Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
492.8 |
21425088 |
99.3% |
21275112 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,051,401 |
T→C |
N373D (AAC→GAC) |
PA14_RS13990 ← |
SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,051,401 | 0 | T | C | 100.0%
| 1853.8
/ NA
| 468 | N373D (AAC→GAC) | PA14_RS13990 | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (242/226); total (242/226) |
Only 100 of 491 total aligned reads displayed.
AGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGC > NC_008463/3051254‑3051546
|
aGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTCGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga > 1:10614609/1‑150 (MQ=255)
aGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga < 1:7391708/150‑1 (MQ=255)
gCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgag < 1:4294783/150‑1 (MQ=255)
cGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgagg < 2:4124391/150‑1 (MQ=255)
gtgtGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggt > 1:7092401/1‑150 (MQ=255)
tgtgCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggtt < 2:7717354/150‑1 (MQ=255)
aGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACtc > 2:8722790/1‑149 (MQ=255)
ggCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACtcg < 1:6562036/150‑3 (MQ=255)
ggCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTg > 1:856090/1‑150 (MQ=255)
gcgcTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTgg < 1:163769/150‑1 (MQ=255)
cgcTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGgc < 1:2987946/150‑1 (MQ=255)
ctcctcAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGgcgc > 2:1085582/1‑150 (MQ=255)
tcAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCt < 1:1542613/150‑1 (MQ=255)
cAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTg > 1:6289310/1‑150 (MQ=255)
aaatcaatcaGTGACGCCCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGATAGGACCTTCCAGCGAACCGTGTCGAGCAGGGTGTTGTTGCGTGCGTAGAGCCAGAGCAGGACGAGGTAGAACTCGTAGAGCGTGGCGAGGCTga > 2:5383972/3‑149 (MQ=255)
aGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGc > 2:9493200/1‑150 (MQ=255)
gATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGcc > 1:2006839/1‑150 (MQ=255)
tCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCgg > 2:10293923/1‑150 (MQ=255)
tCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCgg > 1:7595400/1‑150 (MQ=255)
tCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCgg > 1:7665208/1‑150 (MQ=255)
ccATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGc < 2:5751822/150‑1 (MQ=255)
cATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGTGCGTGGCGCGGCTGCCGGcc < 2:6904980/150‑1 (MQ=255)
cATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGcc > 2:8882328/1‑150 (MQ=255)
cATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGcc < 1:4175247/150‑1 (MQ=255)
cATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGGTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGcc > 2:10208789/1‑150 (MQ=255)
aTGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCa < 1:6769101/150‑1 (MQ=255)
aTGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCa > 1:2704477/1‑150 (MQ=255)
tGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAg > 1:4465371/1‑150 (MQ=255)
aGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCt > 1:3842860/1‑150 (MQ=255)
gTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCtc > 2:1540973/1‑149 (MQ=255)
gTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCtc < 2:438714/150‑2 (MQ=255)
gTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCtc < 2:6619759/150‑2 (MQ=255)
gACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGa < 2:921183/150‑1 (MQ=255)
gACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtct > 2:3634726/1‑150 (MQ=255)
gACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtct < 2:8090463/150‑1 (MQ=255)
aCGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtctc < 2:3416826/150‑1 (MQ=255)
aCGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTtctc > 2:1981465/1‑150 (MQ=255)
gggCGCCGTTCAGGTAGGAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGGACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGc < 2:7213089/150‑1 (MQ=25)
gcgcCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTg < 2:116498/150‑1 (MQ=255)
cgcCGTTCAGGTAGTAGGCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTgg < 2:10510083/150‑1 (MQ=255)
ccGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcg < 1:309455/150‑1 (MQ=255)
gTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTggcggc < 1:8725778/150‑1 (MQ=255)
ttCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGcc < 2:1931186/150‑1 (MQ=255)
ggTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGc > 2:7828642/1‑150 (MQ=255)
tagtagTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTg > 2:6242498/1‑150 (MQ=255)
agtagtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGa > 1:4581030/1‑150 (MQ=255)
gtagtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGag > 1:5613325/1‑149 (MQ=255)
tagtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAtc < 1:8037435/150‑1 (MQ=255)
gtCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAtctc < 2:991993/150‑1 (MQ=255)
cGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCgg < 2:8526149/150‑1 (MQ=255)
cGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGc < 2:2968608/150‑1 (MQ=255)
cGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGc < 1:1010400/150‑1 (MQ=255)
cGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGc > 2:9746168/1‑150 (MQ=255)
gACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCt > 1:2559686/1‑150 (MQ=255)
ccGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCa > 1:2179288/1‑150 (MQ=255)
cgTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCa > 1:4728544/1‑150 (MQ=255)
ggACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCt < 2:3972520/150‑1 (MQ=255)
cTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGc > 2:6778999/1‑150 (MQ=255)
ttCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGcc < 2:1727257/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCt > 1:10224433/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCt < 2:5506111/150‑1 (MQ=255)
ccAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTc > 1:6078523/1‑150 (MQ=255)
gCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGc < 1:2326278/150‑1 (MQ=255)
tACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCAc > 2:214265/1‑150 (MQ=255)
aCCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACg > 1:10015751/1‑150 (MQ=255)
aCCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACg > 1:5890440/1‑150 (MQ=255)
aCCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACg < 2:7992633/150‑1 (MQ=255)
ccGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACgg > 1:10500212/1‑150 (MQ=255)
ccGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACgg > 2:7030089/1‑150 (MQ=255)
cGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGc < 1:2119499/150‑1 (MQ=255)
cGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGc < 2:7406866/150‑1 (MQ=255)
gTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGAt < 1:2784592/150‑1 (MQ=255)
tCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATc > 1:2062082/1‑150 (MQ=255)
gTGCAGGGTGTGGGAGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGa < 1:3190367/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAg > 2:2642231/1‑150 (MQ=255)
gCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAgg < 1:5535069/150‑1 (MQ=255)
cAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgc < 2:7567639/150‑1 (MQ=255)
aGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgcg > 1:6490347/1‑150 (MQ=255)
aGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgcg > 1:3382189/1‑150 (MQ=255)
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CATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCA < SRR18135075.4193347/151‑1 (MQ=60)
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CATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCA < SRR18135075.10245913/151‑1 (MQ=60)
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TACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACG > SRR18135075.10055834/1‑151 (MQ=60)
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CAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCG > SRR18135075.3396849/1‑151 (MQ=60)
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CCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACC < SRR18135075.7794381/151‑1 (MQ=60)
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GCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCG > SRR18135075.4306263/1‑151 (MQ=60)
CCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGC > SRR18135075.10297780/1‑151 (MQ=60)
GGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGC > SRR18135075.8598110/1‑151 (MQ=60)
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CGTAGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGC > NC_008463/3051251‑3051551
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |