Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
256 |
530.7 |
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22789306 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
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| RA |
NC_008463 |
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T→C |
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| |
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| * | NC_008463 | 4,997,786 | 0 | T | C | 100.0%
| 1948.0
/ NA
| 489 | K173E (AAG→GAG) | PA14_RS22840 | DUF853 family protein |
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Only 100 of 489 total aligned reads displayed.
CGCCCCCGCCCGTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTTGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAACTCCAGGAGGTTGGC > NC_008463/4997638‑4997933
|
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cccgTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGAtc > 1:4506269/1‑151 (MQ=255)
ccgTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGAtct < 2:1374126/151‑1 (MQ=255)
ccgTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGAtct < 1:1141352/151‑1 (MQ=255)
tCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCg < 1:8602756/151‑1 (MQ=255)
ggCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGAt > 1:5497743/1‑151 (MQ=255)
gCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCCGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCTGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGAtt > 2:8935650/1‑151 (MQ=255)
gCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGGTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGAtt < 2:2157745/151‑1 (MQ=255)
cTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGAACTCCGGATTg > 2:1071149/1‑151 (MQ=255)
tCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGt < 2:3559971/151‑1 (MQ=255)
tCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGt < 2:9593204/151‑1 (MQ=255)
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cGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCa > 2:3124720/1‑151 (MQ=255)
ggaggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAg > 1:7844092/1‑151 (MQ=255)
ggaggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAg < 1:8773684/151‑1 (MQ=255)
aggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggt < 1:6548492/151‑1 (MQ=255)
gaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggtgg < 1:7116158/151‑1 (MQ=255)
gaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggtgg < 2:7033841/151‑1 (MQ=255)
tGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGtt < 1:2013891/151‑1 (MQ=255)
tGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGtt > 2:5516757/1‑151 (MQ=255)
gTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGCGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTg > 2:9363451/1‑151 (MQ=255)
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tCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGagca > 2:171721/1‑151 (MQ=255)
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tCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGagca < 2:4319563/151‑1 (MQ=255)
aGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAgcg < 2:1057947/151‑1 (MQ=255)
cagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttc > 2:2531721/1‑151 (MQ=255)
cagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttc < 2:2433445/151‑1 (MQ=255)
cagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttc < 2:4547137/151‑1 (MQ=255)
agggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttca > 2:4079909/1‑151 (MQ=255)
ggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcagg < 2:6882112/151‑1 (MQ=255)
gcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggt < 1:7285447/151‑1 (MQ=255)
ggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtcct < 1:8444208/151‑1 (MQ=255)
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ccGATGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttcaggt < 1:1851888/151‑1 (MQ=255)
ccGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttcaggt < 2:77060/151‑1 (MQ=255)
ccGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttcaggt < 1:11109036/151‑1 (MQ=255)
cGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCcttcaggtccttcaggtc > 2:9275293/1‑151 (MQ=255)
aagaagGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGa > 1:9751203/1‑151 (MQ=255)
aagaagGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTGCAGGTCCTTCAGGTCGa > 1:2226167/1‑151 (MQ=255)
agaagGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGag > 2:9849722/1‑151 (MQ=255)
gaagGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGagc < 1:10713427/151‑1 (MQ=255)
gaagGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGagc < 1:6142983/151‑1 (MQ=255)
tCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAgcagcagca > 2:1902458/1‑151 (MQ=255)
cGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGcagcagcag > 1:1393785/1‑151 (MQ=255)
cGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGcagcagcag < 1:3313487/151‑1 (MQ=255)
cgcCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGcc > 2:9535856/1‑151 (MQ=255)
gcCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCt > 1:7940842/1‑151 (MQ=255)
cccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCtt > 1:5071404/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTc > 1:9264435/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTc > 1:9408736/1‑151 (MQ=255)
tgctgcTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCTGCGCCGTCAGGTCGTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTccc > 1:2283186/1‑151 (MQ=255)
gctgctCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCg > 2:5917673/1‑151 (MQ=255)
ctgctCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCgg < 1:5262006/151‑1 (MQ=255)
ctgctCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCgg > 2:3434077/1‑151 (MQ=255)
cAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGcc < 1:2559676/151‑1 (MQ=255)
cAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGcc > 2:7936500/1‑151 (MQ=255)
cAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGcc > 2:7285150/1‑151 (MQ=255)
tGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTg < 1:5879446/151‑1 (MQ=255)
ggCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGAGTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTgg < 2:8488418/151‑1 (MQ=255)
gCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGa < 2:4985121/151‑1 (MQ=255)
cAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAg < 1:1214187/151‑1 (MQ=255)
gcgcAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGgcggcg < 2:8230042/151‑1 (MQ=255)
cgcAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGa > 1:422176/1‑151 (MQ=255)
agcagcGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACa < 2:7994258/151‑1 (MQ=255)
cagcGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCGTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAgc < 1:3179196/151‑1 (MQ=255)
cGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCctgctg < 1:1295217/151‑1 (MQ=255)
cGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCctgctg > 2:654956/1‑151 (MQ=255)
ggAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTgg < 2:7572829/151‑1 (MQ=255)
ggAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTgg > 1:5670115/1‑151 (MQ=255)
gcaGCGCCGGAGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGc < 1:10494758/149‑1 (MQ=255)
gAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGc < 2:4186952/151‑1 (MQ=255)
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CAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCGTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGC < SRR18135076.3194038/151‑1 (MQ=60)
AGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCG > SRR18135076.6067574/1‑151 (MQ=60)
GCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCTGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGG > SRR18135076.1560019/1‑151 (MQ=60)
CGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCG > SRR18135076.6986796/1‑151 (MQ=60)
CGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCG < SRR18135076.11229544/151‑1 (MQ=60)
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CCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCT > SRR18135076.2192268/1‑151 (MQ=60)
CGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTG < SRR18135076.1301479/151‑1 (MQ=60)
CGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTG < SRR18135076.1869829/151‑1 (MQ=60)
CGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTG < SRR18135076.1301461/151‑1 (MQ=60)
GGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGG > SRR18135076.5696499/1‑151 (MQ=60)
GCAGCGCCGGAGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGC < SRR18135076.10540543/151‑1 (MQ=60)
GAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGTAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGC > SRR18135076.6217992/1‑151 (MQ=60)
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GCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCG > SRR18135076.9230080/1‑151 (MQ=60)
GCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCG > SRR18135076.9230043/1‑151 (MQ=60)
CGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGT < SRR18135076.759837/151‑1 (MQ=60)
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GGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGGTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTC > SRR18135076.984133/1‑151 (MQ=60)
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TCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAACTCCAGGAGGTTGGCCA > SRR18135076.7333790/1‑151 (MQ=60)
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TGCGCCCCCGCCCGTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTTGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAACTCCAGGAGGTTGGCCAG > NC_008463/4997636‑4997936
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |