Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | AC_000091 | 1,413,639 | Δ23,060 bp | [ydaO]–ynaE | 30 genes [ydaO], intR, ydaQ, ydaC, lar, recT, recE, racC, ydaE, kil, sieB, ydaF, ydaG, racR, ydaS, ydaT, ydaU, ydaV, ydaW, rzpR, rzoR, trkG, ynaK, ydaY, ynaA, insH, stfR, tfaR, pinR, ynaE |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | AC_000091 | 1413639 | 1436698 | 23060 | 143 [0] | [0] 140 | [ydaO]–ynaE | [ydaO],intR,ydaQ,ydaC,lar,recT,recE,racC,ydaE,kil,sieB,ydaF,ydaG,racR,ydaS,ydaT,ydaU,ydaV,ydaW,rzpR,rzoR,trkG,ynaK,ydaY,ynaA,insH,stfR,tfaR,pinR,ynaE |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AC_000091 | = 1413638 | 0 (0.000) | 98 (1.040) | 71/126 | 0.1 | 100% | coding (25/936 nt) | ydaO | predicted C32 tRNA thiolase |
? | AC_000091 | 1436699 = | 0 (0.000) | intergenic (‑728/+200) | ynaE/uspF | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
AGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AC_000091/1413524‑1413638 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttgttcaggttgtattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCAT > AC_000091/1436699‑1436787 GAGGCAAACCATGGTGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTT < 2:305951/90‑1 GAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTT < 2:3013072/90‑1 CAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTC < 2:2434458/90‑1 CAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTC > 1:3093895/1‑90 CAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTC < 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GCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTG < 2:2272231/90‑1 CGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGT < 1:2070676/90‑1 CGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGT < 2:3047601/90‑1 GATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTT > 1:1946022/1‑90 ATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTC > 1:3032522/1‑90 TCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCT > 2:354507/1‑90 TCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCT < 2:3289856/90‑1 CGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTT > 2:2840842/1‑90 CGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTT < 1:1818904/90‑1 CGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGGTGTATTGTTCTT > 1:2899937/1‑90 GCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTT < 1:2205203/90‑1 GCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTT > 2:1480170/1‑90 CCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTC > 2:2001234/1‑90 CCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTC < 1:571653/90‑1 TTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTT > 2:3250944/1‑90 TTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTT > 1:982787/1‑90 TCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTA > 1:2391269/1‑90 TTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACT > 1:387818/1‑90 CAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAA < 2:446257/90‑1 AATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAAT > 1:2065506/1‑90 AATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAAT < 1:1065549/90‑1 TATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTT < 1:1005677/90‑1 ATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTG > 2:21051/1‑90 TGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGAT > 1:3213287/1‑90 TGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGAT > 2:524640/1‑90 TGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGAT < 2:1127555/90‑1 TGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGAT > 2:1885777/1‑90 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AC_000091/1436699‑1436787 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |