=255)
acacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATc > 2:489196/1‑150 (MQ=255)
acacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATc < 2:9194076/150‑1 (MQ=255)
tGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTc > 1:10663334/1‑150 (MQ=255)
agcagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCa > 1:9039930/1‑150 (MQ=255)
gcagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCAc < 1:7099531/150‑1 (MQ=255)
gcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCTGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCa > 2:2108557/1‑150 (MQ=255)
gcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCa > 1:4533246/1‑150 (MQ=255)
gcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCa > 1:4433579/1‑150 (MQ=255)
tgctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACg < 1:2574026/150‑1 (MQ=255)
gctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgg < 2:5524442/150‑1 (MQ=255)
ctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACggg > 1:10018296/1‑150 (MQ=255)
ccGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCCACGGGGCg > 2:1822701/1‑150 (MQ=255)
ggAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGGTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAg > 1:4047201/1‑150 (MQ=255)
gAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAgg < 1:9256688/150‑1 (MQ=255)
aaCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgc > 1:6591202/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgc > 1:5023469/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGGTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgcc > 1:6095533/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGAGGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgcc > 2:6989567/1‑150 (MQ=255)
ggTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgccgcc < 1:8882339/150‑1 (MQ=255)
gTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGccc > 2:5989909/1‑150 (MQ=255)
tCAACAAGCTGACGCCGGACGGGCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCt > 1:3858995/1‑150 (MQ=255)
tCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTGTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATTGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCt < 2:8822728/150‑1 (MQ=255)
acaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGa < 1:2024883/150‑1 (MQ=255)
acaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGa > 1:802811/1‑150 (MQ=255)
caaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGAc < 2:9015678/150‑1 (MQ=255)
aGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACCTCGGTTCGCTGCCGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGAGACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGGGGCCGCCCTCGACgg > 1:685374/1‑150 (MQ=255)
cTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTCAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTCTCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCa > 1:8339014/1‑150 (MQ=255)
ccGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGCTAGCCGCGATTCGGTTTTCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAgggcgg > 2:1599964/1‑150 (MQ=255)
ccGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcgg < 1:9702323/150‑1 (MQ=255)
gCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCCATAg > 1:8668934/1‑150 (MQ=255)
gCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 2:1481056/1‑150 (MQ=255)
gCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGGTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 2:3196180/1‑150 (MQ=255)
cAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggc > 1:24360/1‑150 (MQ=255)
aGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGGCGGTCACTAggcg > 2:5259105/1‑150 (MQ=255)
ggCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgc < 1:1543332/150‑1 (MQ=255)
ccgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggc > 1:10167310/1‑150 (MQ=255)
gcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgc > 2:9469204/1‑150 (MQ=255)
gcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgc > 1:7776854/1‑150 (MQ=255)
gcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgc > 1:670807/1‑150 (MQ=255)
cAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgct < 2:8467232/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACTGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGgcgctggcgctg < 1:10331644/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGgcgctggcgctg > 2:1147374/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAgg > 2:717172/1‑150 (MQ=255)
ccTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGc > 1:2383892/1‑150 (MQ=255)
ggACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGt < 2:10549404/150‑1 (MQ=255)
ggACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGt > 2:3918891/1‑150 (MQ=255)
aCATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTgg > 1:1826491/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGAt > 2:10260091/1‑150 (MQ=255)
ggTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCGCCTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGAgcgc > 2:7285674/1‑150 (MQ=255)
tgctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcg < 2:7799976/150‑1 (MQ=255)
gctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgt > 1:7303936/1‑150 (MQ=255)
gctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgt < 1:1235533/150‑1 (MQ=255)
gctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgt < 1:6194943/150‑1 (MQ=255)
ctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtc < 1:364137/150‑1 (MQ=255)
ctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtc > 2:5817661/1‑150 (MQ=255)
ctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtc < 1:5713473/150‑1 (MQ=255)
tgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtcg > 1:4949268/1‑150 (MQ=255)
cgcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGc > 2:271366/1‑150 (MQ=255)
cgcTTCAGCTAAGGATTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCtt < 1:7560241/150‑1 (MQ=255)
gcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTc < 2:10045944/150‑1 (MQ=255)
tCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAgg < 2:2213936/150‑1 (MQ=255)
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GAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGC < SRR18135075.9293941/151‑1 (MQ=60)
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CTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTGTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGC > SRR18135075.4481489/1‑151 (MQ=60)
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CGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCGTCGA > SRR18135075.6864433/1‑151 (MQ=60)
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GTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCGTCGA > NC_008463/1271615‑1271911
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |