Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
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256 |
530.7 |
22949956 |
99.3% |
22789306 |
151.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 274 total aligned reads displayed.
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGCCTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGGCA > NC_008463/791722‑792016
|
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCC > SRR18135076.3070888/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCC > SRR18135076.9618968/1‑151 (MQ=60)
GGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCACTTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTG < SRR18135076.1597225/151‑1 (MQ=60)
GGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTG < SRR18135076.3334683/151‑1 (MQ=60)
GTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGACAGCCGCCGCTGCGGCGACAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGG < SRR18135076.8328330/151‑1 (MQ=60)
TGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGA > SRR18135076.138166/1‑151 (MQ=60)
GATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAA < SRR18135076.850062/151‑1 (MQ=60)
CTGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAAGTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAA < SRR18135076.10389668/151‑1 (MQ=60)
ATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAA > SRR18135076.8048997/1‑151 (MQ=60)
ATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAA < SRR18135076.1993377/151‑1 (MQ=60)
ATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAA > SRR18135076.5688232/1‑151 (MQ=60)
TGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAG > SRR18135076.9000839/1‑151 (MQ=60)
TGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAG < SRR18135076.4403204/151‑1 (MQ=60)
TGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAG > SRR18135076.3783387/1‑151 (MQ=60)
GCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGAT > SRR18135076.11158940/1‑151 (MQ=60)
GCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGAT > SRR18135076.7859764/1‑151 (MQ=60)
GCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGAT < SRR18135076.2844508/151‑1 (MQ=60)
CCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATG > SRR18135076.5811757/1‑151 (MQ=60)
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CGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGT < SRR18135076.4757655/151‑1 (MQ=60)
CGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGT > SRR18135076.4791912/1‑151 (MQ=60)
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GAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTC > SRR18135076.1973942/1‑151 (MQ=60)
AAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCC > SRR18135076.4508084/1‑151 (MQ=60)
AAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCGGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCC > SRR18135076.302161/1‑151 (MQ=60)
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AAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCC < SRR18135076.10121663/151‑1 (MQ=60)
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AAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCG < SRR18135076.1122080/151‑1 (MQ=60)
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AGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCAGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGG > SRR18135076.7005768/1‑151 (MQ=60)
GCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGA < SRR18135076.2026064/151‑1 (MQ=60)
GCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGA < SRR18135076.7616460/151‑1 (MQ=60)
GCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGA < SRR18135076.7616461/151‑1 (MQ=60)
CGCCGCGCACTTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGAC < SRR18135076.1692588/151‑1 (MQ=60)
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GCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACG < SRR18135076.5395578/151‑1 (MQ=60)
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CGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCC > SRR18135076.622122/1‑151 (MQ=60)
CGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCC < SRR18135076.1155883/151‑1 (MQ=60)
GCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGTCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCG < SRR18135076.7904654/151‑1 (MQ=60)
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GCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCG < SRR18135076.7904653/151‑1 (MQ=60)
CGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGG > SRR18135076.3119750/1‑151 (MQ=60)
CGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGG > SRR18135076.3120995/1‑151 (MQ=60)
CGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCAGGAAAGCGATGACCCGGACGCCGG > SRR18135076.3114310/1‑151 (MQ=60)
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CAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCT > SRR18135076.4532690/1‑151 (MQ=60)
ATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGC > SRR18135076.5985865/1‑151 (MQ=60)
ATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGC > SRR18135076.4067241/1‑151 (MQ=60)
TTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCG < SRR18135076.2530044/151‑1 (MQ=60)
GTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCT < SRR18135076.892383/151‑1 (MQ=60)
GTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCT < SRR18135076.8502489/151‑1 (MQ=60)
GTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCT > SRR18135076.5147562/1‑151 (MQ=60)
CGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGC > SRR18135076.9835047/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG > SRR18135076.1137769/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG > SRR18135076.3298375/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG > SRR18135076.2648896/1‑151 (MQ=60)
GCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCG > SRR18135076.1340863/1‑151 (MQ=60)
CGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGT > SRR18135076.7090100/1‑151 (MQ=60)
GGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTG > SRR18135076.4298542/1‑151 (MQ=60)
GGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTG > SRR18135076.4383105/1‑151 (MQ=60)
GGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTG > SRR18135076.10167900/1‑151 (MQ=60)
GTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGG < SRR18135076.5854645/151‑1 (MQ=60)
GTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGG > SRR18135076.9772627/1‑151 (MQ=60)
TGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGC > SRR18135076.2823228/1‑151 (MQ=60)
TGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGC < SRR18135076.6152059/151‑1 (MQ=60)
TGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTAGGTGCCGGGGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGC < SRR18135076.8836963/151‑1 (MQ=60)
GATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCC > SRR18135076.2949734/1‑151 (MQ=60)
GATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCC < SRR18135076.7930467/151‑1 (MQ=60)
CGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATC < SRR18135076.5811182/151‑1 (MQ=60)
GGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCG > SRR18135076.10602582/1‑151 (MQ=60)
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GATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCC < SRR18135076.8765816/151‑1 (MQ=60)
GATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCC > SRR18135076.2851970/1‑151 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTAC < SRR18135076.10604981/151‑1 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTAC < SRR18135076.10884959/151‑1 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTAC < SRR18135076.2217437/151‑1 (MQ=60)
CCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCGAC < SRR18135076.2217645/151‑1 (MQ=60)
CTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACG < SRR18135076.9813216/151‑1 (MQ=60)
CTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACG > SRR18135076.1104818/1‑151 (MQ=60)
CTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACG < SRR18135076.9819675/151‑1 (MQ=60)
TCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGT < SRR18135076.10093508/151‑1 (MQ=60)
CGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTG > SRR18135076.1027453/1‑151 (MQ=60)
CGCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTG > SRR18135076.11019168/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGA > SRR18135076.9604036/1‑151 (MQ=60)
CCAGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGAT > SRR18135076.5258318/1‑151 (MQ=60)
AGCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCT > SRR18135076.6088645/1‑151 (MQ=60)
GCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTA < SRR18135076.882417/151‑1 (MQ=60)
GCGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTA > SRR18135076.3396268/1‑151 (MQ=60)
CGCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTAC > SRR18135076.9523834/1‑151 (MQ=60)
GCCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATTTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCGCGCCTACGTGATCTACA > SRR18135076.9906236/1‑151 (MQ=60)
CCGAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACAC > SRR18135076.6791576/1‑151 (MQ=60)
GAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCT > SRR18135076.3807870/1‑151 (MQ=60)
GAAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCT > SRR18135076.4284085/1‑151 (MQ=60)
AAGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTC > SRR18135076.9440087/1‑151 (MQ=60)
AGTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCC > SRR18135076.4719753/1‑151 (MQ=60)
GTGGTCGCGCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCG > SRR18135076.3054126/1‑151 (MQ=60)
ggtcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGC > SRR18135076.4012031/10‑151 (MQ=60)
gtcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCT > SRR18135076.4713481/9‑151 (MQ=60)
gtcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCT > SRR18135076.9579643/9‑151 (MQ=60)
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tcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTC < SRR18135076.7994184/144‑1 (MQ=60)
tcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTC < SRR18135076.6143199/144‑1 (MQ=60)
tcgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTC > SRR18135076.3796092/8‑151 (MQ=60)
cgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCC < SRR18135076.9596817/145‑1 (MQ=60)
cgcgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCC > SRR18135076.4978664/7‑151 (MQ=60)
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cgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCAC > SRR18135076.4223610/5‑151 (MQ=60)
cgctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCAC > SRR18135076.402502/5‑151 (MQ=60)
gctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACC > SRR18135076.1230026/4‑151 (MQ=60)
gctGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACC > SRR18135076.2953204/4‑151 (MQ=60)
|
GCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGCCTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCTACACCTCCGGCTCCACCGGCA > NC_008463/791722‑792016
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
