Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
492.8 |
21425088 |
99.3% |
21275112 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,281,477 |
G→C |
intergenic (‑25/+44) |
katE ← / ← PA14_RS14985 |
catalase HPII/general stress protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,281,477 | 0 | G | C | 99.5%
| 1417.5
/ ‑2.0
| 368 | intergenic (‑25/+44) | katE/PA14_RS14985 | catalase HPII/general stress protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (159/206); total (162/206) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
GGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGGGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTG > NC_008463/3281330‑3281623
|
ggCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATggggcgg < 1:9534079/150‑1 (MQ=255)
ggCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCAACGGTTTACGCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATggggcgg > 2:7728369/1‑150 (MQ=255)
gCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGTGGCGGa > 2:5163111/1‑150 (MQ=255)
gCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGa < 1:8851074/150‑1 (MQ=255)
cGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGAt < 2:1884883/150‑1 (MQ=255)
gTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATg < 1:4635742/150‑1 (MQ=255)
tCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTGGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTc > 2:1415657/1‑150 (MQ=255)
gcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTccc < 2:2750311/150‑1 (MQ=255)
gcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTccc < 2:807320/150‑1 (MQ=255)
cgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCt < 2:9852289/150‑1 (MQ=255)
tAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCt < 1:4230366/150‑1 (MQ=255)
tAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCt > 2:5300097/1‑150 (MQ=255)
aGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTc < 1:9781927/150‑1 (MQ=255)
ggCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTcc < 2:1089733/150‑1 (MQ=255)
ggCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTcc < 1:10461680/150‑1 (MQ=255)
ggCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTcc > 1:7098804/1‑150 (MQ=255)
cTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGcc > 2:3348290/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGccc > 1:588702/1‑150 (MQ=255)
ccAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGcccc > 1:3280270/1‑150 (MQ=255)
cAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCa > 2:10216004/1‑150 (MQ=255)
gTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcac < 2:8277038/150‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCCTCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcact < 2:7834386/150‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcact > 1:1610094/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcactt < 2:4656511/150‑1 (MQ=255)
aGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcacttcac < 1:1118298/150‑1 (MQ=255)
aGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcacttcac < 2:2351177/150‑1 (MQ=255)
aGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcacttcac > 1:409734/1‑150 (MQ=255)
ttGGCTTTGCTGTTCCCACGGTCGACGTAGACGGTGACGGCAGCATGTCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGTTCATGTAAATGGGGCGTAAGCCTCCCTCCTCCGCCCCATACACTTCACTgc > 2:6823694/1‑150 (MQ=255)
tGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgcg < 2:1262117/150‑1 (MQ=255)
gCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGcgcg < 2:7256789/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCgg < 1:5470190/150‑1 (MQ=255)
ggtGCTGGTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGt < 2:10172261/148‑1 (MQ=255)
gTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGt < 1:1704076/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAGTCACTTCACTGCGCGGTTAt > 2:3045802/1‑150 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATc < 2:2704790/150‑1 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATc < 1:6714312/150‑1 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATc < 1:7980797/150‑1 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATc > 1:390303/1‑150 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATc < 1:3036474/150‑1 (MQ=255)
tGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCa < 2:6323752/150‑1 (MQ=255)
tGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCa < 1:3428821/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTTCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCAAGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAg > 2:9183839/1‑150 (MQ=255)
tGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCCGtt < 2:4377303/150‑1 (MQ=255)
tGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGGTTCCTCTCCACCTCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGtt < 2:7623643/150‑1 (MQ=255)
ccACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCCTCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTcc < 2:8314830/150‑1 (MQ=255)
cACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTccc > 1:5084369/1‑150 (MQ=255)
ggTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCccgcc < 2:9102837/150‑1 (MQ=255)
tCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGt < 2:3765837/150‑1 (MQ=255)
tCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGt < 2:1325011/150‑1 (MQ=255)
tCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGt < 1:8279806/150‑1 (MQ=255)
gACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTgg > 1:9908026/1‑150 (MQ=255)
aCGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGc < 1:9156670/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGc < 2:4365229/150‑1 (MQ=255)
ggTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTg < 2:4152928/150‑1 (MQ=255)
gtgtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgc > 2:4063199/1‑150 (MQ=255)
gtgtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgc < 2:4895683/150‑1 (MQ=255)
gtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgcgc > 2:3135481/1‑150 (MQ=255)
tCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCt > 1:1423702/1‑150 (MQ=255)
cGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCCTCGGTTTCCTCTCCTCAACCTGGGCATGAAAATGGGGCGGAGGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTGCCCGCCGTGGCTGCGCTg < 2:2294309/150‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTgg > 1:8384785/1‑150 (MQ=255)
gTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGc > 2:7159922/1‑150 (MQ=255)
gTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGc < 1:9024264/150‑1 (MQ=255)
ccggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCAc < 1:8521255/150‑1 (MQ=255)
cggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCAcc > 2:3854534/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc > 2:9727392/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc > 1:10206815/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc > 1:1982737/1‑150 (MQ=255)
ctgcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTGTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAg < 2:8871293/150‑1 (MQ=255)
gcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGcc < 2:450691/150‑1 (MQ=255)
cgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCt > 1:10650868/1‑150 (MQ=255)
cgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCt > 1:7845541/1‑150 (MQ=255)
gctgctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTc < 2:8450111/150‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAgg > 1:7381050/1‑150 (MQ=255)
gttgttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGcc > 1:6137012/1‑150 (MQ=255)
ttgttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGccc < 1:4591319/150‑1 (MQ=255)
tgttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCg < 1:6502379/150‑1 (MQ=255)
gttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGc < 2:1762521/150‑1 (MQ=255)
gttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGc < 2:5724483/150‑1 (MQ=255)
ttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCt > 1:2927590/1‑150 (MQ=255)
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TCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATC > SRR18135075.2380238/1‑151 (MQ=60)
TCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATC < SRR18135075.2252162/151‑1 (MQ=60)
CTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTT > SRR18135075.1153425/1‑151 (MQ=60)
TCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTC > SRR18135075.1211552/1‑151 (MQ=60)
TCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTC > SRR18135075.1201454/1‑151 (MQ=60)
TCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTC > SRR18135075.562621/1‑151 (MQ=60)
CATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCT < SRR18135075.1463299/151‑1 (MQ=60)
CATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCT > SRR18135075.268374/1‑151 (MQ=60)
CATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCT < SRR18135075.2785976/151‑1 (MQ=60)
ATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTT < SRR18135075.5801665/151‑1 (MQ=60)
TCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTG < SRR18135075.2778196/151‑1 (MQ=60)
CGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGA > SRR18135075.10117836/1‑151 (MQ=60)
GGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAA > SRR18135075.603950/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG < SRR18135075.10003702/151‑1 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG < SRR18135075.1762016/151‑1 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG < SRR18135075.10004269/151‑1 (MQ=60)
TTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTT > SRR18135075.1194841/1‑151 (MQ=60)
TCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTG < SRR18135075.2933891/151‑1 (MQ=60)
CCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGC > SRR18135075.9856670/1‑151 (MQ=60)
CTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCC < SRR18135075.9519429/151‑1 (MQ=60)
CTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCC < SRR18135075.3584066/151‑1 (MQ=60)
TCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCG > SRR18135075.3513782/1‑151 (MQ=60)
TCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCC > SRR18135075.8608373/1‑151 (MQ=60)
TCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCC > SRR18135075.4392094/1‑151 (MQ=60)
TCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCC < SRR18135075.9421377/151‑1 (MQ=60)
CCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCG < SRR18135075.9153763/151‑1 (MQ=60)
CTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGC > SRR18135075.2618471/1‑151 (MQ=60)
CATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTG > SRR18135075.8621320/1‑151 (MQ=60)
CATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTG > SRR18135075.1639734/1‑151 (MQ=60)
CATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGGTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTG < SRR18135075.6767233/151‑1 (MQ=60)
TGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTG > SRR18135075.5710489/1‑151 (MQ=60)
GGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGG > SRR18135075.2852697/1‑151 (MQ=60)
GGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTGTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGG > SRR18135075.4057142/1‑151 (MQ=60)
CATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCG > SRR18135075.3370276/1‑151 (MQ=60)
CATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCG < SRR18135075.6036549/151‑1 (MQ=60)
AAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCT > SRR18135075.2963580/1‑151 (MQ=60)
TGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTT < SRR18135075.799764/151‑1 (MQ=60)
GGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTG < SRR18135075.8374097/151‑1 (MQ=60)
GGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGC > SRR18135075.4939881/1‑151 (MQ=60)
|
GGTGGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGGGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGC > NC_008463/3281327‑3281624
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |